检测到您已登录华为云国际站账号，为了您更好的体验，建议您访问国际站服务网站 https://www.huaweicloud.com/intl/zh-cn
不再显示此消息
检测到您已登录华为云国际站账号，为了您更好的体验，建议您访问国际站服务网站 https://www.huaweicloud.com/intl/zh-cn
不再显示此消息
认是300K。 配置MD的计算步骤 Energy Minimization：能量最小化的步数，范围支持0<步数≤50000，默认是10000步。 NVT：等温等体步骤模拟的时长，范围支持0<时长≤1000ps，默认是200ps。 NPT：等压等温步骤模拟的时长，范围支持0<时长≤1000ps，默认是500ps。
lth平台各功能组件提供命令行管理工具。借助此工具，可以辅助您对EIHealth平台项目中数据、应用、流程和作业资源进行管理和使用。 操作步骤 下载命令行工具。 安装命令行工具。 本示例中以Windows系统为例，介绍安装命令行工具的方法。 下载Windows版本的客户端，得到health
NGS已经普遍的应用于全基因组测序、全外显子测序、转录组测序和表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入，通过质控，比对等步骤，输出针对fastq的qc报告，输出STAR比对得到的bam文件。 MetaGenome Kraken2 pipeline 宏基因组 (
ken。 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 tasks 是 Array of JobTaskDto objects 步骤的参数修改信息 数组长度：0 - 64 表4 JobTaskDto 参数 是否必选 参数类型 描述 task_name 是 String 子任务实际名称，取值范围[1
文件创建成功后，将直接呈现Console页面。 图6 新建文件（Console） 上传文件 进入JupyterLab页面后，您可以单击左上角“Upload”快捷键，从本地选择一个文件上传。 图7 上传文件 编辑文件 JupyterLab可以在同一个窗口同时打开几个Notebook或文件（如HTML、TXT、Markdown等），以页签形式展示。
费用。 以下操作步骤是在“数据中心”页面下载数据至本地。 在“数据中心”页面，下载数据至本地。 选择待下载的数据，单击“操作”列“下载”即可。 或者单击“操作”列“下载为”，然后单击鼠标右键，选择“链接另存为”，下载数据。 图3 下载数据 删除数据 以下操作步骤是在“数据中心”页面删除数据。
description: '' values: - '/output' 获取镜像地址 对于已上传或平台上已有的镜像，您可以参考以下步骤拼接镜像地址。 登录医疗智能体平台，进入镜像所在的项目。 在页面上方单击“镜像”，进入镜像管理页面。 单击镜像名称，进入镜像详情页。在该页
创建应用 登录医疗智能体平台，进入项目并选择“工具 > 应用”页签，单击“新建应用”。 图1 新建应用 依据“应用参数说明表”依次创建搭建NGS流程所需的应用。 图2 填充应用内容 对于测序得到的大量数据，如果需要批量执行NGS分析，可以选取以下任意一种方式进行批量执行： 方式一
"app_id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "display_name" : "步骤1", "output_dir" : "/task", "resources" : { "cpu_type" :
"app_id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "display_name" : "步骤1", "output_dir" : "/task", "resources" : { "cpu_type" :
CSS集群管理 绑定CSS集群 获取CSS集群列表 获取最终租户CSS集群列表 测试CSS集群连接 CSS集群解绑 父主题： API（盘古辅助制药平台）
标，解除引用关系。 图5 解除引用 下载数据 下载数据操作会产生流量费用，计费方式为按需计费，计费详情请参考OBS数据下载费用。 以下操作步骤是在“数据”页面下载数据至本地。您也可以使用命令行工具实现数据的下载。 展开数据文件夹，选择待下载的数据。 单击“操作”列“下载”。 单击
SMILES不支持输入空格或者中文 单击“下一步”，进入靶点设置，此步骤为可选步骤，如果需要设置靶点，并且将对接结合能作为一个约束条件进行分子生成，需要进行配置。最多可添加2个靶点。 如果不需要设置靶点，此步骤可以进行省略，如果设置了靶点，作业运行时间会加长。 通过“靶点设置”上传靶点，并且设置对接口袋。
"/workflow", "tasks" : [ { "task_name" : "app1-1", "display_name" : "步骤1", "output_dir" : "/task", "whole_output_dir" : "/workflow/task"
qc应用构成。在创建应用前，请先制作并上传应用所需的镜像。搭建NGS流程所需的镜像和版本如表1所示。 表1 NGS流程镜像信息 NGS流程步骤 描述 依赖镜像及版本 镜像下载命令 Read Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 fastp:0.20.1 docker
nsertsize、gatk-markduplicates应用，并使用鼠标拖拽至画布中。 将bwa-mem的输出参数sorted-bam与步骤4中三个应用的输入参数bam-file相连。 图3 bwa-mem、qualimap-bamqc、picard-insertsize、ga
", "tasks" : [ { "task_name" : "app1-1", "display_name" : "步骤1", "output_dir" : "/task", "whole_output_dir" : "/workflow/task"
示。 对配体分子进行注释，包括DrugBank编号、分类、化学式、XLOGP3、TPSA、靶点、Csp3比例、分子量、可旋转键数目。 使用步骤如下所示。 在“资产市场”中订阅版本为1.0.0“Docking Summary”流程至所需的项目中。 进入“专题”页签，单击“新建研究”。
长按/截图保存，微信识别二维码
或者关注公众号“华为云”
