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输入蛋白质,pdb格式,将要进行对接的所有靶标蛋白放在一个文件夹内。 输入配体小分子,配体小分子为如下格式的txt文件。 第一列为smiles字符串,第二列为smiles名称,中间用tab键分割。 父主题: 运行大规模虚拟药筛任务
自动作业结束时间 database_id String 自动作业依赖的数据库ID database_column String 自动作业状态更新列 database_column_type String 自动作业状态更新列的类型,不填默认为EXISTED clean_database_column
DIRECTORY,ENUM] pattern String 提示用户参数填写的格式,取值范围:[0-64]。对于STRING类型,匹配字符串内容,比如后缀约束.fastq;对于ENUM类型,可以提示一定要在param_enum列表范围内取值;对于FILE类型,约束文件后缀类型;
pe”。 表1 公共响应消息头 消息头名称 说明 是否必选 Content-Type 用于指明发送给接收者的实体正文的媒体类型。 类型:字符串。 默认值:application/json; charset=UTF-8 是 对于获取用户Token接口,返回如图1所示。 其中“x-s
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0 ], "size" : [ 10, 10, 10 ], "padding" : 6 } 响应示例 状态码: 200 生成的口袋字符串。 HEADER CORNERS OF BOX REMARK CENTER (X Y Z) 0.0 0.0 0.0 REMARK
0.3 ], "z_coord_list" : [ 0.1, 0.2, 0.3 ] } 响应示例 状态码: 200 表面离散点生成的字符串结果。 ATOM 1 H UNK X 1 25.6832614.2765035.85524 ATOM 2
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fastq' # 提示用户参数填写的格式,取值范围:[0-64]。对于STRING类型,匹配字符串内容,比如后缀约束.fastq; # 对于EN
"https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb" } } 响应示例 状态码: 200 蛋白小分子拼接复合物结果字符串。 REMARK 1 CREATED WITH OPENMM 7.7, 2023-10-31 CRYST1 48.140 48
Encode -> Base64 Decode -> GZip Inflate -> UTF-8 Decode)以得到原始字符串;如未压缩则为原始字符串。 最小长度:0 最大长度:10000000 表8 DrugBoundingBoxDto 参数 参数类型 描述 center Array
fastq' # 提示用户参数填写的格式,取值范围:[0-64]。对于STRING类型,匹配字符串内容,比如后缀约束.fastq; # 对于EN
request data 根据错误详细信息检查请求体。 400 eihealth.03011001 Text type error. 更改输入文本为字符串类型。 400 eihealth.03011002 Input key error. 更改关键字为“text”。 400 eihealth
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基础操作系统类镜像,如Ubuntu、Suse、Centos等。 基础编程语言类镜像,如Java、Python、R语言等。 基础通用类软件镜像,如Tomcat、Mysql、Ngnix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。
点。计算节点标签设置方法请参见计算资源标签管理。 图4 CPU、内存、GPU 填写输入参数、输出参数。 参数填写时,输入参数及输出参数有字符串(String),文件(File),文件夹(Directory),枚举(Enum)四种类型。 图5 参数信息 对于输入参数,打开“并发”开
Encode -> Base64 Decode -> GZip Inflate -> UTF-8 Decode)以得到原始字符串;如未压缩则为原始字符串。 最小长度:0 最大长度:10000000 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 查询配体文件预览任务成功响应。 {
指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 如果同时使用yaml模板和参数命令对描述、标签等参数进行了修改,最终修改结果以参数命令为准。 对于可选参数,如果命令中包含了特殊字符,需使用""括起来。 如果特殊字符中包含了双引号,需依据不同操作系统对特殊字符的规范来设置参数命令,例如: # 原镜像启动命令
步骤3:初始化配置 在使用命令行工具前,需要初始化配置信息,通过config命令对eihealth-toolkit进行初始化配置。本节以Windows为例介绍配置过程,Linux和macOS环境配置过程相同。 命令结构 执行health config add命令进行初始化配置。 health