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台云服务器,并使用快照方式制作bwa镜像。 购买弹性云服务器。 云服务器创建成功后,在云服务器列表页,选中待登录的弹性云服务器。单击“远程登录”,输入ECS初始账号,登录ECS。 图1 云服务器列表 安装容器引擎。 例如,在Linux操作系统下,可以使用如下命令快速安装容器引擎。
最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应
过质控、比对、变异检测等步骤,最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 该案例介绍NGS的搭建步骤,涵盖镜像、应用、流程制作方法。用户也可以使用“资产市场”提供的已经搭建好的“Variant Calling Based On NGS”流程。该案例比“资产市场”流程多出VCF文件进行质控步骤。
反复利用并也可以让其他人很容易的使用,不用担心复杂的开发环境问题。 流程是由1各或者N个应用串联构建而成,平台页面以简单拖拽、连接的方式将不同的应用连接起来构建成一个分析流程,避免了写繁杂的bash脚本。 步骤1:订阅应用 进入资产市场,分别订阅fasp,bwa-mem,bamq
最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应
获取项目ID 从控制台获取项目ID 在调用接口的时候,部分URL中需要填入项目编号,所以需要获取到项目编号。项目编号获取步骤如下: 登录管理控制台。 单击用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。 在“API凭证”页面的项目列表中查看项目ID。 图1 查看项目ID 调用API获取项目ID
String 集群id。 最小长度:1 最大长度:128 user_name 是 String 集群用户账号。 最小长度:4 最大长度:32 user_pwd 是 String 集群用户密码,长度限制为[8,32]。 最小长度:8 最大长度:32 响应参数 状态码: 201 表4 响应Body参数
[flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 member-name 无 是 用户名称。 --project -p 否 项目名称,不填时默认为当前所在项目。 --role -r 是 用户项目角色,只支持Administrator,Developer,Uploader或者Viewer。
FOLDER size Long 大小 缺省值:0 create_time String 创建时间 download_url String 下载链接 请求示例 查询审计日志列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{proj
最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应
删除项目 使用delete命令删除项目。项目的所有者有权限执行该操作。 为了防止项目误删,执行项目删除命令后工具会提示用户进行二次确认输入要删除的项目,只有二次输入的项目名称和命令中的项目名称一致,命令行工具才会执行删除动作。 命令结构 health delete project
String 作业子任务的并发实例运行结束时间 actual_running_time Integer 作业子任务的并发实例实际运行时间 status String 作业子任务的并发实例运行状态 log_storage_link String 作业日志存储链接 pod_create_time
最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。 Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响
单击平台右上角的账号名称,会出现账号的相关操作,包括系统资源,系统配置等。注意这里只有管理员账号有系统资源,系统配置等操作,具体说明请参见用户管理。 图1 系统资源 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
String 分子生成任务ID 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户 token 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 status String 异步任务的状态:等待中、运行中、已完成、失败
最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应
最大长度:128 user_id 是 String 被移除项目的用户id 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token
user_id 是 String 更新或者添加项目成员角色的用户id 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token
最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应
最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 login_cmd String 临时登录指令 请求示例 查询镜像仓库登录指令 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_