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安装/卸载Nextflow 安装Nextflow Nextflow需要用户自己进行安装，安装的权限只有管理员拥有。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块，单击“安装”。 图1 安装Nextflow 选择安装方式。目前支持GitHub获取和上传安装包两种方式。
一类，从而找到有效骨架 ，辅助苗头化合物发现。 单击“功能模块 > 通用工具 > 聚类分析”功能卡片，进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式：选择文件和手动输入类型。 上传分子文件：选择可上传的分子文件。分子文件支持SMI格式文件；文件大小不超过5G；小分子支持10-10
靶点口袋发现 靶点口袋发现实现全新元动力学算法，高效遍历柔性蛋白表面，找到潜在口袋位置。 单击“靶点口袋发现”功能卡片，进入配置页面。 在配置页面，选择靶点文件、探针文件，配置相关参数信息。 靶点文件：支持PDB格式文件。 探针文件：探针分子建议原子数不超过400，分子量过大可以通过增大探
Notebooks一样的组件。 打开JupyterLab 选择状态为“运行中”的Notebook实例，单击“操作”列的“打开”访问Notebook。 单击右上角的“Open JupyterLab”，可直接打开此Notebook实例对应的JupyterLab页面。 图1 进入JupyterLab 进入Ju
件，并同时输出task实例列表。 --log -g 否 本地存放task日志的路径，必须与--task一起使用以获取作业某一task的日志。 --task -a 否 task名称。如果是并发的task，那么默认获取索引号为0的task实例，如果要查看别的实例，格式： --task
是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1 最大长度：128 id 是 String 策略id 最小长度：1 最大长度：128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token
# 对于ENUM类型，可以提示一定要在param_enum列表范围内取值；对于FILE类型，约束文件后缀类型；对于DIRECTORY类型，提示xxx； required: true
启动作业 获取作业详情 删除作业 更新作业 获取作业事件 获取作业日志 获取子任务启动事件 获取子任务实例信息 获取子任务中实例的事件 获取子任务中实例的pod信息 获取子任务中实例的资源监控数据 重试作业 取消或强制停止作业调度 批量取消作业 批量重试作业 批量删除作业 父主题：
enum: # 枚举类型时，枚举值列表 - xxx values: # 参数值，非数组类型仅允许填写单个值 - xxx outputs:
用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 gpu_type: '' # gpu架构类型，取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用
束.fastq；对于ENUM类型，可以提示一定要在param_enum列表范围内取值；对于FILE类型，约束文件后缀类型；对于DIRECTORY类型，提示目录下需要包含哪些文件； 最小长度：0 最大长度：64 values Array of strings 参数取值 如填写，只支持填一项，根据参数类型进行不同的校验
修改计算资源 修改计算资源节点。 命令结构 health edit compute-resources [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 --force -f 否 是否强制操作。 --labels -l 否 需要添加或删除的标签列表。json数组格式。如：-l
图1 设置靶点优化配置页面 单击“下一步”，配置靶点优化配置参数。 MD引擎：仅支持GROMACS。 时间步长：MD模拟的时间步长，范围支持0<时间步长≤5fs，默认是2fs。 温度：MD模拟的温度，范围支持0<温度≤1000K，默认是300K。 配置MD的计算步骤 Energy
从头生成：通过指定的口袋从头生成小分子。 选定设计方式后，上传靶点结构，并配置其他参数。 图1 查看配置页面 靶点结构：选择靶点结构文件，仅支持PDB格式。若文件中包含多个受体，则默认只处理第一个。 单击下一步，配置配体文件，支持选择原始配体与上传配体文件两种方式 选择原始配体：选择靶
参数 参数类型 描述 count Integer 总数 resources Array of PerformanceResourceRsp objects 性能加速资源列表 表4 PerformanceResourceRsp 参数 参数类型 描述 id String 实例ID resource_id
合成路径规划 合成路径规划基于盘古药物分子大模型，根据给定的目标分子，可以设计出完整且合理的合成路径。 单击“合成路径规划”功能卡片，进入配置页面。 在配置页面，可以在左侧绘制分子，也可以通过上传分子文件方式上传分子或者在白框内输入小分子SMILES表达式。 上传分子文件：支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件。
或者骨架从小分子数据库中搜索到相似结构和排序，可实现百亿级小分子的秒级搜索。 单击“分子搜索”功能卡片，进入分子搜索页面。 在配置页面，进行分子搜索配置，包括输入小分子、选择搜索算法、选择输出个数。 图1 分子搜索页面 输入小分子：可以通过输入SMILES、上传文件或者直接绘制输入小分子。最终以SMILES为准。
容，比如后缀约束.fastq；对于ENUM类型，可以提示一定要在param_enum列表范围内取值；对于FILE类型，约束文件后缀类型；对于DIRECTORY类型，提示目录下需要包含哪些文件； 最小长度：0 最大长度：64 values Array of strings 参数取值
表5 TaskResourceDto 参数 是否必选 参数类型 描述 cpu 否 String cpu申请使用量，取值范围[0.1-128]，单位C，支持一位小数。对于应用，不填默认1C；对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0
子任务的参数类型，不填默认为MANUAL values 否 Array of strings 子任务的参数数值，根据参数类型进行合法性校验 最小长度：0 最大长度：2048 数组长度：0 - 128 响应参数 状态码： 201 表8 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String
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