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ockerFile,使用Docker build构建成Docker镜像。 建议设置Docker镜像开机启动,防止出现“docker: Cannot connect to the Docker daemon at unix:///var/run/docker.sock. Is the
查看execution log, 若execution log为空,请提交工单或联系服务技术支持。 execution log 提示K8S pod can‘t be scheduled,请根据日志信息扩容计算资源。 execution log提示can't lock file,重试或者克隆作业即可。
步骤1:新建fastqc镜像 在linux环境上配置docker环境。 curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 配置完成后,运行docker命令,可查看docker的信息。 图1 docker信息 构建fastqc镜像。
制作Docker镜像 制作Docker镜像,有以下两种方法。 快照方式制作镜像(偶尔制作的镜像):在基础镜像上,比如Ubuntu,先登录镜像系统并安装Docker软件,然后整体制作快照,即可得到所需软件的Docker镜像。 Dockerfile方式制作镜像(经常更新的镜像):将软
floats 子任务运行时长(秒)。 数组长度:1 - 30 num_molecules Integer 分子聚类任务中的分子总数。 success_count Integer 聚类成功的分子数。 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "basic_info" :
获取docker login指令 功能介绍 获取docker login指令 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project_id}
app-name:version:srcproject -d "详细描述" -s "简要描述" -c "fastqc" -l "labelA;labelB" # 返回结果如下 edit app succeed! 父主题: 应用管理命令
-e 否 获取作业事件或者作业某一task事件,单独使用表示获取作业事件;与--task一起使用表示获取某一个task事件,并同时输出task实例列表。 --log -g 否 本地存放task日志的路径,必须与--task一起使用以获取作业某一task的日志。 --task -a 否
、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 - labelA - labelB image: 'gwj-test-01/busybox:latest' # docker镜像地址,取值范围[5-255],不能包含中文字符 commands:
获取子任务中实例的pod信息 功能介绍 获取子任务中实例的pod信息 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/{job_id}/tasks/{task_name}/instance
e为false。 --vlength -v 否 同步上传完成后,验证上传到桶中对象的大小是否与本地文件大小一致。 --vmd5 -M 否 同步上传完成后,验证上传到桶中对象的MD5值是否与本地文件的MD5值一致。 如果待上传的本地文件较大,使用该参数将会因为计算MD5而导致整体性
550e8400-e29b-41d4-a716-446655440000 health get app app-name:version get app successfully. 指定app-id时返回结果: app: id: f165b7a6-5bc9-11eb-9fef-fa163ef9b34d
上传镜像 通过health docker push命令将镜像上传至EIHealth平台项目中。 命令结构 health docker push <image-name:tag-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 image-name 无 是 镜像名称。
"2021-01-30T02:34:36Z", "message" : "创建k8s Job对象 app1-1-0-093a002fa000217 成功", "reason" : "创建成功##SuccessfulCreate", "type" : "Normal"
、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 - labelA - labelB image: 'gwj-test-01/busybox:latest' # docker镜像地址取值范围[1-255],不能包含中文字符,格式为{project-name
最大值:999 name String 配体名称,若无名称则自动命名,格式为UNK+索引(从1起编号)。 最小长度:1 最大长度:128 success Boolean 解析是否成功。 smiles String 分子SMILES表达式。 最小长度:1 最大长度:512 formula
"详细描述" -s "简要描述" -o "/data/output" -t 2000 -l "labelA;labelB" # 返回结果如下 edit workflow succeed! 父主题: EIHealth流程管理命令
完整描述文本 labels: # 可选 # 标签 - labelA - labelB timeout: 1440 # 可选 # 流程超时时间,取值范围[1,144000],单位分钟,默认1440
Task失败状态条显示说明 每个Task 状态条显示成三段:Task添加重试失败总时间、当前pod等待时间、pod运行时间。 第一段表示所有重试失败的总时间,第二段表示当前pod等待时间,第三段表示当前pod运行时间。 如果所有重试pod都失败,则显示一个总的失败时间。如果没有重试,一次就执行成功,则无需
约束,因为这样设置会使模型可探索的区间比较小,导致可能没有结果生成。 弱约束:生成的小分子不必要满足的约束条件。弱约束用于打分排序最终结果,输出分子会按照弱约束顺序尽可能多地满足所有弱约束;不满足弱约束的结果依然会被保留在结果中,对于一个比较关注且重要的分子属性,建议放到强约束条件设置里,因为弱约束不会做过滤。