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药物通用接口 生成分子SVG图 生成分子SDF三维结构 受体预处理 受体信息解析 受体口袋检测 配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务
ligand-smiles-to-3dsdf 将配体的smiles结构式转换为sdf文件。 ligand-3dsdf-to-pdbqt 将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 receptor-pdb-to-pdbqt 将pdb文件转换为pdbqt文件。 qvina-w 执行分子对接操作(此处为blind
to pdbqt:将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 task-2-ligand smiles to 3dsdf:将配体的smiles文件转换为3dsdf文件。 task-3-receptor pdb to pdbqt:将受体的pdb文件转换为pdbqt文件。 task-4-qvina-w:分子对接。
"end_time": "2021-06-17T11:46:37Z", "status": "RUNNING", "destinations": [ "xxxx/" ], "type": "BACKUP_DATA" } 获取数据作业执行日志 health
to pdbqt:将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 task-2-ligand smiles to 3dsdf:将配体的smiles文件转换为3dsdf文件。 task-3-receptor pdb to pdbqt:将受体的pdb文件转换为pdbqt文件。 task-4-qvina-w:分子对接。
object notebook规格 status String notebook状态 枚举值: Running Abnormal Hibernate Succeeded Creating Deleting Updating CreatedFailed DeletedFailed UpdatedFailed
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50 name 否 Array of strings 标记位点名称。 最小长度:1 最大长度:128 数组长度:0 - 50 coordinate 否 Array<Array<Number>> 位点三维坐标集。 数组长度:0 - 50 响应参数 状态码: 201 表11 响应Body参数
- 50 name Array of strings 标记位点名称。 最小长度:1 最大长度:128 数组长度:0 - 50 coordinate Array<Array<Number>> 位点三维坐标集。 数组长度:0 - 50 表12 BasicDrugModel 参数 参数类型
nextflow.log?AccessKeyId=VQ52M3Q7I4WPWPDUB5XZ&Expires=1678190993&Signature=oRiADod2TExnsP56Q9k%2FSgm4h9g%3D" } 获取作业详情 # 获取作业详情 health nextflow
Code下拉框中有四个选项: Code:写Python代码 MarkDown:写MarkDown代码,通常用于注释 Raw NBConvert:转换工具 Heading:快捷添加MarkDown标题 4 代码Cell 代码单元格。每一个Cell有两种模式:命令模式和编辑模式。 最左侧为
Handelsman 等1998年提出的新名词,其定义为“the genomes of the total microbiota found in nature”,即环境中全部微小生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因,目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。宏基
进入EIHealth控制台,在页面左上角切换区域“华东-上海一”。 图1 切换区域 在API栏选择需要使用的服务,单击操作列的“开通服务”。 服务开通成功后,开通状态为“已开通”。 “开通服务”按钮置灰,说明您尚未认证,请先实名认证。 开通医学影像API 进入EIHealth控制台,在页面左上角切换区域“华南-广州”。
--pcr-indel-model NONE --tmp-dir ${out-dir} -I ${bqsr-bam} -O tmp_{1}.HC.vcf.gz --native-pair-hmm-threads 4 -L {1} " ::: `head -n-1 ${contig-file} | cut -f1`
score,合成复杂度分数。 Fsp3: 碳饱和度,旨在评估分子的空间结构复杂度。 结果解释:大于等于0.42为最佳。 NPscore: The Natural Product-likeness score,天然产物的相似度评分。 结果解释:最佳在-5~5之间,分数越高代表越接近天然产物。
url获取方法 在Notebook列表页面,按F12键打开,切换至Network页签。 单击页面右侧按钮,在Network页签的“Name”列单击“notebooks?offset=0&limit=10”,右侧展开代码行,在“url”行获取url链接,如下图所示。 图1 获取url
tag命令给待上传的镜像打标签。 执行镜像相关命令,请在本地搭建Docker环境,要求安装的容器引擎版本必须为1.11.2及以上。 默认标记到当前所在项目,需先使用切换项目命令进入想要上传镜像的项目。 命令结构 health docker tag <source-image-name:source-tag-name>
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