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根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容 功能介绍 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/toolkit/surface-points
通过引用本地标准的workflow yaml文件创建workflow。 命令结构 health nextflow create workflow [params] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --workflow -w 是 本地workflow文件路径,可以是zip或nf文件。 --name
/v1/{project_id}/system/computing-resources 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述
对情况的计算评估,让研究人员可以同时从21个蛋白的角度,综合、无偏地评估药物效果,从而为后续的药物机制研究、临床试验提供线索。 本案例介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能复现上述研究成果(https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c00821),并搭建虚拟药物筛选数据库。
task <task-id> --jobId <job-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 task-id 不涉及 否 任务id,如果不传,那么获取的是任务列表。 --type -t 否 查询类型。 默认detail。 取值:logs、detail
场景5:并发投递多个作业后,部分作业运行失败,日志中显示IO读写相关错误。 场景6:作业投递后运行失败,日志显示File name too long。 场景7:同时复制多个文件,日志中显示cp: will not create hard link相关错误信息。 场景1 作业投递后处于运行中,运行过程正常,但是最后超时失败。
objects 用户已开启的自定义属性集合 表6 PlainMoleculeItem 参数 参数类型 描述 smiles String 分子SMILES表达式 props Array of objects 分子ADMET属性值列表 表7 OptimizationResultItem
Vina Score:代表分子如果添加了靶点,将会计算对接结合能,并按照Vina Score进行排序 Score:代表优化后小分子的综合打分。 Similarity:代表优化后的分子与原始分子的相似度。 QED:代表分子的成药性。 SaScore:代表合成可及性分数,旨在评估分子的合成难易程度。
每个分子卡片上会展示相应分子序号与对应的参数Vina Score、QED、SaScore Vina Score:代表分子如果添加了靶点,将会计算对接结合能,并按照Vina Score进行排序 QED:代表分子的成药性。 SaScore:代表合成可及性分数,旨在评估分子的合成难易程度。 查看作业信息 点击作业的“作业信
后续使用过程中,也可根据使用情况随时购买资源。 资源看板 在“资源看板”中,您可以实时监控计算资源、存储资源、性能加速、数据库的使用情况。 您可以选择统计“近1小时”、“近3小时”、“近12小时”、“近24小时”、“近7天”、“近30天”的资源使用情况,在“周期”中设置统计周期时
- 128 enum Array of strings 枚举参数的取值列表,列表最大长度20,每一项字符串最长128。参数类型为ENUM时需要填此字段 最小长度:0 最大长度:128 数组长度:0 - 20 表11 AppOutputParameterDto 参数 参数类型 描述 name
-l 否 代表当次请求获取的最大条数。此参数用于获取作业列表。 默认值:100。 --offset -o 否 代表从哪个位置开始。默认为0。此参数用于获取作业列表。 --jobName -j 否 作业名。此参数用于获取作业列表。 --labels -a 否 按标签筛选列表,标签间用
在流程设计器左侧应用列表中选择fastp、bwa-mem应用,并使用鼠标拖拽至画布中。 将fastp的输出参数fq-file1、fa-file2和bwa-mem的输入参数fq-filefq-file2相连。 图2 fastp、bwa-mem连线关系 在流程设计器左侧应用列表中选择qual
指定具体文件进行拷贝,将src2中的abc.txt文件拷贝至src1中。 health cp /src2/abs.txt /src1/ -f # 返回结果如下 copy project file successfully! 不指定具体文件进行批量拷贝,将src1中的所有文件拷贝至src2中。 health
若设置了该参数,必须确保更新了配置文件中客户端跨区域复制的相关配置信息,具体可参考更新配置文件。复制时源桶对应的配置信息为配置文件中的:akCrr/skCrr/tokenCrr/endpointCrr,目标桶对应的配置信息为配置文件中的:ak/sk/token/endpoint。
合成路径规划结果字典 表6 result 参数 参数类型 描述 molecules Array of molecules objects 分子合成规划中的分子 reactions Array of reactions objects 分子合成规划中的反应列表 synthesis_routes
获取子任务中实例的pod信息 功能介绍 获取子任务中实例的pod信息 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/{job_id}/tasks/{task_name}/instance
赖的运行环境的镜像封装,应用可以独立使用,也可以将多个应用编排入流程串联使用。 您可以在项目的应用列表中,查看隶属于该项目的应用,也可以通过搜索应用名称快速查找所需应用。应用列表展示了应用的名称、版本、创建者、修改时间、创建时间和可执行的操作。 详细的应用创建和使用请参见工具管理。
最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Toke
oken的值即为Token。 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Integer 事件条数 events Array of EventRsp objects 事件列表 表5 EventRsp 参数 参数类型 描述 type String