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集群的管理节点为运行状态,但是集群异常提示“master node cannot reached”怎么办? 问题描述 集群的管理节点为运行状态,但是集群异常提示“master node cannot reached”。 处理方法 检查“/etc/ssh/sshd_config”配
本节指导用户在ECS上安装和使用Platform MPI应用(以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Platform MPI。 执行以下命令,安装需要的库文件。 # yum install glibc.i686
在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景) 该任务指导以CentOS 7.6的操作系统为例在集群上运行MPI应用。 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用MPICH 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 该任务指导以CentOS7.3的OS为例在集群上运行MPI应用。 IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
3eval_170901-rh7_Apr11.x86_64.rpm 下载需要的HPC-X工具套件。 IBM MPI在EDR SR-IOV场景下的运行需要HPC-X提供的MXM库的支持,HPC-X 的下载需要参考弹性云服务器操作系统的版本以及IB驱动版本,例如,下载的HPC-X版本为:hpcx-v2.0.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4
执行以下命令,在单个BMS上运行Intel MPI。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行Intel MPI。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello 图3 在单个BMS上运行Intel MPI
执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello 图3 在单个BMS上运行MPICH 父主题: 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景)
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI(以版本3.1.0rc2为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动。 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 本节操作指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI(以版本4.0.2a1为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。
回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个ECS上运行Intel MPI。 执行以下命令,重新生成可执行文件。 # cd # mpicc hello.c -o intel_hello 执行以下命令,在单个ECS上运行Intel MPI。 # mpirun -np 2 /root/intel_hello
集群部署支持鲲鹏架构的sge调度器,支持X86架构的slurm和sge调度器。 单个用户可创建集群的上限为3个。 单个集群中的计算节点的上限为2000个。 集群创建/扩容时,节点不能添加数据盘,如需使用,用户需手动挂载。 当前不支持集群恢复操作,创建失败或扩容失败的节点无法自动恢复。
and-drivers/linux/mlnx_ofed/,选择相应版本的InfiniBand网卡驱动下载,并根据Mellanox提供的操作指导进行安装。 以操作系统CentOS 7.3为例,推荐安装4.2.1版本的安装包,下载安装包“MLNX_OFED_LINUX-4.2-1.2
选择“安全组” 安全组为选定的管理节点所使用的安全组策略,如果有多个策略,可根据需要选择。 选择“计算节点” 计算节点的筛选需要满足以下条件: 当前指定区域的ECS节点。 计算节点状态为“运行中”。 计算节点与管理节点为相同的CPU架构。 计算节点与所选管理节点有相同的VPC、安全组。 计
数的关键应用会采用IPoIB方式通信。 无修改:指运行在IP协议上的应用不需要作任何修改,即可适配IB网络运行。 IPoIB的通信模式有哪些 IPoIB设备能够配置为datagram和connected两种模式,前者提供不可靠的、无连接的链路,后者提供可靠的、有连接的链路。 在datagram模式下,queue
通过虚拟化优化(SR-IOV、PCI直通)等,各类测试报告显示:大规模云化HPC性能损耗不大。 约束与限制 MPI和通讯库的版本需要提前适配RoCE,请联系技术支持进行操作,建议使用推荐版本运行STAR-CCM+。 目前仅c6h.22xlarge.2.physical、c6h.22xlarge.4
远程内存访问。目前RoCE有两个协议版本,v1和v2。其中RoCE v1是一种链路层协议,允许在同一个广播域下的任意两台主机直接访问。而RoCE v2是一种Internet层协议,即可以实现路由功能。虽然RoCE协议这些好处都是基于融合以太网的特性,但是RoCE协议也可以使用在传统以太网网络或者非融合以太网络中。
配置节点互信 配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行,推荐使用互信免密登录。 # 生成ssh公钥和私钥 ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如:ssh-copy-id
需的私有镜像。 共享镜像 您将接受其他用户共享的私有镜像,作为自己的镜像进行使用。 选择“共享镜像”,并展开“镜像”的下拉框,选择所需的共享镜像。 选择“许可证类型”。 在云平台上使用操作系统或软件的许可证类型。如果您选择的镜像为免费的,则系统不会展示该参数。如果您选择的镜像为计费镜像,此时系统会展示该参数。
提交作业,且运行期间无中断 在不中断作业的情况下,提交作业并运行,查看作业运行时间。 执行以下命令,提交作业。 qsub job.pbs 作业运行结束后,执行以下命令,查看作业信息。 qstat -f 作业ID 如图3所示,可以看到作业一共运行了4分10秒。 图3 运行作业不中断 步骤5
启动集群 操作场景 停止状态的集群,如需再次开启集群执行作业,可将集群重新启动。 只有状态为“停止”的集群可进行启动操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要启动的集群,单击后方操作列“更多 > 启动”。 单击“确定”。 在集群