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上各参与方高效地实现各自的商业价值。 订阅资产 资产市场提供官方发布的镜像、数据、应用、流程资产。您可以查看各类资产的详细介绍和使用方法,并订阅资产至项目中使用。 单击所需的资产名称,查看资产的详细信息。 单击界面右侧“订阅”图标,订阅资产。 图1 订阅资产 订阅的资产将显示在您
id : a30f3afd-3f6d-11eb-868a-fa163e3ddba1 使用本地已填写好的作业模板job.yaml运行分析作业,并修改输入数据路径、描述。 health create job -y D:\job.yaml -i "D:\data\hg19.fa" -d "descript"
本案例介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能复现上述研究成果(https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c00821),并搭建虚拟药物筛选数据库。 图1 药物筛选之旅 父主题: 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选
提供端到端的AI赋能平台加速AI的研发和应用。 提供针对医疗行业的AI自动建模工具。 提供医疗领域专业的预置资产,提升企业的效率。 内置大量生物医疗领域标准分析流程,并结合华为特有的高性能云计算,多样性算力,大数据等技术加速计算过程。 支持十亿节点、百亿边的超大规模图数据库查询,提供适用于基因和生物网络数据的图深度学习算法。
2个参数值。那么,系统将自动生成4个作业并发执行。 对于输出参数,如果镜像启动命令中指定了输出参数,则在设置输出参数时,需要勾选“必传”,并填写“默认值”。 如果输出参数为Directory、File类型,默认值必须以/开头,且不能以/结尾,开头的'/'代表本项目的桶路径。 如果
用参数。 参数确认无误后,单击界面上方“启动作业”按钮,可以直接基于该流程创建分析作业。 克隆作业 克隆已有的分析作业,作业的参数及流程一并克隆到流程设计器中。克隆作业后,请修改作业的输出数据路径,否则会有覆盖原有作业数据风险。 执行克隆操作有两种方式,请选择任一方式执行。 在分
设置完成后,单击“提交”,执行药物虚拟筛选任务。 对于“运行中”的任务,允许取消、强制停止或删除。 图6 运行状态 查看执行结果 药物和蛋白结合能通过热点图呈现,并统计出结合能的均值和标准差。单击热点图,可查看详细的3D分子对接结果、结合能排序、药物注释信息。 同时,基于预置的数据库模板,生成包含药物名称、结合能等信息的数据库。
对于“已取消”、“运行失败”的任务,单击图标,允许修改任务参数,再次提交任务。 图5 运行状态 查看执行结果 药物和蛋白结合能通过热点图呈现,并统计出结合能的均值和标准差。单击热点图,可查看详细的3D分子对接结果、结合能排序、药物注释信息。 在图6中,页面最右侧显示结合能的最大值和最小值,以及对应的列名称、行名称。
“作业状态更新”中可选“选择已有列”或“新建一列”。 选择“选择已有列”时,需要选择已有列名,已有列名必须为string类型,可以搜索到,并且非主键。 并设置是否“清空作业状态更新列”,状态更新列的值为空的数据才会投递作业。 选择“新建一列”,需要输入新建的列名。 图2 设置作业基本信息 定义
您在使用RNA-Seq流程前,请先上传待分析的数据,上传数据方法请参见数据管理。 步骤3:创建分析作业 单击项目名称,进入“项目管理”页面,并选择“工具”页签。 在“RNA-Seq Analysis Based on STAR”流程操作列,单击“启动作业”,在弹出的新建作业页面,填
生成断点记录文件的文件夹,默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_checkpoint。 每个分段上传任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的upload子文件夹下,分段任务执行成功后,对应的断点记录文件会被自动删除;分段任务执行失败或被中断后,下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。
据文件,例如:xxx.R1.fastq.gz和xxx.R2.fastq.gz。 步骤3:创建分析作业 单击项目名称,进入“项目管理”页面,并选择“工具”页签。 单击ngs“操作”列“启动作业”,在弹出的新建作业页面,填写作业信息。“作业名称”、“标签”、和“描述”,设置“输出路径
片段生长:选择保留部分片段后,会在您删除的方向进行补充,生成新颖的小分子。 从头生成:通过指定的口袋从头生成小分子。 选定设计方式后,上传靶点结构,并配置其他参数。 图1 查看配置页面 靶点结构:选择靶点结构文件,仅支持PDB格式。若文件中包含多个受体,则默认只处理第一个。 单击下一步,配
生成断点记录文件的文件夹,默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_checkpoint。 每个分段复制任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的copy子文件夹下,分段任务执行成功后,对应的断点记录文件会被自动删除;分段任务执行失败或被中断后,下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。
生成断点记录文件的文件夹,默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_checkpoint。 每个分段上传任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的copy子文件夹下,分段任务执行成功后,对应的断点记录文件会被自动删除;分段任务执行失败或被中断后,下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。
执行分析作业 创建分析作业 登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 流程”页签,单击NGS流程行的“启动作业”。 请参考配置输入和依赖数据章节,设置NGS流程数输入数据。 在新建作业页面,填写作业信息。 基本信息:包含作业名称、标签、描述。 输出路径:存放输出结果的路径,格
tar、health-macOS-x86_64.tar.sha256 本页面命令行工具下载后,在使用时,需用到您注册华为账号并开通华为云时提供的用户名等信息,用于登录并操作EIHealth平台的项目、数据等资产。这些信息的处理将遵循您已接收的《华为云用户协议》及《隐私政策声明》约束。
购买计算资源 可用区:选择可用区。 计算规格:分为通用计算增强型、内存优化型、BMS计算型、磁盘增强型、超大内存型、GPU加速型,根据需求选择类型,并勾选规格名称。 系统盘:40GB,不可修改。 数据盘:数据盘可用于在创建作业时,开启“本地盘加速”,默认100GB,可按使用需要进行扩增。
生成断点记录文件的文件夹,默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_checkpoint。 每个分段下载任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的down子文件夹下,分段任务执行成功后,对应的断点记录文件会被自动删除;分段任务执行失败或被中断后,下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。
current file is: 52.56MB Folder number is: 4 File number is: 8 指定“limit”参数,并只列举项目中的3个对象。 health ls --limit 3 # 返回结果如下 Folder list: /src1/ /src2/