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查看药筛作业和结果下载 查看作业进程 用户可以在“项目 > 作业”中查看药筛作业的后台进程。 图1 查看作业进程 对接完成后的小分子构象下载 单击应用中的“qvina-w”,获取输出结果的路径。 文件的命名方式为:蛋白质名称_vs_配体名称_blinddock.pdbqt。 图2
输出结果-3D视图 作业信息 在作业中心页面,您可以单击具体的作业名称,进入作业信息页面,查看该作业的相关信息,可以克隆或者删除。如果执行失败的作业,可以在该页面查看失败信息。 图4 作业信息页面 作业信息页面也支持标签修改,点击标签进行修改。 作业执行状态如下所示。 等待中:作业创建成功,等待处理中。等待中的作业支持取消。
统计应用、流程、作业数目 功能介绍 统计应用、流程、作业数目 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/statistics 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
靶点口袋分子设计作业管理 创建靶点口袋分子设计作业 查询靶点口袋分子设计作业详情 父主题: API(盘古辅助制药平台)
头。 标签:设置任务标签。 功能调用消耗:运行成功后功能会消耗一次。 单击“提交”。 提交成功后,可以在“作业中心”查看执行结果。 查看运行结果。 作业执行完毕后,单击作业名称,可进入输出结果页面。序号为0的分子为原始分子,在从头生成设计模式下不存在序号为0的分子。 生成的分子按
直接挂载OBS目录进行大规模计算,如何解决偶现报错 问题现象 运行作业时,作业直接挂载OBS目录进行大规模计算。偶现“异常应用”,并日志报错input/output error或file xxx not exists。 问题原因 OBS集群到计算集群之间的带宽达到了上限。 OBS集群的IOPS达到了上限。
获取study作业的最值信息 功能介绍 获取study作业的最值信息 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project_id}/eih
String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 job_id 是 String 作业id 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 job_id 是 String 作业id 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
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系统管理 计算资源扩缩容 计算资源管理 数据库资源管理 用户管理 作业清理配置 标签管理 消息中心管理 节点标签管理 医疗平台信息获取 性能加速资源管理 资源监控数据获取 存储资源查询 系统配置和供应商配置 系统配额及资源使用情况获取 父主题: API(医疗智能体平台)
获取生成study作业3D结构的内容 功能介绍 获取生成study作业3D结构的内容 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project
方式一:对于输入参数,打开“并发”开关,在启动作业时,每个参数可以设置多个参数值,自动生成多个作业并发执行。并发执行的作业数为设置的参数值个数的乘积。 例如,存在输入参数a和输入参数b,在启动作业时,分别给参数a设置了2个参数值,给参数b设置了2个参数值。那么,系统将自动生成4个作业并发执行。 方式二:参考批量执行NGS分析操作。
iant Calling,输出变异检测结果。 基因组变异检测质控 通过VariantQC对vcf进行质量控制,输出变异数目,变异类型统计等指标。 流程优势 使用Unix管道技术连接比对和排序步骤,以缩短bwa和samtools的存放、读取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4
上传镜像和创建分析作业。也可以将团队成员引入到项目中,并通过设置成员角色实现项目权限的划分。 项目管理是以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。您可以创建项目,并向其中上传数据、搭建流程、创建分析作业,对项目中的资产进行
单病例量化结果秒级输出,AI+医生复核总体效率是纯人工量化评估速度的数十倍。 病灶区域分割DICE(预测病灶和真实病灶的重合度)及AVD(预测病灶体积与真实病灶体积误差)指标业界领先,与医生用手工准确勾勒的结果高度一致。 图2 影像分析图 新冠肺炎药物筛选 为了全面、系统地评估药物对新冠病毒所有靶点蛋白的结合情
job_quota 是 Integer 允许同时运行的作业数 最小值:1 最大值:100 job_timeout 是 Integer 作业执行超时时长,单位天 最小值:1 最大值:60 cpu_quota 是 Integer 作业的CPU资源配额,单位核 最小值:1 最大值:1024
job_quota 是 Integer 允许同时运行的作业数 最小值:1 最大值:100 job_timeout 是 Integer 作业执行超时时长,单位天 最小值:1 最大值:60 cpu_quota 是 Integer 作业的CPU资源配额,单位核 最小值:1 最大值:1024
Repository for Container,简称SWR)进行简单易用、安全可靠的镜像管理。 应用 EIHealth平台的每一个分析作业都依托于应用运行。应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装,应用可以独立使用,也可以将多个应用编排入流程串联使用。 您可