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MMPS， GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持，如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例，介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令，安装FFTW软件。 yum install gcc-gfortran gcc-c++
安装和使用Spectrum MPI 操作场景 本节指导用户在BMS集群上安装和使用Spectrum MPI应用（以版本10.01.01为例）。 对于集群中的每台BMS，都需要执行该操作。 背景信息 IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下： IBM
第1个1表示备份文件系统，第2个1表示从/分区的顺序开始fsck磁盘检测，0表示不检测，_rnetdev 表示主机无法挂载直接跳过，避免无法挂载主机无法启动。 设置服务开机自启动 systemctl enable rpcbind systemctl enable nfs 父主题： 实施步骤
方法二：使用已有节点部署HPC集群 操作场景 如果用户需要使用已有的ECS节点资源构建HPC集群，可以使用该功能进行集群的部署。下面介绍如何使用已有节点部署HPC集群。 使用已有节点部署集群，首先选择管理节点，再选择计算节点，切换计算节点与管理节点需要有相同的CPU架构，需要在相
为用户提供专属的物理服务器，提供卓越的计算性能，满足核心应用对高性能及稳定性的需求，结合了传统托管服务器的稳定性与云中资源高度弹性的优势。 对象存储服务（OBS） 是一种基于对象的海量存储服务，为用户提供海量、低成本、高可靠、高安全的数据存储能力。 弹性文件服务（SFS） 为用户的弹性云服
执行以下命令，验证参加测试的ECS之间是否可以免密码互相登录。 假设集群中有2个弹性云服务器，另一个云服务器的主机名为hostname2，则命令行为： $ ssh 用户名@SERVER_IP $ ssh hostname2 父主题： 弹性云服务器场景典型应用
以华为云管理控制台显示为准。 7 云硬盘（EVS） 为ECS、BMS等计算服务提供持久性块存储的服务。 华为 >1 以华为云管理控制台显示为准。 8 对象存储服务（OBS） 提供海量、安全、高可靠、低成本的数据存储能力。 华为 >1 以华为云管理控制台显示为准。 9 镜像服务（IMS） 提供镜像（R
STAR-CCM+部署HPC集群流程图 本文档介绍如何通过仿真软件STAR-CCM+部署HPC集群，流程如图1所示。 图1 基于STAR-CCM+部署HPC集群流程图 父主题： 基于STAR-CCM+部署HPC集群
创建支持IB网卡的弹性云服务器 操作场景 您可以在几分钟之内快速获得基于公有云平台的弹性云服务器设施，并且这些设施是弹性的，可以根据需求伸缩。该任务指导用户如何创建支持IB网卡的弹性云服务器，包括管理控制台方式和基于HTTPS请求的API（Application programming interface）方式。
操作场景 该任务指导用户在单个弹性云服务器内执行相关配置，使其可以免密登录。 背景信息 $：表示在普通用户下，执行相关操作。 #：表示在管理员用户下，执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户，请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建弹性云服务器，并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤
鲲鹏裸金属服务器支持使用的MPI HPC当前支持的MPI包括： 驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI MPICH 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用，您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题： 安装和使用MPI（鲲鹏BMS场景）
HPC-S²与其他服务的关系 服务名称 HPC-S²与其他服务的关系 主要交互功能 弹性云服务器（ECS） 购买弹性云服务器创建HPC集群或使用已有弹性云服务器部署HPC集群。 自定义购买ECS 虚拟私有云（VPC） 同一个HPC场景的云服务器，都位于同一个VPC中，并且需要使用
创建裸金属服务器集群 操作场景 若您需要将您的服务部署在裸金属服务器上，首先需要购买裸金属服务器。 购买须知 专属物理资源 如果您希望裸金属服务器运行在隔离的专属区域，请您先申请专属云，再创建裸金属服务器。 了解和申请专属云，请参见《专属云用户指南》。 如果您希望裸金属服务器拥有独
图1 我的配额 您可以在“服务配额”页面，查看各项资源的总配额及使用情况。 如果当前配额不能满足业务要求，请参考后续操作，申请扩大配额。 如何申请扩大配额？ 登录管理控制台。 在页面右上角，选择“资源 > 我的配额”。 系统进入“服务配额”页面。 图2 我的配额 单击“申请扩大配额”。
安装和使用MPI 弹性云服务器场景支持使用的MPI IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题： 弹性云服务器场景典型应用
裸金属服务器场景典型应用 创建裸金属服务器集群 配置BMS集群互相免密登录 安装和使用MPI（X86 BMS场景） 安装和使用MPI（鲲鹏BMS场景） 在HPC集群上运行MPI应用（X86 BMS场景） 在HPC集群上运行MPI应用（鲲鹏BMS场景）
1版本的OpenMPI为例）。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时，需要同时使用Mellanox的HPC-X 套件，HPC-X 的下载需要参考弹性云服务器操作系统的版本以及IB驱动版本，
RoCE RoCE概念 RDMA over Converged Ethernet (RoCE)是一种网络协议，允许应用通过以太网实现远程内存访问。目前RoCE有两个协议版本，v1和v2。其中RoCE v1是一种链路层协议，允许在同一个广播域下的任意两台主机直接访问。而RoCE v
进入弹性云服务器信息页面。 单击“创建弹性云服务器”，开始创建应用集群。 按照界面提示，填写弹性云服务器的参数配置，详细操作请参见创建支持IB网卡的弹性云服务器。其中， 规格：需与转化的私有镜像的云服务器规格保持一致。 镜像：选择“私有镜像”，然后选择制作私有镜像中制作的私有镜像。 虚拟私有云：集群中的
企业分支、科研组织机构等跨全球地理位置进行及时协同工作，提高效率。 可以利用公有云的跨地域能力，共享计算资源，海量数据，并能实现云端大数据分析。 优化性能 性能比普通云服务器大幅提升。 通过虚拟化优化（SR-IOV、PCI直通）等，各类测试报告显示：大规模云化HPC性能损耗不大。 约束与限制 MPI和通讯库的
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