如果未安装IB驱动,执行2。 安装IB驱动。 下载安装包“MLNX_OFED_LINUX-4.3-1.0.1.0-rhel7.3-x86_64.tgz”。 下载地址:https://network.nvidia.com/products/infiniband-drivers/linux/mlnx_ofed/
为MPI集群运行程序时的hostlist参数,在集群上通过Spectrum MPI运行可执行文件。其中, IP代表集群中的弹性云服务器IP地址。 Number代表该弹性云服务器的任务数。 假设集群中共有两个弹性云服务器,主机名分别是host-192-168-0-27和host-1
资源和成本规划 所需资源如表1所示,具体资源的实际费用请以对应官网价格显示为准。 表1 资源和成本规划 序号 资源 资源说明 获取路径 数量 费用 1 STAR-CCM+ 使用STAR-CCM+15.02版本。 建议从官方网站获取 1 以官网显示价格为准。 2 MPI(可选) Plateform
1Eval-rh7_Aug11.x86_64.rpm ibm_smpi-10.01.01.0Eval-rh7_Aug11.x86_64.rpm 下载地址:https://www-01.ibm.com/marketing/iwm/iwm/web/preLogin.do?source=swerpsysz-lsf-3
set-hostname vm1 执行以下命令,添加“/etc/hosts”文件。 # vi /etc/hosts 添加的内容为弹性云服务器的主机名及IP地址,例如 #cat /etc/hosts 192.168.1.3 vm1 192.168.1.4 vm2 ... 执行以下命令,添加hostfile文件。
前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root 用户。 $ sudo su 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,查询是否已安装IB驱动。 # rpm
节点。 状态为“停止”的节点可进行启动操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”。 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。 选择要启动的节点,单击操作中“更多 > 启动”。 单击“确定”。 提交成功后,返回到节点管理页面,待操作完成节点状态变为“运行中”。
该任务指导用户在BMS集群上进行相关设置,并使其可以相互免密登录。 背景信息 $:表示在普通用户下,执行相关操作。 #:表示在管理员用户下,执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建BMS,并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录集群中任意一台BMS。
只有状态为“运行中”的节点可执行停止操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”。 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。 选择要进行停止操作的节点,单击后方操作中“更多 > 停止”。 单击“确定”。 提交成功后,返回到节点管理页面,等待操作完成节点状态变为“停止”。
息。 操作步骤 前提条件:用户集群的节点列表不为空。 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”。 在“节点管理”页上方的集群下拉框切换到要查看的集群,查看该集群的节点列表。 单击节点名称,跳转至对应的ECS列表页即可查看节点详细信息。 父主题: 查看HPC集群
只有状态为“运行中”的节点可进行重启操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”。 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。 选择要进行停止操作的节点,单击操作中“更多 > 重启”。 单击“确定”。 提交成功后,返回到节点管理页面,待操作完成,节点状态变为“运行中”。
PC集群,可以使用该功能进行集群的部署。下面介绍如何使用已有节点部署HPC集群。 使用已有节点部署集群,首先选择管理节点,再选择计算节点,切换计算节点与管理节点需要有相同的CPU架构,需要在相同的虚拟私有云、安全组,且使用同一个镜像主版本。 购买须知 第一次使用公有云服务时,系统
用户手动删除清理,否则会继续扣费。 单节点删除操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”; 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。 选择要进行删除操作的节点,单击操作列“删除”。 按需类型节点删除 选择是否删除云服务器,如勾选,连同云服务器一同
HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的,例如LAMMPS, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。
内存参与的条件下,RDMA请求从用户空间发送到本地网卡并通过网络发送给远程网卡,这就减少了在处理网络传输流时内核内存空间与用户空间之间环境切换的次数。 没有CPU参与:应用程序可以访问远程内存,而不占用远程机器中的任何CPU。远程存储器将被读取,无需任何干预的远程进程(或处理器)
社区OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行社区OpenMPI(以3.1.1版本为例)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装社区OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
Platform MPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行Platform MPI应用(platform_mpi- 09.01.04.03r-ce.bin版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装Platform MPI。 操作步骤
IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行IB驱动自带的MPI应用(3.1.0rc2版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
Intel MPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行Intel MPI应用(l_mpi_2017.3.196版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装Spectrum MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
Spectrum MPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行Spectrum MPI应用(10.01.01版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装Spectrum MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
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