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AK/SK(Access Key ID/Secret Access Key)即访问密钥,包含访问密钥ID(AK)和秘密访问密钥(SK)两部分,华为云通过AK识别用户的身份,通过SK对请求数据进行签名验证,用于确保请求的机密性、完整性和请求者身份的正确性。 登录华为云管理控制台,鼠标指向页面右上角的用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。
算、存储、分析和AI能力支持,让科研过程标准化、可执行。 基因组测序是新型冠状病毒疑似病例确诊的病原学证据之一,基于基因组分析结果,可准确识别病毒基因特性,监测病毒变异趋势,在疫情防控、疾病诊治、药物筛选、疫苗设计与药物研发等工作中发挥着不可替代的基础性的作用;也将支撑病毒溯源、
使用Docking Summary流程 分子对接(molecular docking )是分子模拟的重要方法之一,其本质是两个或多个分子之间的识别过程,其过程涉及分子之间的空间匹配和能量匹配。分子对接方法在药物设计、材料设计等领域有广泛的应用。 在药物分子产生药效反应的过程中,药物分
AK/SK(Access Key ID/Secret Access Key)即访问密钥,包含访问密钥ID(AK)和秘密访问密钥(SK)两部分,华为云通过AK识别用户的身份,通过SK对请求数据进行签名验证,用于确保请求的机密性、完整性和请求者身份的正确性。 登录华为云管理控制台,鼠标指向页面右上角的用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。
AK/SK(Access Key ID/Secret Access Key)即访问密钥,包含访问密钥ID(AK)和秘密访问密钥(SK)两部分,华为云通过AK识别用户的身份,通过SK对请求数据进行签名验证,用于确保请求的机密性、完整性和请求者身份的正确性。 您在使用命令行工具时,需要使用AK/SK进行身份验证。
AK/SK(Access Key ID/Secret Access Key)即访问密钥,包含访问密钥ID(AK)和秘密访问密钥(SK)两部分,华为云通过AK识别用户的身份,通过SK对请求数据进行签名验证,用于确保请求的机密性、完整性和请求者身份的正确性。 操作步骤 登录华为云管理控制台,鼠标指向页
创建数据库模板 创建数据库前,请先在“数据库 > 模板”页签创建数据库模板,模板中数据库表列的数目为固定,行数可按需设置,不同列之间,可通过列信息进行识别。列信息包含列名、描述、类型、允许为空、是否主键、是否可查询、是否唯一、提示和操作信息。单击添加列可新增一列,最多支持100列。单击操作列的图标可以删除列。
在EIHealth开发环境Notebook中使用命令行工具时,请依据以下步骤配置代理。 打开Notebook,并选择Terminal,打开Notebook的命令行界面。 执行以下命令下载命令行工具,并获取配置Notebook代理所需的域名和端口信息。 示例中下载的版本为Linux ARM 64位。
方式2:使用预置应用搭建NGS流程 将EIHealth平台预置的应用构建成流程,并运行作业。以二代基因组分析流程:fastp,bwa-mem,bamqc,picard-insertsize两个算法为例。 应用是对每个软件的镜像封装,将应用封装好后可以反复利用并也可以让其他人很容易的使用,不用担心复杂的开发环境问题。
v22.10.6,v22.10.0,v22.04.0。 上传安装包:用户直接上传一个Nextflow的安装包。如果选择此方式,您可以单击“点击此处”进入nextflow release进行下载安装包。 图2 选择安装方式 单击“开始安装”。 卸载Nextflow 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。
步骤4:搭建流程、运行作业 进入“工具 > 流程”页面,点击“新建流程”进行新建流程,填写好流程名称,流程版本等信息。 图6 新建流程 将fastqc应用拖拽至画布中,并添加输入参数,操作方法请参见方式2。 参数填写完成后,单击“保存”。并单击“新建作业”创建fastqc作业。 图7 新建作业
择AI框架。 图3 选择AI引擎并新建一个Notebook 新建的Notebook文件将呈现在左侧菜单栏中。 图4 新建文件 新建文件并打开Console Console的本质为Python终端,输入一条语句就会给出相应的输出,类似于Python原生的IDE。 进入Jupyter
安装完成后,输入“yes”。 初始化Anaconda配置并测试安装。 执行以下命令初始化Anaconda配置。 export PATH=~/anaconda3/bin:$PATH source ~/.bashrc 测试安装。 conda -V 查看当前环境列表,并创建新环境参数。 conda env
符的规范来设置参数命令,例如: # 原镜像启动命令 bash -c "source activate my-rdkit-env && python adme.py --file_in ${file-in} --file_out ${dir-out}/adme_info.txt >
查看该作业的相关信息,可以克隆或者删除。如果执行失败的作业,可以在该页面查看失败信息。 图4 作业信息页面 作业信息页面也支持标签修改,点击标签进行修改。 作业执行状态如下所示。 等待中:作业创建成功,等待处理中。等待中的作业支持取消。 运行中:作业创建成功,执行中。可单击作业
Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 mode 是 String 口袋识别的模式:自动、全局、配体、残基。 枚举值: AUTO GLOBAL LIGAND RESIDUES receptor_file 是 ReceptorDrugFileReq
查看作业详情 您可以通过单击作业名称,进入详情页面,查看详细的运行信息。包括状态、标签、描述、创建时间、完成时间、总耗时等。 对于执行失败的作业,鼠标点击作业状态,在弹出的提示框中可以查看“失败信息”和“失败原因”。 作业相关信息 在详情页可以查看作业执行命令、配置参数、流程配置文件、执行日志、报告信息。
包含中文字符,格式为{project-name}/{image-repo}:{image-tag} commands: # docker启动时执行命令 单行命令长度取值范围[0-256],不能包含中文字符,支持多行输入,最多支持300行。
docker镜像地址,取值范围[5-255],不能包含中文字符 commands: # docker启动时执行命令 单行命令长度取值范围[0-256],不能包含中文字符,支持多行输入,最多支持300行。 - 'echo
型和接口等参数:model='fromconfig' # 输出并执行代码:execute=True # 用户不参与修改:user_modify=False (交互式用户修改目前仅支持python解释器或者python脚本下运行) # 用EIFlow投递作业:local_mode=False