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创建项目 新用户进入平台后需要自己创建项目，单击“创建项目”按钮，填写项目名称以及选择对应的数据保护策略，数据保护策略参考下面配置。 图1 创建项目 单击项目名称可进入到对应的项目中。 图2 进入项目
在使用Nextflow时，作业运行失败的可能原因 由于Nextflow支持的特殊字符继承了Nextflow原有特性，因此请排查参数值，或者选择的数据名称，或者路径中带的特殊字符是否符合Nextflow原有特性。 建议启动并发作业数最多为8个。 父主题： Nextflow
单击“查看"按钮，可以查看相应的结果信息 单击“下游分析”按钮，可以选择对相应结果进行下游任务的配置。 单击“下载”按钮可以下载相应结果。 图3 收藏结果展示 当需要取消分子收藏时，单击已收藏的结果右侧的按钮，弹出取消收藏窗口，单击“确认”，取消对该分子的收藏。 图4 取消分子收藏
创建子用户 使用管理员账户登录盘古辅助制药平台。 在右上角用户名中选择“用户管理”。 在用户管理页面，单击左上角“创建用户”，进入“创建用户”页面。 填写用户信息，分配子用户权限。 创建完成后，单击“确认”。 父主题： 用户管理
请不要使用无痕浏览器访问。 返回平台操作界面，在Notebook列表中，选择已经创建的Notebook，单击“操作”列的“打开”，进入Notebook开发页面。 图1 Notebook开发页面 选择不同的AI引擎新建文件 打开Notebook实例后，进入Notebook开发页
查询数据列表 功能介绍 查询指定目录下的数据列表，如果不指定默认查询根目录 调试 您可以在API Explorer中调试该接口，支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例，并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project_id}/
商标设置 通过设置商标您可以自定义平台Logo和标语。设置商标功能只有管理员用户可进行操作。 在平台右上角用户名中选择“设置商标”，设置平台Logo和标语。首次修改时，需同时修改商标和标题。 图1 设置商标 父主题： 系统设置
CPU架构、计算节点标签，不可修改。GPU包含NAIDIA架构GPU和自研的D310+ARM。选择GPU资源时，需要您在购买平台时包含了GPU资源，并且需要应用支持GPU运行。选择D310+ARM时，需要应用支持ARM环境运行，并在创建应用时，镜像系统为ARM类系统。 运行分析
查看实例的事件详情、下载YAML文件、查看监控。如果并发执行了多个作业，则会产生多个子任务。 对于执行失败的作业，鼠标指向作业状态，在弹出的提示框中可以查看“失败信息”和“失败原因”。同时，使用不同颜色提示执行状态，特别是对于由多个应用构成的分析作业，通过颜色方便地区分应用的执行状态。
参数说明填写信息。 表1 参数说明 参数名称 说明 名称 Notebook的名称。 描述 Notebook的简要描述。 镜像类型 选择“自定义”镜像。 工作环境 选择“genomeagent”镜像。 CPU 设置CPU为4.0核。 GPU 设置GPU为0。 内存 设置内存大于8G。 存储路径
查看项目的数据权限策略。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 不指定参数。 执行health get project命令获取当前用户有权限访问的项目列表。 指定“project-name”参数。 例如查看
<instance-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 instance-id 无 否 数据库实例 id，不填写时表示获取数据库实例列表，填写时表示获取数据库实例详情。 --data -d 否 是否查询数据库数据，需要和database-id参数一起使用。
fastq.gz和xxx.R2.fastq.gz。 步骤3：创建分析作业 单击项目名称，进入“项目管理”页面，并选择“工具”页签。 单击ngs“操作”列“启动作业”，在弹出的新建作业页面，填写作业信息。“作业名称”、“标签”、和“描述”，设置“输出路径”、“优先级”、“计算节点标签”、“超时时间”和“加速类型”。
源数量和容量做了限制。如果当前资源配额限制无法满足使用需要，您可以联系技术支持工程师申请扩大配额。 怎么查看我的配额 在平台右上角用户名中选择“配额管理”，查看配额。 图1 配额管理 父主题： 用户指南（基因平台）
命令结构 health nextflow get job ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 不涉及 否 job id，不指定job-id时，列出当前project的全部job的基本信息。 --type -t 否 查询类型，默认detail。此参数用于获取作业列表。
${genomedir} --noextract -o ${outputdir} ${input} 图3 镜像信息 选择CPU、GPU类型和大小，选择内存大小，内存单位为GB。 CPU架构依赖于制作镜像过程中选择的系统类型，以及制作镜像时所需的生物信息学软件支持在X86还是ARM上运行。例如，GATK是
对于习惯编码的开发者可以使用Terminal功能进行开发、调试和运行分析任务。 在“Files”页签下，单击右上角“Open JupyterLab”，然后选择“Terminal”，进入Terminal界面。 图1 Terminal 例如，您可以执行wget命令在公开数据集中下载基因组测序数据。 图2
表5 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 数据库id。 请求示例 创建数据库，数据库名称为database_name，选择css集群，上传项目桶中file/test.csv的数据库数据，设置列名为SMILES和NAME，打开共享开关。 https://{end
接收范围和接收类型。 接收范围 仅自己接收操作：自己所执行的操作。如果选择此项，接收类型默认全选。 全部接收：自己有权限访问的项目中产生的操作，包含自己和其他项目成员所执行的操作。默认为全部接收。 不接收：不接收操作通知。 接收类型 数据操作：数据的复制、删除、导入等异步操作通知。
响应参数 状态码： 201 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String css集群id。 请求示例 绑定CSS资源，选择id为2f042ad4-6aca-11ed-b7f6-fa163e504fdd的CSS资源，集群管理员为admin，密码为user_pwd。
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