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--createStartTime -c 否 最小创建时间,格式:YYYY-MM-DD HH:MM:SS。例子:"2006-01-02 15:04:05"。此参数用于获取作业列表。 --createEndTime -e 否 最大创建时间,格式:YYYY-MM-DD HH:MM:SS。例子:"2006-01-02
命令的用户目录的子文件夹.obsutil_output。 结果清单文件命名规则:rm_{succeed | failed}_report_时间_TaskId.txt。单个结果清单文件默认情况下最大为30MB且最大可保留的文件个数为1024,可在配置文件中通过recordMaxLo
都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。 超时时间:作业运行时间超过设置时间时,认为超时,默认1440分钟,最大可设置为144000分钟,即作业运行至多100天。 加速类型: 加速效率:IO加速>本地盘加速>无
String 任务启动事件详细信息 first_timestamp String 任务启动事件首次上报时间 last_timestamp String 任务启动事件末次上报时间 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "count" : 0, "events"
String 镜像版本名称 size Long 镜像版本大小 create_time String 镜像版本创建时间 update_time String 镜像版本更新时间 path String 镜像地址 请求示例 查询镜像版本列表 https://eihealth.cn-north-4
描述信息 labels Array of strings 流程标签 create_time String 创建流程时间 update_time String 更新流程时间 user_name String 创建用户名称 source_project_name String 源项目名称
应用描述 labels Array of strings 应用标签 create_time String 创建应用时间 update_time String 更新应用时间 user_name String 创建应用的用户名 source_project_name String 源项目名称
String 任务启动事件详细信息 first_timestamp String 任务启动事件首次上报时间 last_timestamp String 任务启动事件末次上报时间 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "count" : 0, "events"
描述信息 labels Array of strings 流程标签 create_time String 创建流程时间 update_time String 更新流程时间 creator String 创建用户名称 source_project_name String 源项目名称 source_resource_id
进入“专题”页签,单击“新建研究”。 填写任务的基本信息,包括选择任务所属项目,研究的名称和描述。 图1 基本信息 选择配体分子和受体蛋白。 作业名称:自定义名称。 类型:选择小分子化合物。 流程:选择从资产市场中订阅的“Docking Summary”流程。 配体分子:配体分子文件,支持SMILES、3D
执行状态。同时,平台针对该类任务支持您在“数据中心 > 数据作业”中查看任务的执行信息。在数据作业页面,支持通过作业类型、状态、创建时间、完成时间来进行搜索。 数据作业支持取消、删除、重试操作,三种操作均支持批量操作。 取消:一个数据作业中,单个数据操作执行过程为原子性操作,即要
选择某些残基来作为口袋位置。 自动预测 如果受体口袋位置未知,可以使用自动预测软件来进行口袋位置预测。 全局对接 将整个受体作为口袋位置。 自定义 手动修改口袋位置和大小。 padding 口袋位置放大多少尺寸。 配置成功后,单击“提交”。 查看分子对接结果。 如果是多受体对多配体,
自己的分析流程。 使用流程 EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用,并将其编排调度,形成自定义分析流程。 同时集成了基于开源的Jupyter Notebook,可为您提供在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码。 图1 使用流程
在图2中,页面最右侧显示结合能的最大值和最小值,以及对应的列名称、行名称。 单击列名称或行名称,在弹窗中单击图标,可以对结合能数据进行排序。 单击图标,在弹窗中可以自定义选择要显示的列。 图1 神农项目 图2 药物筛选结果 父主题: 大规模药物虚拟筛选
归档存储适用于很少访问(平均一年访问一次)数据的业务场景,例如:数据归档、长期备份等场景。归档存储安全、持久且成本极低,可以用来替代磁带库。为了保持成本低廉,数据取回时间可能长达数分钟到数小时不等。 归档数据的长期存储,存储单价更优惠。 父主题: 数据管理
量过大可以通过增大探针半径降低失败率,但无法保证一定成功。支持SDF、MOL2、PDB格式文件。若文件中含有多个配体,默认只处理第一个。 时间步长: 默认值为0.002ps,输入范围:0.001<dt<=0.002,单位:ps。分子动力学模拟的步长,建议不超过0.002ps,步长越大,越难收敛。
序,只需要关注“数据流”即可。流程中的每个process可以通过配置文件快速的定制并行执行的样本数目,大大节约了生信人员搭建组学分析流程的时间。 医疗智能体(EIHealth)平台集成了Nextflow框架,支持用户直接在医疗智能体(EIHealth)平台安装Nextflow。 父主题:
String 区域 paths Array of strings 归档数据路径集 start_time String 归档开始时间 end_time String 归档结束时间 archive_days Integer 已归档天数 size Long 大小 description String
NextflowParamsDto objects 流程参数列表 create_time String 流程的创建时间 update_time String 流程的更新时间 source_project_name String 源项目名称 source_resource_id String
作业状态。 type String 作业类型。 create_time String 作业创建时间。 finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示,当作业执行失败时会返回。 user_name