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name String 实例名称 description String 描述 template_id String 模板id template_name String 模板名称 creator String 创建者 create_time String 创建时间 update_time
流程说明 分析流程至少由一个应用组成，在多个应用构成的流程中，一个应用的输出作为另一个应用的输入，流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 EIHealth中的流程由应用搭建形成，应用包含了数据的输入、输出等参数定义。 应用呈现的信息在创建应用过程中定义，包含参数名称、数据类型、描述、默认值等。
参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 实例名称 最小长度：3 最大长度：32 template_id 是 String 模板id 最小长度：1 最大长度：128 description 否 String 实例描述 最小长度：0 最大长度：1024 import_data
获取Nextflow作业详情 删除Nextflow作业 重试Nextflow作业 获取Nextflow作业日志 停止Nextflow作业 获取Nextflow作业报告 父主题： Nextflow接口
8g，高优先级的先投递。 图1 新建作业 单击“确定”，进入启动作业页面。 （可选）在启动作业页面，可以通过，添加作业相关参数。 上传参数的模板可以通过单击进行下载。 如果流程设置了参数，作业上传的参数将会覆盖流程设置的参数。 单击“启动作业”。 父主题： Nextflow
instance-name 无 是 数据库实例名称。 --description -d 否 描述。 --template-id -t 是 模板id。 --skip-lines -s 否 跳过的header行数。不指定参数值时默认为0。 --delimiter -e 否 常用的三种分隔符为（;
资产市场是在EIHealth平台的基础上构建的开发者生态社区，提供镜像、数据、应用和流程的内容共享。提供安全、开放的资产共享和使用，加速基因、药物、临床应用的开发与落地，保障开发生态链上各参与方高效地实现各自的商业价值。 订阅资产 资产市场提供官方发布的镜像、数据、应用、流程资产。您可以查看各类资产的详细介绍和使用方法，并订阅资产至项目中使用。
您可以使用该工具创建、获取、删除和导入数据库模板，创建、获取和删除数据库实例，也可以引用数据库。 镜像管理 您可以使用该工具对镜像执行标记、上传、下载、查询、导入、更新和删除标签等操作。 应用管理 应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 您可以使用该工具创建应用，并进行修改、删除、查询、导入操作。
"last_timestamp" : "2021-01-30T02:34:36Z", "message" : "创建k8s Job对象 app1-1-0-093a002fa000217 成功", "reason" : "创建成功##SuccessfulCreate",
cates连线关系 在流程设计器左侧应用列表中选择gatk-bqsr、gatk-applybqsr应用，并使用鼠标拖拽至画布中。 将gatk-markduplicates的输出参数markduped-bam与gatk-bqsr、gatk-applybqsr的输入参数markdup
ng|Cancelled|Unknown） tool_name 否 String 作业依赖的组件名称(有可能是Workflow，有可能是app), 取值范围：长度为[1,56]，以小写字母开头，允许出现中划线(-)、小写字母和数字，且必须以小写字母或数字结尾。 最小长度：1 最大长度：128
目名称，可选。不指定srcproject时，默认为当前项目。例如ngs:1.0:srcproject。 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。 --summary -s 否 流程的简要描述。 --description -d 否 流程的详细描述。 --output_dir -o
最大长度：32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 type 否 String 镜像类型。枚举值：APP、NOTEBOOK 枚举值： APP NOTEBOOK description 否 String 描述信息 最小长度：0 最大长度：1024 chip_type
添加参数方式支持两种，一种为单击进行添加，一种为单击进行添加。如果参数比较多，建议使用“上传参数”方式。 上传参数方式：支持json或yaml格式，文件大小不能超过10M。模板可以通过单击进行下载。如果上传参数有重名的参数，则只取最后一个参数的值。 添加参数方式：需手动配置相关参数的取值。 参数名称：设置参数名称，此参数为必填项。参数名不能相同。
COPY abc.txt /opt/ #复制文件夹 COPY /webapp /opt/webapp #复制图片文件 COPY bd_logo1.png /opt/ #设置环境变量 ENV WEBAPP_PORT=9090 #设置工作目录 WORKDIR /opt/ #设置启动命令
String cpu申请使用量，取值范围[0.1-128]，单位C，支持一位小数。对于应用，不填默认1C；对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 cpu_type 否 String cpu架构类型，不填默认X86
最大长度：128 tag 是 String 镜像版本 最小长度：1 最大长度：64 type 否 String 镜像类型。枚举值：APP、NOTEBOOK 枚举值： APP NOTEBOOK chip_type 否 String 镜像芯片类型。枚举值：X86、ARM 枚举值： X86 ARM
COPY abc.txt /opt/ #复制文件夹 COPY /webapp /opt/webapp #复制图片文件 COPY bd_logo1.png /opt/ #设置环境变量 ENV WEBAPP_PORT=9090 #设置工作目录 WORKDIR /opt/ #设置启动命令
、gatk-markduplicates、gatk-bqsr、gatk-applybqsr、gatk-haplotypecaller、gatk-mergevcfs和discvrseq-variantqc应用构成。NGS流程执行步骤如表1所示。 表1 NGS执行步骤 步骤 描述 Read
如下公共消息头需要添加到请求中。 表3 公共请求消息头 参数名 说明 是否必选 示例 Content-type 消息体的类型（格式），默认取值为“application/json”。 是 application/json 例如，对于获取用户Token接口，由于不需要认证，所以只添加“Content-Type”即可，添加消息头后的请求如下所示。
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