检测到您已登录华为云国际站账号，为了您更好的体验，建议您访问国际站服务网站 https://www.huaweicloud.com/intl/zh-cn
不再显示此消息
检测到您已登录华为云国际站账号，为了您更好的体验，建议您访问国际站服务网站 https://www.huaweicloud.com/intl/zh-cn
不再显示此消息
生成分子SDF三维结构 功能介绍 生成分子SDF三维结构。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/sdf 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述
病灶体积的自动准确测量，并与解剖学位置对应。 对分析结果自动三维重建，直观呈现，方便指导病人用药治疗。 单病例量化结果秒级输出，AI+医生复核总体效率是纯人工量化评估速度的数十倍。 病灶区域分割DICE（预测病灶和真实病灶的重合度）及AVD（预测病灶体积与真实病灶体积误差）指标业界领先，与医生用手工准确勾勒的结果高度一致。
iant Calling，输出变异检测结果。 基因组变异检测质控 通过VariantQC对vcf进行质量控制，输出变异数目，变异类型统计等指标。 流程优势 使用Unix管道技术连接比对和排序步骤，以缩短bwa和samtools的存放、读取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4
步数，搜索得到较好结果的参数进行后续训练。训练过程中可选择在验证数据集上进行评估，评估结果更好的模型参数将会保留。 提取降维之后数据：完成模型训练后，生成降维后的结果数据。 当您在运行AutoGenome示例出现“Warning：restart the kernel and run
Viewer工具支持查看蛋白质和小分子的3D结构。单击“功能模块 > 通用工具 > MOL 3D Viewer”，进入MOL 3D Viewer页面即可操作。 主要功能包括： 本地分子结构的3D可视化，支持多种显示样式，支持本地文件拖拽进画布区域进行渲染。 大分子支持PDB编号自动下载。 相互作用的可视化。
job_quota 是 Integer 允许同时运行的作业数 最小值：1 最大值：100 job_timeout 是 Integer 作业执行超时时长，单位天 最小值：1 最大值：60 cpu_quota 是 Integer 作业的CPU资源配额，单位核 最小值：1 最大值：1024
创建应用，运行分析作业。 镜像简介 由于生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。 将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并
镜像管理简介 运行生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台
质，1为Pgp基质。 结果解释：预测值的范围在0~1之间。 HIA： Human intestinal absorption，人体肠道吸收指标。HIA大于30%代表具有较好的吸收性（HIA+），小于30%为（HIA-）。 结果解释：预测值的范围在0~1之间。 F20%： The human
smiles 是 String 分子SMILES表达式。 最小长度：1 最大长度：512 main 否 Boolean 配体是否为主要配体，在中心模式下，必须指定1个主要配体。 缺省值：false 响应参数 状态码： 201 表5 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String
息栏中查看作业的输入&输出、节点参数、应用；在作业的子任务中可以查看日志、事件；在事件页签，可以查看实例的事件详情、下载YAML文件、查看监控。如果并发执行了多个作业，则会产生多个子任务。 对于执行失败的作业，鼠标指向作业状态，在弹出的提示框中可以查看“失败信息”和“失败原因”。
步骤3：创建分析作业 单击项目名称，进入“项目管理”页面，并选择“工具”页签。 单击ngs“操作”列“启动作业”，在弹出的新建作业页面，填写作业信息。“作业名称”、“标签”、和“描述”，设置“输出路径”、“优先级”、“计算节点标签”、“超时时间”和“加速类型”。 基本信息：包含作业名称、标签、描述。
输出个数：输出个数越多，任务时间越长。 作业名称：设置作业名称。长度为5~64个字符，仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格，首位只能以数字或字母开头。 标签：设置任务标签。 单击“提交”。可在作业中心查看该作业的运行情况。 运行完成后，可在作业中心单击该作业查看输出结果。 单击按
StudyJobRsp object 作业详情返回体 表5 StudyJobRsp 参数 参数类型 描述 id String study作业id workflow_job_id String workflow作业id name String 作业名称 status String 作业状态 template_id
清理本地记录的上传文件 下载数据 删除数据 数据导入 创建归档 获取归档数据 删除归档 恢复归档 获取数据归档列表 修改归档区域 获取数据作业 删除数据作业 重试数据作业 取消数据作业 移动对象 增量同步 删除分段上传任务 修改权限 查看对象属性
Nextflow 简介 安装/卸载Nextflow 新建流程 管理流程 新建作业 管理作业 约束限制 作业执行失败排查思路 父主题： 用户指南（基因平台）
导入应用、创建应用、获取应用详情、删除应用等相关操作API。 流程管理 流程管理 导入流程、创建流程、获取流程详情、删除流程等相关操作API。 作业管理 作业管理 启动作业、获取作业详情、停止作业等相关操作API。 资产市场 资产市场 资产管理、资产收藏、供应商管理等相关操作API。 开发环境 notebook开发环境
填写“超时时间”、“输出路径”。 为可选参数，基于流程创建分析作业时，该参数可重新定义。 “超时时间”指作业运行时间超过设置时间时，认为超时，默认1440分钟，最大可设置为144000分钟，即作业运行至多100天。 “输出路径”指运行分析作业时的输出结果存放路径。 例如，gene-asset
应用管理 应用管理 作业管理 自动作业管理 流程管理 流程统计管理 父主题： API（医疗智能体平台）
图2 配置流程参数 参数配置完成后，单击“保存”。 流程创建成功后，单击“保存并启动作业”，或者在流程管理页面，单击流程列表操作列的“启动作业”进入作业设置页面，配置作业的相关信息，具体可参考新建作业。 父主题： Nextflow
长按/截图保存，微信识别二维码
或者关注公众号“华为云”
