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EIHealth流程管理命令 流程配置文件说明 创建流程 修改流程 查询流程 删除流程 导入流程
Nexflow流程管理命令 创建流程 修改流程 查询流程详情 删除流程
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
工具管理 工具管理简介 新建应用 导入应用 上传应用 发布应用 编辑应用 创建FastQC应用样例 新建流程 流程设计器 导入流程 上传流程 发布流程 添加分类标签 下载应用或流程 父主题： 用户指南（基因平台）
数据库管理 数据库简介 创建数据库模板 导入数据库模板 创建数据库 引用数据库 管理数据库 父主题： 用户指南（基因平台）
大规模药物虚拟筛选 “神农项目”简介 药物虚拟筛选 父主题： 用户指南（基因平台）
项目管理 项目简介 创建项目 项目成员和权限 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
数据管理 数据管理简介 添加数据 数据管理常用操作 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
用户指南（基因平台） 欢迎使用医疗智能体服务 关键概念 准备工作 用户管理 配额管理 系统设置 项目管理 数据管理 数据库管理 镜像管理 工具管理 作业管理 Nextflow 资产市场 开发环境（Notebook） 大规模药物虚拟筛选
genomeagent镜像 使用genomeagent镜像 genomeagent镜像功能点介绍 父主题： 资产市场
图解医疗智能体 AI药物研究 AI基因组研究
AI药物研究 父主题： 图解医疗智能体
流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置 直接挂载OBS目录进行大规模计算，如何解决偶现报错
盘古辅助药物 为什么下载的部分靶点文件，显示不完整 CSS常见问题
否 列举桶内分段上传任务。 --e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。 --t -n 否 指定用户的securitytoken。 --uploadIdMarker -u 否 列举桶内分段上传任务的起始位置，必须与--m
在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块，单击“安装”。 图1 安装Nextflow 选择安装方式。目前支持GitHub获取和上传安装包两种方式。 GitHub获取：可以选择版本，目前支持选择的安装包版本v22.10.6，v22.10.0，v22.04.0。 上传安装包：用户直接上
界面操作完成。在命令行工具中，该过程以配置文件的形式给出。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建应用，创建好的应用将同步显示到EIHealth平台。 获取应用模板 使用health get app -s命令获取创建应用的模板，复制模板并保存到本地，您可以保存成.yaml或.tx
查询类型，默认detail。此参数用于获取作业列表。 取值：logs、detail、reports 。 logs：获取job日志。 detail：获取job详情。 reports：获取job报告 。 --sortDir -d 否 排序规则，按创建时间排序，默认DESC。此参数用于获取作业列表。 取值：DESC、ASC。
查看作业进程 用户可以在“项目 > 作业”中查看药筛作业的后台进程。 图1 查看作业进程 对接完成后的小分子构象下载 单击应用中的“qvina-w”，获取输出结果的路径。 文件的命名方式为：蛋白质名称_vs_配体名称_blinddock.pdbqt。 图2 下载小分子构想数据 父主题： 运行大规模虚拟药筛任务
Notebook安装Conda指导 打开Notebook，在“File”页签下选择“Terminal”。 图1 选择Terminal 下载和安装Anaconda。 获取Repository和Anaconda安装包。 Repository: https://repo.anaconda.com/archive/index
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