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Notebook中安装 例如，通过Jupyter Notebook在“TensorFlow-1.8”的环境中安装Shapely。 打开一个Notebook实例。 在Jupyter控制面板中，选择“New”（新建），然后选择“TensorFlow-1.8”。 在新建的Notobook中，在代码输入栏输入如下命令。
EMARK行来解决该问题。 如下所示： 分子优化靶点设置界面，受体展示正常。 但是下载该靶点文件后，使用通用工具Mol 3D Viewer打开，会出现蛋白显示不完整的情况，如下图所示。 此时可将受体文件中的REMARK行进行删除，即可解决该问题。 父主题： 盘古辅助药物
Notebook安装Conda指导 打开Notebook，在“File”页签下选择“Terminal”。 图1 选择Terminal 下载和安装Anaconda。 获取Repository和Anaconda安装包。 Repository: https://repo.anaconda
Notebook常用操作 打开Notebook 首次打开Notebook之前，请先获取url，然后访问url。 然后单击“高级 > 继续前往xxxx（不安全）”，页面显示“403 : Forbidden”，然后返回Notebook列表页面。 请不要使用无痕浏览器访问。 返回平台操
运行分析作业时，流程中的每一个应用称之为一个任务（Task），通过循环读取Task的输入数据，可以实现作业的批量执行。 例如，您可以在本地创建.bat格式的批处理文件，执行该脚本即可批量运行NGS分析作业。 @echo off set list="task-1-fastp.fastq-
notebook-id 无 否 notebook id，不填写时表示获取notebook列表，填写时表示获取notebook详情。 --url -u 否 获取打开notebook的地址。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍
创建Notebook 在开始进行模型开发前，您需要创建Notebook，并打开Notebook进行编码。 在“项目管理 > 开发”页面，单击“创建Notebook”，参考表 参数说明填写信息。 图1 创建Notebook 表1 参数说明 参数名称 说明 名称 Notebook的名
参数确认无误后，单击“立即创建”，完成Notebook的创建操作。 在Notebook列表中，当“状态”由“启动中”转变为“运行中”后，单击操作列的“打开”。 您可以直接使用该Notebook，编写和调测模型，进行开发工作。关于Jupyter Notebook的详细操作指导，请参见Jupyter
选择状态为“运行中”的Notebook实例，单击“操作”列的“打开”访问Notebook。 单击右上角的“Open JupyterLab”，可直接打开此Notebook实例对应的JupyterLab页面。 图1 进入JupyterLab 进入JupyterLab页面后，自动打开Launcher页面，如下图所示
方式。 通过“新建流程”时创建 通过“作业”页面创建 •新建作业 •克隆作业 通过“工具”页面创建 通过“上传作业”创建 如果在创建应用时打开了“并发”开关，可以设置多个参数值，批量执行作业。 可通过在“系统资源 > 计算资源”页面将计算节点的标签设置为copy-in，实现作业运
url获取方法 在Notebook列表页面，按F12键打开，切换至Network页签。 单击页面右侧按钮，在Network页签的“Name”列单击“notebooks?offset=0&limit=10”，右侧展开代码行，在“url”行获取url链接，如下图所示。 图1 获取url
批量删除镜像tag 功能介绍 批量删除镜像tag 调试 您可以在API Explorer中调试该接口，支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例，并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-pro
步骤3：进入jupyterlab环境使用genomeagent智能体框架 选择步骤2中状态为“运行中”的Notebook实例，单击“操作”列的“打开”访问Notebook，请参考打开Notebook。 进入Notebook的根目录下“genomeagent_examples”文件夹中，包含使用“geno
单击“新建流程”，进入流程设计器页面。 流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具，详细介绍请参见流程设计器。新建流程时，自动保存默认打开。 图1 新建流程 填写流程参数信息，填写完成后单击“确定”。 填写流程基本参数，包括“流程名称”、“版本”、“标签”、“短描述”和“描述”。
of strings 数据文件列名。 最小长度：1 最大长度：128 数组长度：2 - 12 shareable 否 Boolean 是否打开组织共享。 缺省值：false 表4 DatabaseFile 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 数据库文件来源。
否 设置项目级数据权限策略。只有项目所有者能修改。 用数字0和1表示关闭和打开，以data-share、data-download、data-delete、data-encrypted的顺序排列，例如全部打开则为1111，全部关闭则为0000， 默认1110。 --status -s
binary numerical file 是 ModelFile object 模型数据来源。 shareable 否 Boolean 是否打开组织共享。 缺省值：false base_model_id 否 String 基模型id。 缺省值：pangu-drug-model 最小长度：1
--policy -p 否 设置项目级数据权限策略。 用数字0和1表示关闭和打开，以data-share、data-download、data-delete、data-encrypted的顺序排列，例如全部打开则为1111，全部关闭则为0000， 默认1110。 命令示例 本节以Wi
作是基于所选择的OBS路径下的内容操作。 参数填写无误后，单击“立即创建”，创建Notebook。 步骤3：预览AutoGenome案例 打开创建的Notebook。 在Notebook的根目录下的“AutoGenome-Examples”文件夹中，包含使用AutoGenome进行分析的示例，可供参考。
图2 填充应用内容 对于测序得到的大量数据，如果需要批量执行NGS分析，可以选取以下任意一种方式进行批量执行： 方式一：对于输入参数，打开“并发”开关，在启动作业时，每个参数可以设置多个参数值，自动生成多个作业并发执行。并发执行的作业数为设置的参数值个数的乘积。 例如，存在输
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