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导入网络数据。导入网络数据时给予消息提示,导入结果给予消息提示。 SUBSCRIBE_DATA 订阅数据。订阅数据时给予消息提示,订阅结果给予消息提示。 DATABASE_IMPORT 导入数据库。导入数据时给予消息提示,导入结果给予消息提示。 JOB_STATUS 作业状态。作业的状态发生跳变时给予消息提示。 MESSAGE_CLEAN
图2 基本信息 选择镜像和镜像版本。 详细的镜像介绍和制作方法请参见镜像管理。 填写镜像启动命令。 镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量,并以大括号扩起,以$符号进行引用。 镜像启动命令支持多行输入,每行最多256字符,最多支持300行。 例如,bamqc软件输入参数填写为
-a:提交的镜像作者,例如tsj。 container-id:容器id。 -m:提交时的说明文字,例如xx。 tsj/image:tag:仓库名/镜像名:TAG名,名称可自定义。 执行docker images查看制作完成的Docker镜像。 Dockerfile方式制作镜像 如果后续镜像经常变更(例如某个软件更
Source database {0} does not exist. 检查引用的数据库id是否正确。 500 eihealth.01040037 Database service is not available now. Please check the database resource
取值范围:输入字符最大长度为255 最大长度:255 database_id 是 String 自动作业依赖的数据库ID 最小长度:1 最大长度:128 database_column 是 String 自动作业状态更新列 最小长度:1 最大长度:55 database_column_type 否 String
限制的并发量。 请求示例 创建靶点口袋发现作业,作业名称为demo-job, 受体文件为project:/dir/file,时间步长为0.001ps,最小化步数为20000,预平衡时间为100ps,口袋发现时长为50ns,表面原子离散点数量为30,探针半径1.4A。 https://{endp
图12 性能加速节点信息 购买数据库 使用数据库功能前,需要先购买数据库,数据库只能购买一个。 在“数据库”页面,单击“购买数据库”。 选择“数据库规格”、“性能规格”、“磁盘加密”、“计费模式”、“购买时长”、“购买数量”。 图13 购买数据库 数据库规格:选择“标准版”。 性能规格:根据您的需求选择规格。
数据库管理命令 创建数据库模板 获取数据库模板 删除数据库模板 导入数据库模板 创建数据库实例 获取数据库实例 删除数据库实例 引用数据库或者导入数据到指定数据库 修改数据库实例
获取项目 使用get命令获取当前用户有权限访问的所有项目列表,以及项目信息,包含项目名称、ID、所有者、项目角色、存储大小、状态、创建时间、更新时间。 在使用该命令前,您需要通过平台创建项目。 命令结构 health get project <project-name> [flags]
数据库(可选) 数据库对应的是“项目管理>数据库”功能,可按使用需要购买。 图1 购买数据库 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
数据库管理 数据库管理 模板管理 父主题: API(医疗智能体平台)
com/docs/quickstart/step-2-set-up-your-api-key # genomeagent默认从环境变量中获取'USER_APIKEY/USER_HEADERS'变量内容作为访问。 # 如果所用的大语言模型使用OpenAI模式部署的模型推理服务 # 模型参
数据库管理 数据库简介 创建数据库模板 导入数据库模板 创建数据库 引用数据库 管理数据库 父主题: 用户指南(基因平台)
上传应用,并查看应用详情、版本、创建者、修改和创建时间,可以对名称、创建者、修改时间、创建时间、源项目进行排序。并可执行查询、修改和删除应用的操作。 图1 应用列表 流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。流程通过流程设计器创建,创建好的流程将存储于“项
医疗智能体应用是生物信息软件的镜像封装,应用既可以独立使用,也可以将多个应用编排入流程串联使用。用户可以制作自定义应用,创建分析流程。 流程 医疗智能体流程包含基因组学分析过程所需应用的执行先后信息以及数据输入输出等定义。分析流程由至少一个应用组成,流程中的各个应用由其前后顺序关系形成数据流,前序应用为后
选择创建好,并带有数据的项目。 研究名称 可自定义研究名称。 流程 选择资产市场中订阅的Docking Summary流程。 配体分子 选择上传的配体小分子文件。 受体蛋白 选择上传的受体蛋白文件夹。这里会默认用文件夹里面所有的蛋白质和配体小分子文件里面的小分子进行一一对接。 超时时间 根据受体配体对个数
取值范围:输入字符最大长度为255 最大长度:255 database_id 是 String 自动作业依赖的数据库ID 最小长度:1 最大长度:128 database_column 是 String 自动作业状态更新列 最小长度:1 最大长度:55 database_column_type 否 String
基础配置:选择“计费模式”、“当前区域”。 集群类型选择“Elasticsearch”,输入集群名称。 图2 基础配置 节点规格:参考自己的数据库大小。自定义数据库所需要的的CSS节点规格大于“4 vCPUs | 8GB”,不支持“4 vCPUs | 8GB”。 节点存储:建议选择“超高I/O”。
作业名称、标签、所使用的流程名称、版本、运行状态、创建者、创建时间、完成时间和总耗时。并可对作业执行重试、取消、删除、克隆、导出操作。对于列表中的作业,支持通过作业名称、流程名称、标签、创建者、状态、创建时间和完成时间进行快速搜索。 如果需要批量创建分析作业,您可以创建自动作业。
药物数据库管理 创建数据库 获取数据库列表 删除数据库 更新药物数据库 数据库追加文件 父主题: API(盘古辅助制药平台)