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workflow ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 不涉及 否 流程ID，指定后获取流程ID对应的流程详情。不指定时，获取的是流程列表。 --param-file -p 否 参数文件保存路径，以yaml格式保存。如果没指定，则不会显示和保存参数信息。
资产市场简介 资产市场是在EIHealth平台的基础上构建的开发者生态社区，提供镜像、数据、应用和流程的内容共享。提供安全、开放的资产共享和使用，加速基因、药物、临床应用的开发与落地，保障开发生态链上各参与方高效地实现各自的商业价值。 订阅资产 资产市场提供官方发布的镜像、数据、
不同区域云服务产品之间内网互不相通；请就近选择靠近您业务的区域，可减少网络延迟，提高访问速度。 平台用户权限限制 EIHealth平台支持两种类型的用户管理，可以帮助您安全地控制平台的访问和使用权限。 表1 EIHealth平台用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理 系统级的角色配置，可创建平台的子用户，
新冠病毒蛋白序列开始，针对所有21个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化，获取了靶点蛋白的3D结构。并对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估，获取的结合能信息均公开在“神农项目”中。 图1 “神农项目”药物虚拟筛选数据库 图2
通过“上传作业”创建 通过在本地修改作业的yaml模板，运行分析作业。 获取作业yaml模板。 在“项目管理 > 作业”页签中，单击“上传作业”，在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具，执行health get job -s命令获取创建作业的yaml模板，复制模板并保存到本地。可以保存成
com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 步骤2：获取Notebook基础镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像，依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像，您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。 先连接容器镜像服务，参考步骤1.连接容器镜像服务操作，然后使用如下的镜像地址拉取基础镜像。
图11 删除参数 配置好参数后变可以单击右上角“启动作业”按钮进行启动作业，同时会跳转回作业列表。 图12 作业列表 步骤4：查看作业运行状态、获取作业结果 在作业列表中，单击对应的作业名称，可查看作业运行状态，运行时间等信息。 图13 作业运行状态 单击具体的每个应用，可以查看每个应
health create workflow [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。获取流程模板方法请参见流程配置文件说明。 --description -d 否 流程的详细描述信息。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
打开一个Notebook实例。 在Jupyter控制面板中，选择“New”（新建）然后选择“Terminal”。 在代码输入栏输入以下命令，获取激活TensorFlow-1.8的命令并激活环境。 cat /home/ma-user/README source /home/ma-us
名下没有项目时，才可以被移除。在用户的操作列，单击“移除”，移除对应的用户。 图2 移除子用户 安全设置 在用户管理页面，可以重置用户的邮箱、手机号和密码信息。在用户操作列，单击“安全设置”，重置用户的相关信息。 图3 重置用户信息 配额设置 您可以对用户管理中的某个用户设置配额
启动作业。 步骤5：获取分析结果 在“作业”列表中，可单击作业名称查看作业信息和输入输出数据。 图8 查看作业信息 单击输出路径，可跳转至输出文件位置。html文件支持在线预览，zip文件可下载至本地查看。 图9 输出数据 图10 预览html文件 图11 获取zip文件 父主题：
为了保证平台业务安全，您在平台内购买的计算资源，将部署在独立的、专属资源池中。Notebook与流程作业均在此资源池运行，其中Notebook启动用户为health-user，流程作业默认启动用户为root。 平台提供了必要的加固措施以保证容器安全、隔离性及数据安全，但由于容器技术
应用的详细描述。 --commands -c 否 镜像启动命令。设置方法请参见创建FastQC应用样例。 --image -i 否 镜像地址。获取方法请参见获取镜像地址。 --labels -l 否 标签，多个标签使用;符号分隔开。 --nodeLabels -n 否 用于让应用调度到设置了该标签的节点上。
health create app [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的应用模板路径。获取应用模板方法请参见应用配置文件说明。 --description -d 否 应用的详细描述信息。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
--io-acc-id -c 否 IO加速实例id，为空则不开启IO加速，设置相应加速包id将会开启加速。实例id可参考“系统设置命令>获取系统资源”章节获取。当id设置为：auto_schedule，则会自动调度加速包，当id设置为local_disk，则开启本地盘加速。 --nodeLabels
用户管理介绍 EIHealth平台支持两种类型的用户管理，可以帮助您安全地控制平台的访问和使用权限。 表1 用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理 系统级的角色配置，可创建平台的子用户，并为其分配权限。 项目级别用户管理 资源级的角色配置，以项目为粒度对数据、分析作业、开发环
RUN yum makecache && \ yum install -y make gcc ncurses-devel bzip2-devel xz-devel zlib-devel&& \ cd /usr/local/bwa-0.7.17 && make && \
-t 否 镜像类型，只支持APP或者NOTEBOOK。 --description -d 否 镜像描述。当描述中带有空格时，需要添加引号来获取完整的描述信息。 --chip -c 否 镜像芯片类型，只支持ARM或者X86。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
镜像命名不规范 镜像版本不存在 上传镜像数量超出配额 待上传项目不存在 对于--description 参数，当描述中带有空格时，需要添加引号来获取完整的描述信息。 父主题： 镜像管理命令
git yum -y install gcc automake autoconf libtool make yum install -y zlib zlib-devel 安装bwa软件，在github上下载bwa的源代码，并使用make编译。 yum install bwa git clone
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