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3的OS为例在单节点上运行MPI应用。 裸金属服务器场景支持使用的MPI 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用Spectrum MPI 安装和使用Intel MPI 安装和使用Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
openmpi-4.0.2a1/lib64 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图5 查看IB 驱动自带的Open MPI 环境变量 如果回显如图5所示,表示环境变量配置成功。 执行以下命令,在单台BMS上运行IB驱动自带的Open MPI。
集群中所有的BMS,均已安装Spectrum MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1
集群中所有的BMS,均已安装Spectrum MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1
集群中所有的BMS,均已安装社区OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1
企业分支、科研组织机构等跨全球地理位置进行及时协同工作,提高效率。 可以利用公有云的跨地域能力,共享计算资源,海量数据,并能实现云端大数据分析。 优化性能 性能比普通云服务器大幅提升。 通过虚拟化优化(SR-IOV、PCI直通)等,各类测试报告显示:大规模云化HPC性能损耗不大。 约束与限制 MPI和通讯库的
集群中所有的BMS,均已安装Platform MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1
执行以下命令,导入配置的MPI环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图3 环境变量正常 回显如图3所示表示环境变量正常。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 执行以下命令,生成可执行文件。
集群中所有的BMS,均已安装MPICH。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1
执行以下命令,设置环境变量。 如果选择自动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议,执行以下命令: # export IBM_SPECTRUM_MPI_LICENSE_ACCEPT=yes 如果选择手动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议,执行以下命令: # export
了在应用内存与内核之间复制数据的需要。因此,传输延迟会显著减小。 内核旁路:内核协议栈旁路技术使应用程序无需执行内核内存调用就可向网卡发送命令。在不需要任何内核内存参与的条件下,RDMA请求从用户空间发送到本地网卡并通过网络发送给远程网卡,这就减少了在处理网络传输流时内核内存空间与用户空间之间环境切换的次数。
附录 常见问题 主要概念 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
集群中所有的BMS,均已安装社区OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1
6的操作系统为例在集群上运行MPI应用。 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用MPICH 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
009-R8/mpi/openmpi/4.0.1-cda-002/linux-x86_64-2.12 执行以下命令,运行ldconfig。 ldconfig 执行以下命令,运行STAR-CCM+。 /opt/Siemens/15.02.009-R8/STAR-CCM+15.02.
集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1
openmpi-3.1.0rc2/lib64 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图3 查看IB驱动自带的Open MPI环境变量 如果回显如图3所示,表示环境变量配置成功。 执行以下命令,在单台BMS上运行IB驱动自带的Open MPI。 $
主要概念 RDMA RoCE 父主题: 附录
IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
常见问题 RoCE网络问题 STAR-CCM+启动相关问题 父主题: 附录