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配置节点互信 配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行,推荐使用互信免密登录。 # 生成ssh公钥和私钥 ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如:ssh-copy-id
性能计算集群。 HPC的业务特点 科学研究、气象预报、仿真实验、生物制药、基因测序、图像处理等行业都涉及高性能计算集群来解决大型计算问题,管理节点对计算任务进行分解,交给不同的计算节点完成计算。 各种业务场景下,因数据处理量、计算任务关联关系等不同,对计算能力、存储效率、网络带宽及时延要求有各自侧重。
修改Makefile文件02 执行以下命令,编译lammps,并将当前目录生成的lmp_mpi文件拷贝至“/share”目录。 make mpi 步骤3 配置lammps 算例输入文件。 以melt为例,生成一个算例melt.in文件。设置每迭代100步生成一个checkpoint文件,假定该文件存放在共享目录“/share”中。内容如下:
集群进行扩容操作以增加节点数。 只有状态为“运行中”的集群可进行扩容操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要扩容的集群,单击后方操作中“扩容”,进入扩容的详情页面。 选择“计费模式”。 集群扩容时,可选择和原有计费模式不同的计
如果您希望裸金属服务器拥有独享的存储设备,请您在开通专属云后申请专属企业存储,再创建裸金属服务器。 了解和申请专属企业存储,请参见《专属企业存储用户指南》。 操作步骤 登录管理控制台。 选择“计算 > 裸金属服务器”。 进入裸金属服务器页面。 单击“购买裸金属服务器”。 进入购买页面。 如果您已申请专属云,并希望
world_size); //FinalizetheMPIenvironment. MPI_Finalize(); } 执行以下命令,生成可执行文件,假设在/home/linux目录下生成。 # mpicc hello.c -o spe_hello 不同版本的MPI运行的hello文件是不同的,因此,
图2 环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个ECS上运行Intel MPI。 执行以下命令,重新生成可执行文件。 # cd # mpicc hello.c -o intel_hello 执行以下命令,在单个ECS上运行Intel MPI。
Intel MPI环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行Intel MPI。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行Intel MPI。 $ mpirun -np
图2 MPICH环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 $ mpirun -np 2
当前指定区域的ECS节点。 计算节点状态为“运行中”。 计算节点与管理节点为相同的CPU架构。 计算节点与所选管理节点有相同的VPC、安全组。 计算节点与管理节点使用的是同一镜像主版本。 所选的计算节点数不超过50个。 选择“虚拟私有云” 虚拟私有云为选定的管理节点所在的VPC,无需选择。 设置“登录方式”。
which mpirun 图3 环境变量正常 回显如图3所示表示环境变量正常。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ cd ~ $ vi hello.c 编辑内容如下: #include<mpi.h> #include<stdio
管理共享存储 操作场景 HPC解决方案服务的管理控制台提供了弹性文件服务SFS的自定义挂载和卸载的功能。集群创建完成后,您可以在共享存储页面为集群挂载/卸载弹性文件服务。通过弹性文件服务SFS为集群提供共享存储的功能。 当集群为运行状态时,您可以选择挂载/卸载弹性文件服务。当集群
检查MPI环境变量 在单个BMS上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 假设hello.c文件在“/home/rhel/”目录下,生成的可执行文件名为hello,执行以下命令: $ cd /home/rhel/ $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上通过Spectrum
which mpirun 图3 环境变量正常 回显如图3所示表示环境变量正常。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ cd ~ $ vi hello.c 编辑内容如下: #include<mpi.h> #include<stdio.h>
集群节点锁挂在的数据盘是不会删除的,需要用户手动删除清理,否则会继续扣费。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面,对于不需要或异常的集群可进行删除操作。 按需类型集群 确定页可选择是否删除云服务器,如勾选,连同云服务器一同删除,如不勾选
操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要启动的集群,单击后方操作列“更多 > 启动”。 单击“确定”。 在集群管理页面,待操作正常完成,集群状态变为“运行中”。 父主题: 集群管理
按需类型的集群,如暂时没有任务需要执行,可使用集群停止功能对集群进行管理操作以节省费用。 包周期资源不适用,关机后仍继续扣费,需手动退订后可停止扣费。 有集群状态为“运行中”的集群可进行停止操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要停止的集群,单击操作列“更多
登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”。 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。 选择要启动的节点,单击操作中“更多 > 启动”。 单击“确定”。 提交成功后,返回到节点管理页面,待操作完成节点状态变为“运行中”。 父主题: 节点管理