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单击“立即使用”，进入输入分子页面。 图1 输入分子页面 在白框内输入需要优化的小分子SMILES表达式或者上传分子文件。 上传的文件支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式。 图2 输入分子 单击“下一步”，进入靶点设置，此步骤为可选步骤，如果需要设置靶点，并且将对接结合能作为
最小长度：1 最大长度：128 image_name String 镜像名 最小长度：1 最大长度：128 image_tag String 镜像tag名 最小长度：1 最大长度：64 profile String 系统镜像名 枚举值： PY3 表9 NotebookStorage 参数
EIHealth终端节点名称，请在地区与终端节点中获取。 --swr-endpoint -t 否 SWR镜像仓库地址。 获取方式： 登录容器镜像服务管理控制台。 单击界面右侧“登录指令”，获取内网登录指令末尾的SWR镜像仓库地址。例如100.78.15.50:20202。 --log-path -l 否
单击“合成路径规划”功能卡片，进入配置页面。 在配置页面，可以在左侧绘制分子，也可以通过上传分子文件方式上传分子或者在白框内输入小分子SMILES表达式。 上传分子文件：支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件。 最大搜索路径个数：合成路径规划的路径数量。路径数量增加，将展示更多的合理合成路径；路
运行作业 方式1：使用预置的NGS流程 方式2：使用预置应用搭建NGS流程 方式3：自定义镜像运行FastQC流程
String 磁盘类型 space String 磁盘大小 表7 ImageDto 参数 参数类型 描述 type String 镜像类型 version String 镜像版本 请求示例 查询计算资源列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.
系统级的角色配置，可创建平台的子用户，并为其分配权限。详细介绍请参见用户管理。 项目级别用户管理 资源级的角色配置，以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组，以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。详细介绍请参见项目管理。 表2 盘古辅助制药平台用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理
划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。 - labelA - labelB image: 'gwj-test-01/busybox:latest' # docker镜像地址取值范围[1-255]，不能包含中文字符，格式为{project-name}/
HTTP代理配置，格式为“http://username:password@your-proxy:your-port”。 --swr-endpoint -t 是 SWR镜像仓库地址。 获取方式： 登录容器镜像服务管理控制台。 单击界面右侧“登录指令”，获取内网登录指令末尾的SWR镜像仓库地址。例如100
前默认未勾选。您也可以添加路径或者重置路径。添加路径和重置路径可以通过单击右边的“添加路径”或者“重置”进行操作。添加路径也可以在左侧微扰图中直接通过两个分子之间进行连线添加。可以在微扰图中单击某条待计算路径上的，删除该条待计算路径。 图2 添加或者删除待计算路径 图3 选择配体对
EIHealth终端节点名称，请在地区与终端节点中获取。 --swr-endpoint -t 否 SWR镜像仓库地址。 获取方式： 登录容器镜像服务管理控制台。 单击界面右侧“登录指令”，获取内网登录指令末尾的SWR镜像仓库地址。例如100.78.15.50:20202。 --log-path -l 否
算结果等。 容器镜像服务（SWR） 容器镜像服务（Software Repository for Container，简称SWR）是一种支持镜像全生命周期管理的服务，提供简单易用、安全可靠的镜像管理功能，帮助您快速部署容器化服务。 医疗智能体使用SWR存储工具镜像，包括内置工具及自定义工具的存储。
本示例中NGS流程基于医疗智能体（EIHealth）平台搭建，流程以fastq格式数据作为输入，对碱基的质量信息进行评估，判断可靠程度，通过质控、比对、变异检测等步骤，最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 该案例介绍NGS的搭建步骤，涵盖镜像、应用、流程制作方法。用户也可以使用“资产市场”提供的已经搭建好的“Variant
相关文档 1 医疗智能体EIHealth平台迭代更新 资产市场，提供官方发布的镜像、数据、应用、流程资产。 提供了数据库的创建、查询和管理能力。 支持药物虚拟筛选能力。 命令行工具迭代更新。 开放镜像管理类API。 商用 用户指南 命令行工具 API参考 2021年3月 序号 功能名称
选择文件：支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件; 小分子支持10-10000个。如果没有初始数据集，可以选择官方库，ZINC数据集。 图1 输入初始数据集 手动输入：最少输入10行，最多输入10000行，每行字符不超过512; SMILES不支持输入空格或者中文 单击“下一步”，进入靶点
项目管理 镜像管理 标签页面管理 项目审计管理 虚拟药物筛选 父主题： API（医疗智能体平台）
单击“分子对接”功能卡片，进入分子对接受体预处理页面，单击上传受体文件，进行受体蛋白预处理配置。 受体文件仅支持PDB格式，若文件中存在多个受体，默认只处理第一个。受体文件支持上传1个或者多个文件，最多支持输入20个受体文件，文件来源包含数据中心、PDB库、示例数据。 图1 上传受体文件 受体预处理参数配置。
vcf文件生成数据库。创建的数据库需要保证数据文件与模板对应。创建数据库时，可以不选择导入的数据文件，建立空的数据库，后期可以新增数据行或者导入数据。如果使用自动作业的数据表创建数据库，在导入数据，需要参照数据库模板格式进行导入。 您可以导入本项目或使用其他项目中的数据生成数据库。 选择好文件后，通过设置数据的分隔符、跳过的行数来设置有效数据的起始位置。
NGS流程 使用Docking Summary流程 使用RNA-Seq Analysis Based on STAR流程 使用AutoGenome镜像 父主题： 用户指南（基因平台）
数据的分析。 平台由项目管理、数据管理、作业、工具、开发环境、镜像等核心部件组成，各个部件沉淀了丰富的技术细节和人性化的设计。 初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 使用流程 EIHealth提供了个性化分析
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