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分子的对接结果的均值和标准差。 第2部分描述了配体小分子信息，注释结果如下。 分类：该小分子的在DrugBank中分类信息。 化学式：小分子的化学式。 XLOGP3：小分子的脂溶性logP。 TPSA：小分子的拓扑极性表面积。 靶点：小分子的靶点。 Csp3比例：小分子的碳饱和度。
数据集，作为该流程的原始输入。数据集总大小约 216MB。 docking summary测试数据 配体文件：小分子化合物SMILES结构式文件。 受体文件：蛋白3D结构PDB文件。 RNA-Seq测试数据及参考基因组数据集 RNA-Seq-Dataset数据集包含RNA-Seq
解析是否成功。 smiles String 分子SMILES表达式。 最小长度：1 最大长度：512 formula String 配体分子的化学式。 最小长度：1 最大长度：128 structure LigandStructureDto object 配体3D结构。 bounding_box
BindingSite 参数 是否必选 参数类型 描述 protein 否 String 蛋白质3D结构，使用gzip压缩然后转base64格式 最小长度：1 最大长度：10000000 bounding_box 否 表7 object 结合口袋，包含口袋中心位置和尺寸大小 表7 BoundingBox
and 表9 BindingSite 参数 参数类型 描述 protein String 蛋白质3D结构，使用gzip压缩然后转base64格式 最小长度：1 最大长度：10000000 bounding_box BoundingBox object 结合口袋，包含口袋中心位置和尺寸大小
BindingSite 参数 是否必选 参数类型 描述 protein 否 String 蛋白质3D结构，使用gzip压缩然后转base64格式 最小长度：1 最大长度：10000000 bounding_box 否 BoundingBox object 结合口袋，包含口袋中心位置和尺寸大小
药物配体注释信息数据库 数据库呈现了“神农项目”中8500多种药物的注释信息。包含了药物在DrugBank数据库中的ID、药物通用名称、分类、化学式、SMILES结构式、标签和成药性相关的信息。 图3 药物配体注释信息数据库 图4 数据库模板 父主题： 数据库管理
and 表10 BindingSite 参数 参数类型 描述 protein String 蛋白质3D结构，使用gzip压缩然后转base64格式 最小长度：1 最大长度：10000000 bounding_box BoundingBox object 结合口袋，包含口袋中心位置和尺寸大小
Ranger软件封装为镜像，并上传至EIHealth平台。通过应用把镜像引入，利用应用搭建分析流程，执行分析作业。 用于创建Notebook Notebook是一个交互式应用程序，用于代码的编写、调试、运行。创建Notebook时，您可以选择系统镜像。当系统镜像无法满足您的开发需求时，您可以基于EIHealt
作业详情 如果作业显示运行正常，但实际作业中的某一个应用运行失败，请检查输入数据是否正常，并修改算法程序入口的main函数，保证运行结果有显式的返回值。 故障说明 作业运行时，每个应用称之为一个任务（Task）。部分场景下，任务输入数据异常，实际作业运行失败，但界面显示运行正常。
144000]，单位分钟，默认1440 最小值：1 最大值：144000 output_dir 否 String 流程的当前工作目录，默认为根目录，用户可显式指定;输出路径必须以斜杠（/）开头且不能以斜杠（/）结尾，不能包含两个以上相邻的斜杠（/），不能包含以下特殊字符：\ : ; * ? < "
y应用构成，各应用说明如表1所示。 表1 应用说明 应用名称 说明 ligand-smiles-to-3dsdf 将配体的smiles结构式转换为sdf文件。 ligand-3dsdf-to-pdbqt 将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 receptor-pdb-to-pdbqt
144000]，单位分钟，默认1440 最小值：1 最大值：144000 output_dir 否 String 流程的当前工作目录，默认为根目录，用户可显式指定;输出路径必须以斜杠（/）开头且不能以斜杠（/）结尾，不能包含两个以上相邻的斜杠（/），不能包含以下特殊字符：\ : ; * ? < "
解析是否成功。 smiles String 分子SMILES表达式。 最小长度：1 最大长度：512 formula String 配体分子的化学式。 最小长度：1 最大长度：128 is_3d Boolean 标识原始数据是否为3D。 structure LigandStructureDto
克隆已有的分析作业，作业的参数及流程一并克隆到流程设计器中。克隆作业后，请修改作业的输出数据路径，否则会有覆盖原有作业数据风险。 执行克隆操作有两种方式，请选择任一方式执行。 在分析作业列表中，单击“操作”列“克隆”，进入流程设计器页面。 图8 克隆作业 在分析作业列表中，单击作业名称，进入详情页。单击右上角“克隆”，进入流程设计器页面。
l='fromconfig' # 输出并执行代码：execute=True # 用户不参与修改：user_modify=False （交互式用户修改目前仅支持python解释器或者python脚本下运行） # 用EIFlow投递作业：local_mode=False ga = G
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