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”即可创建。 下载3D:如果分子设置了靶点,可以单击“下载3D”下载优化后的小分子或者复合物,如果分子未设置靶点,单击“下载3D”只能下载小分子,小分子支持SDF和PDB格式,复合物只支持PDB格式。 每个分子卡片上会展示相应分子序号与对应的参数Vina Score、QED、SaScore
可以以列表的形式查看分子生成的作业,单击左上角“下载”,下载分子生成的结果或者分子3D构象。如果分子设置了靶点,可以下载小分子或复合物,若分子未设置靶点,只能下载小分子。小分子支持SDF和PDB格式,复合物只支持PDB格式。 分子生成对应的下游分析为分子搜索、分子优化和合成路径规划,如果
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在配置页面,选择靶点文件、探针文件,配置相关参数信息。 靶点文件:支持PDB格式文件。 探针文件:探针分子建议原子数不超过400,分子量过大可以通过增大探针半径降低失败率,但无法保证一定成功。支持SDF、MOL2、PDB格式文件。若文件中含有多个配体,默认只处理第一个。 时间步长: 默认值为0
流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置 直接挂载OBS目录进行大规模计算,如何解决偶现报错
项目管理 收藏管理 镜像管理 标签页面管理 项目审计管理 虚拟药物筛选 父主题: API(医疗智能体平台)
project时,默认为当前项目。例如GATK:4.0:projectname。 --sample -s 否 获取应用模板,模板为yaml格式。 --downloadPath -d 否 获取应用详情时,将内容下载到的指定文件夹路径(文件夹需要存在)。 --project 无 否
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列举路径中的文件夹对象时,需使用/xxx/格式,如示例中的/src1/和/src2/。 如果路径中带有特殊字符比如()之类的,运行的时候需要将整个路径用""括起来,或者用\将字符转义,例如:health cp "/src2/abs(1).txt" /src1/ 或者 health cp /src2/abs\(1\)
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您可以使用该工具创建、获取、删除和导入数据库模板,创建、获取和删除数据库实例,也可以引用数据库。 镜像管理 您可以使用该工具对镜像执行标记、上传、下载、查询、导入、更新和删除标签等操作。 应用管理 应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 您可以使用该工具创建应用,并进行修改、删除、查询、导入操作。
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