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-file、threads,输出参数为output-dir,则镜像启动命令如下所示。 使用-t命令,指定运行所需的线程数量。-o命令,指定存放输出结果的文件夹。输入文件夹已在填写参数时指定。 fastqc -t ${threads} -o ${output-dir} ${input-file}
-file、threads,输出参数为output-dir,则镜像启动命令如下所示。 使用-t命令,指定运行所需的线程数量。-o命令,指定存放输出结果的文件夹。输入文件夹已在填写参数时指定。 fastqc -t ${threads} -o ${output-dir} ${input-file}
-r 列举路径中的对象时,需使用/xxx/格式,如示例中的/src/。 列举本地路径中的文件夹对象时,需要使用“路径/文件名”或“路径\文件名”格式。请依据操作系统的路径规范使用,如示例中的D:\local。 如果路径中带有特殊字符比如()之类的,运行的时候需要将整个路径用""括起
待计算路径:选择待计算的路径。待计算路径起点是中心配体名称,终点是其他配体的名称。在相似度计算完成之前默认未勾选。您也可以添加路径或者重置路径。添加路径和重置路径可以通过单击右边的“添加路径”或者“重置”进行操作。添加路径也可以在左侧微扰图中直接通过两个分子之间进行连线添加。可以在微扰图中单击某条待计算路径上的,删除该条待计算路径。
String 流程的子任务展示名称 output_dir String 子任务的输出存放路径 whole_output_dir String 子任务的完整输出路径,查看流程不会返回,查看作业时才会返回完整输出路径 io_acc_type String 子任务使用的IO加速类型,不填表示不使用;
和文件夹至本地data路径中。 health download /src/ D:\local\data --update -r 列举路径中的对象时,需使用/xxx/格式,如示例中的/src/。 如果路径中带有特殊字符比如()之类的,运行的时候需要将整个路径用""括起来,或者用\将字符转义,例如:health
防止特殊符号被操作系统转义,导致不可预期的结果。该匹配模式作用于对象全路径(含从根路径开始的对象前缀和对象名,例如,桶内对象路径为obs://bucket/src1/src2/test.txt,则对象的全路径为src1/src2/test.txt)。该匹配模式仅适用于对象名非“/”结尾的对象。
取值范围:0~16,默认为0。 内存 设置内存大小。 取值范围:2~512,默认为2。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标,设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据,可将数据提前上传至对应的OBS路径下。 包含本项目桶最多挂载6个,不包含本项目桶最多挂载5个。 用户
检查同一时刻投递作业的输出路径是否存在重复。若存在重复,则很有可能是并发写入同一个文件导致的异常,若不存在请联系服务技术支持解决。 解决方案 平台提供了作业级输出路径,流程级输出路径,子任务级输出路径用于做不同层级的文件隔离。如下图所示,如果三者填写的路径相同,请修改输出路径后重试,如果填写
列举路径中的文件夹对象时,需使用/xxx/格式,如示例中的/src/。 列举本地路径中的文件夹对象时,需要使用路径/文件名或路径\文件名格式,如示例中的D:\local。 如果路径中带有特殊字符比如()之类的,运行的时候需要将整个路径用""括起来,或者用\将字符转义,例如:health cp "/src2/abs(1)
通过VariantQC对vcf进行质量控制,输出变异数目,变异类型统计等指标。 流程优势 使用Unix管道技术连接比对和排序步骤,以缩短bwa和samtools的存放、读取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤,进行了系统的优化加速。流程从contig-file中提取contig,根据c
} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 path 是 String 对象全路径(项目名称:|路径) 最小长度:1
是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 path 是 String 审计日志全路径(路径) 最小长度:1 最大长度:2000 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是
0核。 GPU 设置GPU为1.0。 内存 设置内存大于50G。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标,设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据,可将数据提前上传至对应的OBS路径下。 包含本项目桶最多挂载6个,不包含本项目桶最多挂载5个。 用户
# 返回结果如下 create archive h-test2 successfully! Linux和macOS使用时,多个路径使用;进行分隔,整个路径使用''引起。例如: ./health create archive lmx-test-cli --path 'newjob/;output/'
0:srcproject。 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。 --summary -s 否 流程的简要描述。 --description -d 否 流程的详细描述。 --output_dir -o 否 输出路径。不指定时,以当前项目的根目录为工作路径。 --timeout -t 否 超时时间
BucketObjectDto objects 数据列表 表5 BucketObjectDto 参数 参数类型 描述 path String 对象全路径(项目名称:/路径) name String 名称 type String 类型 枚举值: FILE FOLDER size Long 大小 create_time
15.50:20202。 --log-path -l 否 日志路径,不填写时默认为命令行工具当前路径下healthcli.log文件。 路径设置格式: Windows系统为“路径\文件名”。 Linux系统格式为“路径/文件名”。 --http-proxy -p 否 HTTP代理
数据对象列表 bucket_size Long 桶存量 表5 TraceDataRsp 参数 参数类型 描述 path String 对象全路径(项目名称:/路径) name String 名称 type String 枚举值: FILE FOLDER size Long 大小 缺省值:0 create_time
支持设置最多15个数据的禁止删除状态。 如果平台或者父目录设置禁止删除状态,则对应的数据根路径或者子路径均为禁止删除状态,子路径不支持同时设置允许删除状态;如果平台或者父目录设置允许删除,则之前子路径设置的禁止删除权限失效,全部子路径允许删除。 删除数据 以下操作步骤是在“数据”页面删除数据。您也可以使用命令行工具实现数据的删除。