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t-database”和“ligandAnnotation-database”数据库查看数据库详情,在“模板”页签单击“shennongProject”和“ligandAnnotation”查看模板详情。 “神农项目”药物虚拟筛选数据库 数据库呈现了新冠病毒靶点蛋白和药物的结合能
系统设置命令 获取系统标签 添加系统标签 删除系统标签 获取系统资源 购买计算资源 删除计算资源节点 修改计算资源 修改性能加速资源 查询消息及已完成作业保留设置 修改消息及已完成作业保留配置 获取供应商logo和名称设置 修改供应商logo和名称配置 获取系统配额信息 获取消息中心消息列表
大小:不超过20KB 描述 针对此镜像的相关描述。 单击“立即发布”。 系统跳转到“我的发布”页面,可以查看发布的镜像状态。当镜像发布成功后,可以在“资产市场>组织共享”中查看发布的镜像。 已发布的镜像不能直接编辑和删除,需下线后才能编辑和删除。 发布中的镜像可以取消,取消后状态为发布失败。
新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能,通过获取示例数据,创建药物虚拟筛选任务并查看结果。
数据库资源管理 用户管理 作业清理配置 标签管理 消息中心管理 节点标签管理 医疗平台信息获取 性能加速资源管理 资源监控数据获取 存储资源查询 系统配置和供应商配置 系统配额及资源使用情况获取 父主题: API(医疗智能体平台)
执行以下命令初始化Anaconda配置。 export PATH=~/anaconda3/bin:$PATH source ~/.bashrc 测试安装。 conda -V 查看当前环境列表,并创建新环境参数。 conda env list conda create -n py37 python=3.7 输入“y”,按“Enter”继续。
大小:不超过20KB 描述 针对此应用的相关描述。 单击“立即发布”。 系统跳转到“我的发布”页面,可以查看发布的应用状态。当应用发布成功后,可以在“资产市场>组织共享”中查看发布的应用。 已发布的应用不能直接编辑和删除,需下线后才能编辑和删除。 发布中的应用可以取消,取消后状态为发布失败。
选择需要引用的项目以及项目中的应用,选择应用的版本。“导入应用名称”是选填项,可以使用原有名称,或自定义。 图2 导入应用 单击“确定”,导入应用,导入过程中可以查看每个应用的导入状态。 父主题: 工具管理
理员”。 配置完成后,单击“确定”。 等待导入成功后,单击“关闭”。可以在用户管理页面查看导入成功的用户信息。 导入的用户,不支持删除,只支持移除,移除后不影响该用户操作其他服务。 图2 查看导入用户 医疗平台用户会在IAM中赋予以下细粒度权限,若该用户加入的其他IAM用户组有对
project-demo-image:v1.0 执行health docker images命令查看已有的镜像。 详细的命令介绍请参见“命令行工具 > 镜像管理命令”章节。 单击“镜像”,在镜像列表中查看已上传的镜像。 图1 镜像列表 【可选】单击“镜像类型”,对上传的镜像进行分类。 上传
源配额。 配置完成后,单击“确定”。 等待导入成功后,单击“关闭”。可以在用户管理页面查看导入成功的用户信息。 导入的用户,不支持删除,只支持移除,移除后不影响该用户操作其他服务。 图3 查看导入用户 医疗平台用户会在IAM中赋予以下细粒度权限,若该用户加入的其他IAM用户组有对
若当前所在目录为src2,新增子目录dataset。 health mkdir dataset # 创建成功不进行提示,可以使用health ls命令查看目录 父主题: 数据管理命令
他用户,并限定其他用户的访问权限。项目角色为项目粒度权限控制,同一用户在不同的项目上可能拥有不同的角色。 创建的项目配额请参见配额管理进行查询。详细添加项目成员并分配角色的方法请参见添加项目成员。 父主题: 项目管理
库,可以通过DETAIL查看所匹配的子结构特征。 Genotoxic Carcinogenicity Rule: 117个子结构,含有该子结构可能通过遗传毒性引起致癌性或者致突变性。 结果解释:数值代表有多少个子结构匹配此数据库,可以通过DETAIL查看所匹配的子结构特征。 NonGenotoxic
他用户,并限定其他用户的访问权限。项目角色为项目粒度权限控制,同一用户在不同的项目上可能拥有不同的角色。 创建的项目配额请参见配额管理进行查询。详细添加项目成员并分配角色的方法请参见添加项目成员。 父主题: 项目管理
用户可将归档数据恢复到项目桶,恢复到项目桶后,平台不会进行删除(恢复到项目桶中的数据会正常收取标准存储的费用)。 在归档管理页面,可以在“归档天数”列查看已归档天数(从归档拷贝完成时间开始算)。若用户早于90天删除归档数据,将收取费用,收取的费用=对应存储类别存储空间按需月单价*容量*剩余天数/30,超过90天不需要补。
Container,简称SWR)进行简单易用、安全可靠的镜像管理。单击项目名称,进入所选项目,在“镜像”页签中,以列表形式展示了项目中的镜像。您可查看镜像的详细信息,执行镜像分类、添加描述、删除和查询操作。 图1 镜像管理 镜像用途 用于创建分析应用 应用是生物信息学软件的镜像封装。例如,您可将Cell Rang
“\t”,有效数据从第2行开始,跳过文件行数填写为1。 在本地编写.csv、.txt、.vcf文件时,文件编码格式使用UTF-8。 为保证查询性能,建议数据库行数小于500万行,若超过该量级,建议拆分数据库。 导入数据文件大小建议小于1GB。 新增的double类型数据,double的取值范围是-2^1024
功能描述 阶段 相关文档 1 医疗智能体EIHealth平台迭代更新 资产市场,提供官方发布的镜像、数据、应用、流程资产。 提供了数据库的创建、查询和管理能力。 支持药物虚拟筛选能力。 命令行工具迭代更新。 开放镜像管理类API。 商用 用户指南 命令行工具 API参考 2021年3月
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