>> /etc/fstab 执行mount -a 备注: 192.168.0.15:/ 是从sfs turbo console中获取到的挂载的路径。 第1个1表示备份文件系统,第2个1表示从/分区的顺序开始fsck磁盘检测,0表示不检测,_rnetdev 表示主机无法挂载直接跳过,避免无法挂载主机无法启动。
集群创建完成后,如需查看集群所使用的共享存储的详细信息,可进入一站式HPC服务提供的“共享存储”页,查看例如集群所使用的SFS的名称和ID、存储协议、共享路径以及挂载点等信息。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“共享存储”。 在“共享存储”页,查看集群对应的共享存储的详细信息。 父主题:
将算例文件放到NAS存储中,华为云SFS Turbo提供按需扩展的高性能文件存储,并针对HPC有优化,建议直接使用华为云SFS Turbo存放算例文件。 HPC仿真软件STAR-CCM+需要每个节点都安装,比较麻烦,可以将STAR-CCM+直接安装在NAS存储中,每个节点直接将N
配置lammps 算例输入文件。 以melt为例,生成一个算例melt.in文件。设置每迭代100步生成一个checkpoint文件,假定该文件存放在共享目录“/share”中。内容如下: # 3d Lennard-Jones melt units lj atom_style
/home/rhel/hello 图2 集群上运行MPICH成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景)
pt/Siemens/license.dat” >> /root/.bashrc 运行Platform MPI下的STAR-CCM+ 设置路径。 将/etc/ld.so.conf.d/ibm_mpi.conf中内容改为如下内容: /opt/Siemens/15.02.009-R8/STAR-CCM+15
/home/rhel/hello 图2 集群上运行社区OpenMPI成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景)
回显如图2所示,显示集群中所有BMS的主机名,则表示hostfile文件配置成功。 在任意一台BMS中执行以下命令,运行MPI benchmark,运行时指定hostfile路径。 以两个BMS为例: $ mpirun -np 2 -pernode --hostfile hostfile -mca btl_openib_if_include
/home/rhel/hello 图3 集群上运行社区OpenMPI成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景)
-machinefile hostfile /root/platform_hello hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 图3 集群上运行Platform MPI成功 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用
回显如图3所示,显示集群中所有BMS的主机名,则表示hostfile文件配置成功。 在任意一台BMS中执行以下命令,运行MPI benchmark,运行时指定hostfile路径。 以两个BMS为例: $ mpirun -np 2 -pernode --hostfile hostfile -mca btl_openib_if_include
/home/rhel/hello 图3 BMS集群上Platform MPI运行成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景)
执行以下命令,安装需要的库文件。 # yum install glibc.i686 libgcc-4.8.5-11.el7.i686 增加执行权限,例如安装包所在路径为/root。 # cd /root && chmod +x platform_mpi- 09.01.04.03r-ce.bin 执行以下命令,安装Platform
/root/spe_hello 图1 在集群上通过Spectrum MPI运行可执行文件 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用
/home/rhel/hello 图3 集群上运行Spetrum MPI成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景)
理功能。 共享存储 HPC-S²的管理控制台提供了HPC-S²集群所对应的存储信息,通过弹性文件服务(SFS)为集群中所有节点提供文件共享路径。 任务管理 HPC-S²的管理控制台提供了HPC-S²集群相关的任务队列、动态调度、亲和性调度、负载重组及基于CPU、内存、实例Instance的quota管理的功能。
/home/rhel/hello 图3 BMS集群上运行Intel MPI成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景)
hostfile -np 12 /root/intel_hello hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 图3 集群上运行Intel MPI成功 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用
费。 请不要在ECS控制台对HPC集群中的节点进行操作,以免集群出现异常。 请勿修改或删除“/usr/local/.hpccluster”路径下文件内容,以免造成集群异常。 “/usr/local/.hpccluster/role/.ssh/”下的“authorized_keys”仅用于系统维护。
资源和成本规划 所需资源如表1所示,具体资源的实际费用请以对应官网价格显示为准。 表1 资源和成本规划 序号 资源 资源说明 获取路径 数量 费用 1 STAR-CCM+ 使用STAR-CCM+15.02版本。 建议从官方网站获取 1 以官网显示价格为准。 2 MPI(可选) Plateform
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