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创建项目 新用户进入平台后需要自己创建项目,单击“创建项目”按钮,填写项目名称以及选择对应的数据保护策略,数据保护策略参考下面配置。 图1 创建项目 单击项目名称可进入到对应的项目中。 图2 进入项目
--update -u 否 增量上传操作,设置该参数后上传每个文件时会比对平台数据路径中的文件,仅在以下情况时上传数据: 文件不存在。 待上传文件大小与平台文件大小不一致。 文件的最后修改时间不一致。
个人设置 在平台右上角用户名中选择“个人设置”,可以修改邮箱、手机号和密码。最终租户仅可修改邮箱和手机号,子用户可以修改可以修改邮箱、手机号和密码。 图1 修改个人信息 父主题: 系统设置
上传镜像 通过health docker push命令将镜像上传至EIHealth平台项目中。
命令结构 health docker push <image-name:tag-name> 上传镜像命令 依次执行以下命令将镜像上传至EIHealth平台。
创建子用户 使用管理员账户登录盘古辅助制药平台。 在右上角用户名中选择“用户管理”。 在用户管理页面,单击左上角“创建用户”,进入“创建用户”页面。 填写用户信息,分配子用户权限。 创建完成后,单击“确认”。 父主题: 用户管理
导出的作业信息会以zip文件格式保存到当前目录,zip文件中包含以下两个文件: jobDetails.zip:保存job的yaml文件 jobInfo.csv:保存job信息 命令结构 # 使用job-id导出作业 health export job --ids <job-id>
API概览 医疗智能体平台所提供的API,均符合RESTful API设计规范,如表1所示。 临床研究和药物设计所提供的API,均符合RESTful API设计规范,如表2所示。
获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。 自定义镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像,依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像,您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。
登录医疗智能体平台,在“资产市场”中订阅“docking summary测试数据”至所需的项目中。 图1 示例数据 父主题: 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选
Notebook简介 EIHealth平台集成了基于开源的Jupyter Notebook,可为您提供在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作,只需聚焦于科研工作,从而加快科研进展。
删除数据 使用rm命令删除EIHealth平台的文件或目录,此命令不支持删除引用的数据。 命令结构 health rm <destdir> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 destdir 无 是 目的文件或目录。
下载数据 使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地,此命令不支持下载引用项目中的数据。
--update -u 否 增量上传操作,设置该参数后上传每个文件时会比对平台数据路径中的文件,仅在以下情况时上传数据: 文件不存在。 待上传文件大小不与平台文件大小一致。 文件的最后修改时间不一致。
使用逻辑与EIHealth平台一致,进入项目,再对项目内的数据等内容进行操作。 命令行的参数缩写支持合并使用,例如,-r -s 可以写成-rs。 父主题: 获取并使用命令行工具eihealth-toolkit
在使用该命令前,您需要通过平台创建项目。 命令结构 health get project <project-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 否 项目名称,在EIHealth平台创建项目时,由用户填写。
成长地图 | 华为云 医疗智能体 医疗智能体(EIHealth)基于华为云AI和大数据技术优势,为基因组分析、药物研发、临床研究三个领域提供专业AI研发平台。
在使用该命令前,需要使用switch命令进入待操作的项目,才可以执行数据相关操作,使用逻辑与EIHealth平台相同。 命令结构 health ls <path> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 path 无 否 路径名称。
本示例中以Windows系统命令行工具为例,介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具,用switch命令进入待操作的项目。
计算节点标签添加方法:在平台右上角单击用户名,选择“系统资源 > 计算资源”,在计算节点的操作列单击“更多 > 标签管理”,添加标签。上图示例中需要添加的标签名称为labelsss1。 使用本地已填写好的作业模板job.yaml运行分析作业。