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命令行工具概述 镜像、应用、流程、作业 1. 制作镜像 2. 创建应用 3. 搭建流程 4. 执行分析作业 常见问题 了解更多常见问题、案例和解决方案 热门案例 AK/SK是什么？如何获取AK/SK 如何搭建Docker环境？ 如何制作镜像？ 如何将生物信息学软件封装为镜像？ 更多 远程登录
相关文档 1 医疗智能体EIHealth平台迭代更新 资产市场，提供官方发布的镜像、数据、应用、流程资产。 提供了数据库的创建、查询和管理能力。 支持药物虚拟筛选能力。 命令行工具迭代更新。 开放镜像管理类API。 商用 用户指南 命令行工具 API参考 2021年3月 序号 功能名称
流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置 直接挂载OBS目录进行大规模计算，如何解决偶现报错
项目管理 收藏管理 镜像管理 标签页面管理 项目审计管理 虚拟药物筛选 父主题： API（医疗智能体平台）
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
不同类型的归档，费用分别是多少 选择归档存储类别涉及以下三种计费： 归档类别数据的存储费用 恢复归档数据的流量费用 提前删除归档数据（不满90天）收取的费用 存储类型 存储空间（按需） 存储套餐包（1TB 1年） 数据取回（直读） 数据取回（加急/标准） 删除对象 标准存储 0.0990元/GB/月
几种不同类型的归档，区别是什么 标准存储 标准存储访问时延低和吞吐量高，因而适用于有大量热点文件（平均一个月多次）或小文件（小于1MB），且需要频繁访问数据的业务场景。 适合高性能，高可靠，高可用，频繁访问场景。 归档存储 归档存储适用于很少访问（平均一年访问一次）数据的业务场景
用户指南（基因平台） 欢迎使用医疗智能体服务 关键概念 准备工作 用户管理 配额管理 系统设置 项目管理 数据管理 数据库管理 镜像管理 工具管理 作业管理 Nextflow 资产市场 开发环境（Notebook） 大规模药物虚拟筛选
运行作业 方式1：使用预置的NGS流程 方式2：使用预置应用搭建NGS流程 方式3：自定义镜像运行FastQC流程
数据的分析。 平台由项目管理、数据管理、作业、工具、开发环境、镜像等核心部件组成，各个部件沉淀了丰富的技术细节和人性化的设计。 初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 使用流程 EIHealth提供了个性化分析
输入输出参数信息 图14 应用信息 图15 失败日志信息 排查思路 检查作业是否存在文件或目录类型的输入参数，并且未开启并发，同时改输入参数还填入了多个值，并且路径存在包含关系，如上图所示。 假定镜像命令为cp -rf ${input} ${output}，变量替换后实际执行命令为cp -rf
开发环境（Notebook） Notebook简介 创建Notebook Notebook常用操作 数据的上传和下载 自定义镜像创建Notebook样例 JupyterLab简介及常用操作 url获取方法 Notebook安装Conda指导 父主题： 用户指南（基因平台）
'input_name1' # 参数名称 type: FILE # 参数类型 # STRING|FILE|DIRECTORY|ENUM pattern: '*.fastq' # 参数模式，界面展示，不做强校验
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 type 是 String 收藏类型。 最小长度：1 最大长度：16 resource_id 是 String 收藏的资源ID。 最小长度：1 最大长度：128 resource_name 是 String 收藏的资源名称，正则匹配中文，英文字母和数字及下划线。
DatabaseSpecDto 参数 参数类型 描述 code String 规格编号 最大长度：64 name String 规格名称 最大长度：64 表7 DatabaseDiskDto 参数 参数类型 描述 type String 磁盘类型 space Integer 磁盘大小，单位GB
BasicDrugModel 参数 参数类型 描述 id String 模型ID。 task_id String 任务ID。 name String 模型名称。 creator String 模型创建者。 type String 模型类型。 value_range ValueRange
BasicDrugModel 参数 参数类型 描述 id String 模型ID。 task_id String 任务ID。 name String 模型名称。 creator String 模型创建者。 type String 模型类型。 value_range ValueRange
task_id String 任务ID。 name String 模型名称。 creator String 模型创建者。 type String 模型类型。 value_range ValueRange object 区间上下限，仅回归型存在。 description String 模型描述信息。
DrugDatabaseDto 参数 参数类型 描述 id String 数据库id。 name String 数据库名称。 type String 数据库类型。 status String 数据库状态。 description String 数据库描述。 create_time String 数据库创建时间。
TaskInstanceStatusRsp 参数 参数类型 描述 phase String 实例执行状态 pod_ip String 实例IP host_ip String 实例所在节点IP host_name String 计算节点的名称 start_time String 实例创建时间 container_statuses
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