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txt;projectname:/test3.txt" } } --output_dir -o 否 输出路径(EIHealth平台数据路径)。可自定义。不指定时,按照“作业名称+UUID”格式自动生成存放输出结果的目录。输出路径只能以/开头,不能以/结尾。 --timeout -t 否
String notebook存储路径 最小长度:1 最大长度:4096 mount_path String 挂载路径,由于目前暂不支持自定义挂载,暂不开放 最小长度:1 最大长度:4096 表8 TaskEventRsp 参数 参数类型 描述 type String 任务启动事件类型
有者完全控制 --meta -E 否 移动对象时可指定的目标对象的自定义元数据。格式为:key1:value1#key2:value2#key3:value3。 以上值表示移动对象完成后,桶内目标对象包含三组自定义元数据,分别为:key1:value1、key2:value2、key3:value3。
String notebook存储路径 最小长度:1 最大长度:4096 mount_path String 挂载路径,由于目前暂不支持自定义挂载,暂不开放 最小长度:1 最大长度:4096 表10 TaskEventRsp 参数 参数类型 描述 type String 任务启动事件类型
命令中source-image-name为镜像名称,source-tag-name为镜像标签,target-image-name和target-tag-name可自定义。 打标签命令 依次执行以下命令为镜像打标签。 health docker tag biocontainers/fastp:v0.20.1_cv1
者完全控制 --meta -E 否 复制对象时可指定的目标对象的自定义元数据。 格式为:key1:value1#key2:value2#key3:value3。 以上值表示上传对象完成后,桶内目标对象包含三组自定义元数据,分别为:key1:value1、key2:value2、key3:value3。
发的新一代分子动力学模拟程序,具有高性能、模块化等特性,是一个完全自主研发的分子模拟软件库。基于高毅勤教授课题组和华为团队的技术支持,已经实现自由能微扰加速10倍以上。测试 父主题: 用户指南(盘古辅助制药)
发的新一代分子动力学模拟程序,具有高性能、模块化等特性,是一个完全自主研发的分子模拟软件库。基于高毅勤教授课题组和华为团队的技术支持,已经实现自由能微扰加速10倍以上。 父主题: 盘古辅助制药平台
如果未设置该参数,则列举结果中字节数的显示格式由配置文件中的humanReadableFormat参数决定。 --format -F 否 指定以自定义格式打印列举结果。当前仅支持值[default],指定列举结果在一行显示。 --a -a 否 同时列举桶内对象和桶内分段上传任务。 --m
进行资源的访问、共享和协作。 预置流程:预置流程包括NGS、GATK、Cell Ranger和Druglikeness。 项目间资产共享:实现跨项目数据、应用、流程的使用。 开发环境:预置基因组自动建模工具AutoGenome,提供多种AI引擎切换。 应用、流程支持X86、ARM运行。
创建靶点口袋发现作业,作业名称为demo-job, 受体文件为project:/dir/file,小分子片段文件为project:/dir/file,自定义属性预测id为xxxxxx,分子量约束为200-600,预期的最大输出为5000个。 https://{endpoint}/v1/{pro
的AI模型,加速药物研发过程。 科研单位 平台以流程管理及Notebook为核心,内置了常见的基因组数据分析流程,科研工作者可以非常方便的实现数据管理,开发自己的分析流程,分享自己的数据分析流程,以及复现业内已有的流程。
选择某些残基来作为口袋位置。 自动预测 如果没有受体口袋位置未知,可以使用自动预测软件来进行口袋位置预测。 全局对接 将整个受体作为口袋位置。 自定义 手动修改口袋位置和大小。 padding 口袋位置放大多少尺寸。 图2 靶点设置 图3 Target1设置 图4 Target2设置 图5
选择某些残基来作为口袋位置。 自动预测 如果没有受体口袋位置未知,可以使用自动预测软件来进行口袋位置预测。 全局对接 将整个受体作为口袋位置。 自定义 手动修改口袋位置和大小。 padding 口袋位置放大多少尺寸。 单击“下一步”,进入优化设置页面。 图7 优化设置页面(1) 图8 优化设置页面(2)
s.yaml。 编写执行脚本并提交作业 运行分析作业时,流程中的每一个应用称之为一个任务(Task),通过循环读取Task的输入数据,可以实现作业的批量执行。 例如,您可以在本地创建.bat格式的批处理文件,执行该脚本即可批量运行NGS分析作业。 @echo off set list="task-1-fastp
新建流程 流程说明 分析流程至少由一个应用组成,在多个应用构成的流程中,一个应用的输出作为另一个应用的输入,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 EIHealth中的流程由应用搭建形成,应用包含了数据的输入、输出等参数定义。 应用呈现的信息在创建应用过程中定义,包含参数名称、数据类型、描述、默认值等。
计费说明 计费模式 基因平台 基因平台提供包年包月、按需两种计费方式,您可以按需求进行选择,计费详情请参见价格计算器。 盘古辅助制药平台 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式,您可以按需求进行选择,计费详情请参见价格计算器。 OBS数据下载 OBS数据下载产生的流量费用
zsh_history命令,退出终端后再次执行history -p命令可删除记录文件,清空历史。 windows系统:对于当前执行的命令,可通过关闭cmd窗口实现历史命令的清理。 父主题: 获取并使用命令行工具eihealth-toolkit
zsh_history命令,退出终端后再次执行history -p命令可删除记录文件,清空历史。 Windows系统:对于当前执行的命令,可通过关闭cmd窗口实现历史命令的清理。 父主题: 数据管理
错误码(医疗智能体与盘古辅助制药平台) 当您调用API时,如果遇到“APIGW”开头的错误码,请参见API网关错误码进行处理。 状态码 错误码 错误信息 处理措施 400 eihealth.01040001 Invalid template content. 检查模板内容是否符合格式要求。