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获取自动作业模板列表 功能介绍 获取自动作业模板列表 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/auto-jobs 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
ame.output_name},表示连线关系,即app1-2需要app1-1成功执行后才会运行 - '${app1-1.output-dir}' 上传流程模板。 单击“上传流程”,在弹出的页面中上传yaml模板。 父主题: 工具管理
"app_info": { "app_id": "2", "app_name": "zx-1030-mkdir", "app_version": "1.0.0", "app_src_project_name": "", "app_labels":
指定workflow-id或workflow-name:version:srcproject,列出具体应用的信息,srcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --sample -s 否 获取流程模板,模板为yaml格式。 --downloadPath -d 否 获取wor
中,该过程以配置文件的形式给出。您可以基于已获取到的模板使用命令行工具启动分析作业,运行的分析作业将同步显示到EIHealth平台。 获取作业模板 使用health get job -s命令获取启动分析作业的模板,复制并保存模板至本地,您可以保存成.yaml或.txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。
应用,创建好的应用将同步显示到EIHealth平台。 获取应用模板 使用health get app -s命令获取创建应用的模板,复制模板并保存到本地,您可以保存成.yaml或.txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。 在本地编写模板,模板中的参数与在EIHeal
String 应用id name String 应用名称 version String 应用版本 summary String 应用短描述 description String 应用描述 labels Array of strings 应用标签 image String 应用镜像 commands
object 应用申请资源 inputs 否 Array of AppInputParameterDto objects 应用的输入参数列表 数组长度:0 - 128 outputs 否 Array of AppOutputParameterDto objects 应用的输出参数列表
更新应用 功能介绍 更新应用 URI PUT /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/apps/{app_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 app_id 是 String 应用id 最小长度:1
EIHealth中的分析流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。分析流程至少由一个应用组成,在多个应用构成的流程中,一个应用的输出作为另一个应用的输入,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 在EIHealth平台,创建流程通过拖拽应用的方式完成。在命令行工具中
是否必选 说明 ID 无 是 可选: 应用的ID(app-id),使用命令行工具创建应用时生成。示例请参见创建应用命令示例。 应用的名称、版本、所在项目名称(app-name:version:srcproject),srcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。例如GATK:4
发布应用 功能介绍 发布应用 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/apps/{app_id}/publish 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
删除应用 功能介绍 删除应用 URI DELETE /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/apps/{app_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 app_id 是 String 应用id
请求示例 订阅应用,订阅后应用名称为dest_app_name,应用版本为1.0.0 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/apps/subscribe
ImportAppRsp 参数 参数类型 描述 source_app_id String 源应用id destination_app_id String 目标应用id destination_app_name String 目标应用名称 version String 应用版本 message
参数类型 描述 apps Array of AppListDto objects 应用列表 count Integer 应用总条数 表5 AppListDto 参数 参数类型 描述 id String 应用id name String 应用名称 version String 应用版本 summary
txt、.vcf文件生成数据库。创建的数据库需要保证数据文件与模板对应。创建数据库时,可以不选择导入的数据文件,建立空的数据库,后期可以新增数据行或者导入数据。如果使用自动作业的数据表创建数据库,在导入数据,需要参照数据库模板格式进行导入。 您可以导入本项目或使用其他项目中的数据生成数据库。
件创建为数据库。 创建数据库时,数据库模板为您提供了一个数据表的搭建框架,可通过数据库模板灵活的定义数据结构,描述数据及其关系。数据库以项目为粒度进行资源的隔离和访问控制,不同成员角色对数据库的操作权限请参见成员角色和权限。 预置数据库和模板 平台内置“神农项目”药物虚拟筛选数据
128 表8 AppInfoDto 参数 参数类型 描述 app_id String 应用id app_name String 应用名称 app_version String 应用版本 app_src_project_name String 应用来源项目名称 app_labels
-s命令获取创建作业的yaml模板,复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或.txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。 修改作业yaml模板。 在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台创建作业过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见作业配置文件说明。