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应用管理命令 应用配置文件说明 创建应用 修改应用 查询应用 删除应用 导入应用
com/clilist-eihealth/eihealth_31_0026.html # 【必须】 # 'app_id': 'ga-app::v1.0', 与APP参数中的'name': 'ga-app'和'version': 'v1.0'相匹配，默认相匹配，无需改动 # 【可选】
workflow作业id name String 作业名称 status String 作业状态 template_id String 生成study作业结果的模板id database_name String study作业结果的数据库实例名称 database_id String study作业结果的数据库实例id
【可选】单击“镜像类型”，对上传的镜像进行分类。 上传镜像时如果上传命令中未指定镜像类型，新上传的镜像默认显示为“OTHER”，您可以将镜像标记为“APP”或“NOTEBOOK”。 APP：用于创建应用的镜像。 NOTEBOOK：用于创建Notebook的镜像。 为了保证平台业务安全，您在平台内购买的计算资源，将部
SDF、PDB、MOL2格式。 受体蛋白：受体蛋白文件，支持PDB格式。 图2 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库名称：数据库的名称。 输出文件格式：可以将流程生成的分子对接结果，保存为.txt、.csv或.vcf格式。使用“Docking
Used Total Unit Total projects 27 100 NUM Applications per project -- 500 NUM Backups per project
应用场景 基因组分析 提供从基因组数据管理、生物信息分析流程到科研分析管理整个流程的服务，快速实现基因组数据分析及AI建模，提供高性能、高可靠性、高性价比的基因测序计算、存储、分析和AI能力支持，让科研过程标准化、可执行。 基因组测序是新型冠状病毒疑似病例确诊的病原学证据之一，基
应用场景 靶点发现 在靶点发现阶段，提供蛋白质结构预测、靶点口袋发现功能。 苗头化合物发现 在苗头化合物发现阶段，提供分子对接、口袋分子设计，分子属性预测功能，在分子对接中，预置了大量的分子库可供选择。 先导化合物优化 在先导化合物优化阶段，提供分子优化、靶点口袋分子设计（骨架跃
下载应用或流程 在“工具”页面选择“流程”或“应用”。 选择需要发布的流程，单击“操作”列“更多”>“下载”。 图1 下载应用 下载内容不包含应用和流程的id，所有引用关系通过名称和版本来指定。 父主题： 工具管理
https://iam.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v3/auth/tokens Content-Type:application/json { "auth": { "identity": { "methods": ["password"]
StorageClass: standard ETag: 6c2d85292e26b513c2670998ecf8427e ContentType: application/x-directory Type: folder Metadata: mtime=1661858028 mode=16832
template1 project-02 EIHealth 347 xxx xxx 获取模板详情 health get db instance 12345 # 返回结果如下 { "id": "xxxx", "name": "job-1622803262953"
创建FastQC应用样例 本章节提供了在EIHealth平台创建FastQC应用的样例，帮助您快速熟悉平台的使用方法。 FastQC是一款高通量序列数据的质量检测工具，此样例基于开源的FastQC软件，将软件制作成镜像，上传至平台，并基于此镜像创建应用。应用创建完成后可以直接使用
流程管理 发布流程 导入流程 订阅流程 获取流程列表 创建流程 获取流程详情 更新流程 删除流程 父主题： 应用管理
流程是由1各或者N个应用串联构建而成，平台页面以简单拖拽、连接的方式将不同的应用连接起来构建成一个分析流程，避免了写繁杂的bash脚本。 步骤1：订阅应用 进入资产市场，分别订阅fasp，bwa-mem，bamqc，picard-insertsize应用。 图1 订阅应用 可以在“工具
去金属离子：去掉受体蛋白里面的金属离子。 去水、去金属离子参数默认是勾选状态，若上传的受体中包含配体，提交任务时系统会自动删除配体。 单击“应用全局"，可以对受体进行批量处理。 单击“下一步”，进入配体预处理页面。 单击“上传配体”后的，选择配体文件。 配体文件仅支持输入1个文件。
com/v1/{project_id}/assets/properties 响应示例 状态码： 200 OK [ "IMAGE", "DATASET", "APP", "WORKFLOW" ] 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题： 资产管理
删除流程 功能介绍 删除流程 URI DELETE /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/workflows/{workflow_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
应用的参数和镜像启动命令如何设置 创建应用时，需要设置应用的输入、输出参数和镜像的启动命令。需要您熟悉所制作的生物信息学软件的使用并具备一定的开发经验。 例如，设置FastQC应用的参数和镜像启动命令时，首先通过阅读FastQC介绍和FastQC命令说明了解软件的使用。并依照Fa
获取子任务中实例的pod信息 获取子任务中实例的资源监控数据 重试作业 取消或强制停止作业调度 批量取消作业 批量重试作业 批量删除作业 父主题： 应用管理
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