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”即可。流程中的每个process可以通过配置文件快速的定制并行执行的样本数目，大大节约了生信人员搭建组学分析流程的时间。 医疗智能体（EIHealth）平台集成了Nextflow框架，支持用户直接在医疗智能体（EIHealth）平台安装Nextflow。 父主题： Nextflow
下载单个对象时可指定的对象版本号。 --ps -s 否 每个分段下载任务的段大小，单位：字节，默认为配置文件中的defaultPartSize。 支持带容量单位配置，例如，配置1MB代表1048576字节。支持配置为auto，此时obsutil会根据源对象大小自动设置每个分段任务的段大小。 --cpd
例如，使用health mkdir input-data命令创建名为input-data的文件夹。 将本地数据上传至项目文件夹中。 例如，将Linux系统下root/health_test路径中xxx.R1.fastq.gz数据上传至ngs-project项目的input-data文件夹中。
当数据过大，或者数据处于服务器上时，页面传输并不是很方便，所以可以利用EIHealth平台的命令行工具进行数据文件、文件夹传输。命令行配置方法请参见配置命令行工具。 上传数据 使用命令行工具upload命令，将本地数据上传到EIHealth平台中。该命令不支持将数据上传到引用目录。
object 计算步骤参数。 表10 MdStepParam 参数 是否必选 参数类型 描述 energy_minimization_steps 否 Integer 能量最小化的步骤。 最小值：1 最大值：50000 缺省值：10000 nvt 否 Float 等温等体步骤模拟的时长，单位ps。
图1 设置靶点优化配置页面 单击“下一步”，配置靶点优化配置参数。 MD引擎：仅支持GROMACS。 时间步长：MD模拟的时间步长，范围支持0<时间步长≤5fs，默认是2fs。 温度：MD模拟的温度，范围支持0<温度≤1000K，默认是300K。 配置MD的计算步骤 Energy
医疗智能体EIHealth平台迭代更新 支持消息、邮件、安全、商标设置。 支持通过命令行工具对平台进行管理和使用，支持Windows、Linux系统。 开放API 优化 优化流程的搭建和运行过程。 商用 用户指南 命令行工具 API参考 2020年11月 序号 功能名称 功能描述
用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 gpu_type: '' # gpu架构类型，取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用
MdStepParam object 计算步骤参数 表11 MdStepParam 参数 参数类型 描述 energy_minimization_steps Integer 能量最小化的步骤。 最小值：1 最大值：50000 缺省值：10000 nvt Float 等温等体步骤模拟的时长，单位ps。
是否支持归档类型存储 public_bucket_path String 医疗智能体公共数据桶https路径 请求示例 查询系统配置列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/configs
rt size的分布。 bamqc 评估比对得到的bam文件的质量。 使用NGS的详细步骤如下所示： 步骤1：订阅流程 步骤2：上传待分析数据 步骤3：创建分析作业 步骤4：查看执行结果 步骤1：订阅流程 使用NGS流程前，需要您在资产市场中订阅该流程。 在“资产市场”中查找“Variant
据 若是想查看已经设置好的参数，可以按照下图步骤进行查看，同时若发现指定的参数有问题，也可再此处进行删除参数。 图11 删除参数 配置好参数后变可以单击右上角“启动作业”按钮进行启动作业，同时会跳转回作业列表。 图12 作业列表 步骤4：查看作业运行状态、获取作业结果 在作业列表
避免了写繁杂的bash脚本。 步骤1：订阅应用 进入资产市场，分别订阅fasp，bwa-mem，bamqc，picard-insertsize应用。 图1 订阅应用 可以在“工具 > 应用”列表可以看到刚刚订阅的应用。 图2 查看订阅的应用 步骤2：新建流程 在“工具 > 流程
获取供应商配置 功能介绍 获取供应商配置 URI GET /v1/{project_id}/system/vendor-config 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1
docking-summary 汇总分子对接结果。 使用Docking Summary的详细步骤如下所示： 步骤1：订阅流程 步骤2：上传待分析数据 步骤3：创建分析作业 步骤4：查看执行结果 步骤1：订阅流程 使用Docking Summary流程前，需要您在资产市场中订阅该流程。 在“资产市场”中查找“Docking
objects 配置项 表4 GetArchiveConfigRsp 参数 参数类型 描述 region_id String 华为云项目 current_region Boolean 该区域是否是当前设置的归档区域 缺省值：false 请求示例 获取跨域归档配置 https://eihealth
设置供应商配置 功能介绍 设置供应商配置 URI PUT /v1/{project_id}/system/vendor-config 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1
远程登录 应用容器化改造介绍 应用容器化改造流程 步骤1：对应用进行分析 步骤2：准备应用运行环境 步骤2：准备应用运行环境 步骤2：准备应用运行环境 更多 云服务器卡顿 应用容器化改造介绍 应用容器化改造流程 步骤1：对应用进行分析 步骤2：准备应用运行环境 更多 Ping不通 应用容器化改造介绍
lotypecaller、gatk-mergevcfs和discvrseq-variantqc应用构成。NGS流程执行步骤如表1所示。 表1 NGS执行步骤 步骤 描述 Read Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 Mapping and Sort and index
设置作业配置 功能介绍 设置作业配置，目前支持修改作业保存条数(1万条-1000万条)，默认设置为500万条； URI PUT /v1/{project_id}/system/job-config 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String
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