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template_id String 生成study作业结果的模板id database_name String study作业结果的数据库实例名称 database_id String study作业结果的数据库实例id relative_path String 生成study作业结果的文件的相对路径
最大长度:128 database_name 是 String 数据库名称 最小长度:3 最大长度:32 relative_path 是 String 生成数据库实例的文件相对路径 最小长度:0 最大长度:1024 output_file_type 是 String 生成数据库实例的文件类型。枚举值:csv、txt、vcf
如何将生物信息学软件封装为镜像并上传 本章节提供了在EIHealth平台创建FastQC应用的样例,帮助您快速熟悉平台的使用方法。 FastQC是一款高通量序列数据的质量检查工具,此样例基于开源的FastQC软件,将软件制作成镜像,上传至平台,并基于此镜像创建应用。应用创建完成后
根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容 功能介绍 根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_
获取生成study作业3D结构的内容 功能介绍 获取生成study作业3D结构的内容 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project
根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容 功能介绍 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/toolkit/surface-points
直接挂载OBS目录进行大规模计算,如何解决偶现报错 问题现象 运行作业时,作业直接挂载OBS目录进行大规模计算。偶现“异常应用”,并日志报错input/output error或file xxx not exists。 问题原因 OBS集群到计算集群之间的带宽达到了上限。 OBS集群的IOPS达到了上限。
license: "" health get app -s 获取app.yaml模板,以yaml格式打印到控制台 app: # 系统唯一标识,由系统随机分配,说明如下: # 1. 通过文件创建app时(UI\CMD),id必须为空,不允许指定 # 2. 通过文件修改app时(CMD),id为空或与命令行中指定的保持一致
过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 health delete database instance 12345678 # 返回结果如下 delete database successfully! 父主题: 数据库管理命令
创建数据库实例 使用create命令创建数据库实例。 命令结构 health create database instance <instance-name> [flags] 或者 health create db instance <instance-name> [flags]
配体注释信息数据库,并提供对应的数据库模板。您可以在“数据库”页签单击“shennongProject-database”和“ligandAnnotation-database”数据库查看数据库详情,在“模板”页签单击“shennongProject”和“ligandAnnotation”查看模板详情。
csv,修改描述为simple database。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug/drug-database/{database_id} { "description" : "simple database", "file" :
设计方式:支持侧链修饰、骨架跃迁、片段生长和从头生成四种方式。 侧链修饰:会在不同的侧链上进行侧链生长,生成新颖小分子。 骨架跃迁:会替换您所去掉的关键骨架,生成新颖的小分子。 片段生长:选择保留部分片段后,会在您删除的方向进行补充,生成新颖的小分子。 从头生成:通过指定的口袋从头生成小分子。 选定设计方式后,上传靶点结构,并配置其他参数。
医疗智能体平台支持根据靶点蛋白和小分子药物的3D结构,计算蛋白与药物之间的结合能量,进而预测小分子是否有成为候选药物的可能性。 虚拟药物筛选可实现如下功能。 整合分子对接结果,生成结合能矩阵。 整合受体与分子对接产生的配体构象,用于可视化展示。 对配体分子进行注释,包括DrugBank编号、分类、化学式、XLOGP3
/v1/{project_id}/drug/databases/{database_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 database_id 是 String 数据库id。 最小长度:1
删除数据库资源 功能介绍 删除数据库资源 URI DELETE /v1/{project_id}/system/database-resources/{id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
py37 生成Notebook kernel。 conda install -n py37 ipykernel python -m ipykernel install --user --name py37 --display-name "conda_py37" 使用新生成的Notebook
查询数据库资源 功能介绍 查询数据库资源 URI GET /v1/{project_id}/system/database-resources 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
输出路径:存放输出结果的路径,格式以/开头。例如项目中的output文件夹,输出路径可设置为/output。 不填写路径时,默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。 优先级:运行优先级,分为0~9级,优先级高的作业会被优先执行(该特性规划中,暂未上线)。 计算节点标签:作业会调度到含有相应标签的计算节点上。
/v1/{project_id}/drug/databases/{database_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 database_id 是 String 数据库id 最小长度:1