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Turbo加速,在投递作业时可以选择“IO加速”。 降低通量运行,进而降低带宽、IO需求,使得带宽、IO满足生产需求。 优化软件算法,如使用内存做缓存等,降低软件的IO需求。 针对特定的项目,对带宽或IO性能进行扩容。 提交工单或联系服务技术支持。 父主题: 流程、作业
${sorted-bam} && samtools flagstat ${sorted-bam} -@10 > ${flagstat-file} CPU、内存和GPU CPU架构:X86 CPU需求:0.1 Memory:0.1 GPU类型:无 GPU需求:0 CPU架构:X86 CPU需求:16
选择“X86”CPU架构,CPU需求建议0.2起。GPU类型选择“无”。 按需填写内存大小,单位为GB。FastQC运行中所需内存大小依赖于输入数据大小,建议至少1GB。计算节点标签可将作业运行于指定的资源节点上,标签设置方法请参见计算资源标签管理。 图4 CPU、内存、GPU 填写参数。 通过阅读FastQC命令说明,了解命令。
"is_prefab" : false } ] } 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题: 数据库管理
${genomedir} --noextract -o ${outputdir} ${input} 图3 镜像信息 选择CPU、GPU类型和大小,选择内存大小,内存单位为GB。 CPU架构依赖于制作镜像过程中选择的系统类型,以及制作镜像时所需的生物信息学软件支持在X86还是ARM上运行。例如,GA
使用get命令获取购买的计算资源、性能加速资源、数据库资源、存储资源列表。 命令结构 health get resource [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --type -t 是 名称,支持computing、performance、database、storage,分别代
镜像类型 选择“自定义”镜像。 工作环境 选择“autogenome”镜像。 CPU 设置CPU为8.0核。 GPU 设置GPU为1.0。 内存 设置内存大于50G。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标,设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据,可将数据提前上传至对应的OBS路径下。
是否开启自动扩容 表5 NodeSpecDto 参数 参数类型 描述 code String 规格编号 最大长度:64 name String 规格名称 最大长度:64 ram Long 内存 vcpus String vcpus 请求示例 查询扩容策略列表 https://eihealth
响应Body参数 参数 参数类型 描述 quantity Integer 剩余服务器数 cpu Integer 剩余CPU ram Integer 剩余内存 请求示例 获取节点剩余配额 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{proj
数据库管理命令 创建数据库模板 获取数据库模板 删除数据库模板 导入数据库模板 创建数据库实例 获取数据库实例 删除数据库实例 引用数据库或者导入数据到指定数据库 修改数据库实例
计算节点标签列表 表5 ComputingSpecDto 参数 参数类型 描述 code String 规格编号 最大长度:64 name String 规格名称 最大长度:64 ram Long 内存 vcpus String vcpus max_rate String 最大带宽 min_rate
满足扩容策略中mem分配率时增加的节点数 表4 NodeSpecDto 参数 参数类型 描述 code String 规格编号 最大长度:64 name String 规格名称 最大长度:64 ram Long 内存 vcpus String vcpus 请求示例 查询扩容策略详情 https://eihealth
不接收:不接收操作通知。 接收类型 数据操作:数据的复制、删除、导入等异步操作通知。 作业进度:分析作业开始执行、执行成功通知。 系统消息:项目删除、内存使用量告警、消息清理通知。 图3 消息通知 邮箱中接收到的消息通知如图4所示。 图4 邮箱消息通知 父主题: 系统设置
数据库管理 数据库简介 创建数据库模板 导入数据库模板 创建数据库 引用数据库 管理数据库 父主题: 用户指南(基因平台)
作业使用的IO加速实例id,不填表示不使用 最小长度:0 最大长度:128 io_acc_expected_usage 否 Integer 作业使用的SFS-Turbo实例预期占用存储量,单位G,用于投递作业时评估当前加速实例余量是否充足 最小值:0 最大值:327680 node_labels 否 Array of
数据库(可选) 数据库对应的是“项目管理>数据库”功能,可按使用需要购买。 图1 购买数据库 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
数据库管理 数据库管理 模板管理 父主题: API(医疗智能体平台)
cpu_quota Integer 作业的CPU资源配额,单位核 最小值:1 最大值:1024 mem_quota Integer 作业的内存资源配额,单位GB 最小值:1 最大值:1024 projects_per_user Integer 用户可创建项目数配额 最小值:0 最大值:20
Notebook的简要描述。 镜像类型 选择自定义镜像。 工作环境 选择已上传的自定义镜像。 CPU 设置CPU大小。 GPU 设置GPU大小。 内存 设置内存大小。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标,设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据,可将数据提前上传至对应的OBS路径下。
药物数据库管理 创建数据库 获取数据库列表 删除数据库 更新药物数据库 数据库追加文件 父主题: API(盘古辅助制药平台)