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创建Notebook时所需的自定义镜像,依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像,您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。 先连接容器镜像服务,参考步骤1.连接容器镜像服务操作,然后使用如下的镜像地址拉取基础镜像。 # 基础镜像 docker pull swr.cn-north-4.myhuaweicloud
作业清理配置 获取作业配置 设置作业配置 父主题: 系统管理
标,解除引用关系。 图5 解除引用 下载数据 下载数据操作会产生流量费用,计费方式为按需计费,计费详情请参考OBS数据下载费用。 以下操作步骤是在“数据”页面下载数据至本地。您也可以使用命令行工具实现数据的下载。 展开数据文件夹,选择待下载的数据。 单击“操作”列“下载”。 单击
数据归档配置 设置平台数据归档的区域。 在账号下面选择“系统设置”。 图1 选择系统设置 进入系统设置页面,设置数据归档配置区域。 图2 配置数据归档区域 父主题: 系统设置
e-configs/{region_id} 响应示例 无 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题: 系统配置和供应商配置
考虑到数据的安全,服务无法直接获取到用户数据,需要用户开启OBS的公共读授权。 开启公共读权限 开启公共授权,则数据全网可见,所有用户均可访问。 配置公共读可参考配置标准桶策略,将桶策略设置为“公共读”。一般私密数据不建议用此方法。 目前仅支持访问用户个人OBS下的链接,不支持读取其他用户公共读的链接。
查询Nextflow配置详情 功能介绍 查询Nextflow配置详情 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project_id}/nextflow/engines/{id}
调用说明 医疗智能体平台提供了REST(Representational State Transfer)风格API,支持您通过HTTPS请求调用。 调用方法请参见如何调用API。 父主题: 使用前必读
nsertsize、gatk-markduplicates应用,并使用鼠标拖拽至画布中。 将bwa-mem的输出参数sorted-bam与步骤4中三个应用的输入参数bam-file相连。 图3 bwa-mem、qualimap-bamqc、picard-insertsize、ga
作业配置文件说明 流程创建完成后,可基于已创建的流程运行分析作业。 在EIHealth平台,运行分析作业的过程通过图形化的界面操作完成。在命令行工具中,该过程以配置文件的形式给出。您可以基于已获取到的模板使用命令行工具启动分析作业,运行的分析作业将同步显示到EIHealth平台。
Integer 满足扩容策略中mem分配率时增加的节点数 最小值:1 最大值:50 响应参数 无 请求示例 更新扩容策略配置,更改名称为strategy_4vCPUS_8GB https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_i
更新性能加速资源配置 功能介绍 更新性能加速资源配置 URI PUT /v1/{project_id}/system/performance-resources/{id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
NGS已经普遍的应用于全基因组测序、全外显子测序、转录组测序和表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入,通过质控,比对等步骤,输出针对fastq的qc报告,输出STAR比对得到的bam文件。 MetaGenome Kraken2 pipeline 宏基因组 (
示。 对配体分子进行注释,包括DrugBank编号、分类、化学式、XLOGP3、TPSA、靶点、Csp3比例、分子量、可旋转键数目。 使用步骤如下所示。 在“资产市场”中订阅版本为1.0.0“Docking Summary”流程至所需的项目中。 进入“专题”页签,单击“新建研究”。
参数 参数类型 描述 bucket_lifecycle Integer 追踪器配置转储生命周期 data_event Array of strings 追踪器配置监听事件 请求示例 查询项目追踪器 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.c
程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 最小长度:0 最大长度:24 gpu_type String gpu架构类型,取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用
更新项目审计日志追踪器配置 功能介绍 更新项目审计日志追踪器配置 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI PUT /v1/{project_id}/eihea
文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 响应参数 无 请求示例 将外部文件https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb转为SDF格式。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug-common/t
的80多种成药属性,有些属性的预测值会给出置信区间,更好地辅助分子设计。 单击“分子属性预测”功能卡片,进入配置页面。 图1 小分子配置页面 在配置页面输入分子信息,及配置相关参数。 输入方式:支持绘制分子、选择文件、手动输入。 绘制分子:只能绘制一个分子,能够输入分子的SMILES。
程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 最小长度:0 最大长度:24 gpu_type String gpu架构类型,取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用