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在“资产市场”中查找“autogenome”镜像。 单击界面右侧“订阅”图标,订阅该镜像。 订阅的镜像将显示在“项目管理 > 镜像”页面的镜像列表中。 步骤2:创建Notebook 在“项目管理 > 开发”页面,单击“创建Notebook”,参考表 参数说明填写信息。 表1 参数说明 参数名称 说明 名称 Notebook的名称。
户操作时,只有在该用户名下没有项目时,才可以被移除。在用户的操作列,单击“移除”,移除对应的用户。 图2 移除子用户 安全设置 在用户管理页面,可以重置用户的邮箱、手机号和密码信息。在用户操作列,单击“安全设置”,重置用户的相关信息。 图3 重置用户信息 配额设置 您可以对用户管
S存储费用。 用户可将归档数据恢复到项目桶,恢复到项目桶后,平台不会进行删除(恢复到项目桶中的数据会正常收取标准存储的费用)。 在归档管理页面,可以在“归档天数”列查看已归档天数(从归档复制完成时间开始算)。若用户早于90天删除归档数据,将收取费用,收取的费用=对应存储类别存储空
可按照时间顺序排序,但始终在文件夹后面显示。 上传数据 选择数据需要上传的文件夹,并单击“添加数据”或者直接单击“添加数据”。 在添加数据页面,选择“上传”,上传待分析数据。 数据上传成功后,单击“确定”。 上传文件大小不能超过1GB。 复制数据 将其他项目的数据,复制到本项目中,并可在本项目中操作该数据。
的分析。 平台由项目管理、数据管理、作业、工具、开发环境、镜像等核心部件组成,各个部件沉淀了丰富的技术细节和人性化的设计。 初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 使用流程 EIHealth提供了个性化分析流程
邮箱测试通知 收到邮箱测试通知后,单击“更新”,完成邮箱设置。 设置邮箱接收消息范围 在平台右上角用户名中选择“个人设置”,进入邮箱消息通知设置页面。设置邮箱消息的接收范围和接收类型。 接收范围 仅自己接收操作:自己所执行的操作。如果选择此项,接收类型默认全选。 全部接收:自己有权限访
订阅的流程、应用类资产,将显示在“项目管理 > 工具”页面的列表中,以“[资产市场]”进行标记。 订阅的镜像类资产,将显示在“项目管理 > 镜像”页面的列表中,以“[资产市场]”进行标记。 订阅的数据类资产,将显示在“项目管理 > 数据”页面。 收藏资产 资产市场提供了官方发布的镜像、数
指定用户的securitytoken。 --recover -z 否 待恢复上传任务结果清单文件的任务号。 任务号(TaskId)可在每次上传任务运行完毕后获取,或者通过结果清单文件名查询(文件名除去后缀.txt后的后36位)。 待恢复的上传任务会从结果清单的文件夹中查找,结果清单文件夹的路径参考附加参数--o。
作业管理 获取作业列表 启动作业 获取作业详情 删除作业 更新作业 获取作业事件 获取作业日志 获取子任务启动事件 获取子任务实例信息 获取子任务中实例的事件 获取子任务中实例的pod信息 获取子任务中实例的资源监控数据 重试作业 取消或强制停止作业调度 批量取消作业 批量重试作业
计算资源扩缩容 创建扩容策略 查询扩容策略列表 获取扩容策略详情 修改扩容策略 删除扩容策略 获取策略关联计算资源列表 获取策略伸缩历史 获取策略事件 启动自动扩容策略 停用自动扩容策略 修改缩容策略 查询缩容策略 父主题: 系统管理
Nextflow任务管理 获取task列表 获取task详情 获取Nextflow任务日志 父主题: Nextflow接口
节点标签管理 设置节点标签 获取节点标签集 获取节点标签集 获取预置标签列表 父主题: 系统管理
项目审计管理 创建项目 获取项目列表 更新项目 删除项目 获取项目详情 更新或者添加项目成员角色 移除项目成员 转移项目 批量删除项目成员 获取项目审计日志追踪器 更新项目审计日志追踪器配置 获取项目审计日志 获取指定审计日志 下载近一万条审计日志 父主题: 项目管理
消息中心管理 获取消息列表 统计消息信息 获取用户邮件配置 设置用户邮件配置 邮箱连通性测试 获取消息邮件配置 设置消息邮件配置 删除消息邮件配置 获取消息清理规则 设置消息清理规则 获取通知消息列表 批量删除通知消息 批量更新消息 父主题: 系统管理
发布镜像 导入镜像 订阅镜像 更新镜像描述信息或者类型 删除镜像仓库 批量删除镜像tag 删除指定镜像tag 获取镜像列表 创建镜像 获取docker login指令 获取指定镜像的tag列表 父主题: 项目管理
notebook开发环境 获取notebook列表 创建notebook 获取notebook详情 更新notebook 删除notebook 启停notebook 获取notebook鉴权信息 获取notebook工作环境 父主题: notebook开发环境
系统设置命令 获取系统标签 添加系统标签 删除系统标签 获取系统资源 购买计算资源 删除计算资源节点 修改计算资源 修改性能加速资源 查询消息及已完成作业保留设置 修改消息及已完成作业保留配置 获取供应商logo和名称设置 修改供应商logo和名称配置 获取系统配额信息 获取消息中心消息列表
搭建NGS流程 登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 流程”页签,单击“新建流程”。 图1 新建流程 在弹出的“流程设置”页面填写“流程名称”和“版本”,其他参数可选填。参数填写完成后,单击“确定”,完成流程设置。 在流程设计器左侧应用列表中选择fastp、bwa-mem应用,并使用鼠标拖拽至画布中。
切换路径 文件拷贝 创建子目录 上传数据 清理本地记录的上传文件 下载数据 删除数据 数据导入 创建归档 获取归档数据 删除归档 恢复归档 获取数据归档列表 修改归档区域 获取数据作业 删除数据作业 重试数据作业 取消数据作业 移动对象 增量同步 删除分段上传任务 修改权限 查看对象属性
Nextflow作业管理 创建nextflow作业 查询nextflow作业列表 获取Nextflow作业详情 删除Nextflow作业 重试Nextflow作业 获取Nextflow作业日志 停止Nextflow作业 获取Nextflow作业报告 父主题: Nextflow接口