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pwd # 若在本项目目录下,返回结果如下 /src2/ # 若在引用项目目录下,返回结果如下 project_b:/src2/ 父主题: 数据管理命令
successfully! 恢复归档数据到test-folder health restore archive 123456 -d test-folder/ # 返回结果如下 restore archive 123456 successfully! 父主题: 数据管理命令
清理Nextflow缓存 功能介绍 清理Nextflow缓存 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1/{project_id}/nextflow/clean-cache
资源中心 在资源中心可以查看功能调用套餐包和存储套餐包的使用情况、购买记录以及购买套餐包,也可以绑定CSS资源详细的购买步骤可以参考购买资源,此功能只支持专业版。 绑定CSS资源 使用自定义数据库之前需要先购买和绑定CSS资源,购买步骤参考购买资源,绑定具体操作如下: 在盘古辅助
用户,如果来源为IAM,则只支持移除。 项目是存储数据、镜像、分析作业等的工作空间,执行删除用户操作时,只有在该用户名下没有项目时,才可以被删除。在用户的操作列,单击“删除”,删除对应的用户。 图1 删除子用户 移除子用户 导入的用户,不支持删除,只支持移除。移除后不影响该用户操
全部接收:自己有权限访问的项目中产生的操作,包含自己和其他项目成员所执行的操作。默认为全部接收。 不接收:不接收操作通知。 接收类型 数据操作:数据的复制、删除、导入等异步操作通知。 作业进度:分析作业开始执行、执行成功通知。 系统消息:项目删除、内存使用量告警、消息清理通知。 图3 消息通知
archive-region cn-north-7 # 返回结果如下 update archive region successfully! 父主题: 数据管理命令
删除资产指定版本 功能介绍 删除资产指定版本 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI DELETE /v1/{project_id}/assets/{asse
受体蛋白:受体蛋白文件,支持PDB、PDBQT格式。 图3 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库模板:使用资产市场订阅的流程时,模板已预置,无需选择数据库模板。 数据库名称:数据库的名称。 输出文件格式:可以将流程生成的分子对接结果,保存为
获取供应商列表 功能介绍 获取供应商列表 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project_id}/vendors 表1 路径参数 参数
步骤5:下载数据 使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地,此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中,受网络影响可能出现损坏,下载命令默认会在下载完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。
com/lh3/bwa.git cd bwa;make 请预先安装好Git,并检查本机是否有ssh key设置。 输入exit退出容器。 查询容器id。 docker ps -a 制作快照。 docker commit -m "xx" -a "tsj" container-id tsj/image:tag
安装Nextflow 功能介绍 安装Nextflow(file和version参数必须提供其中一种) 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1
本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后,在医疗智能体平台搭建NGS流程,执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能,通过获取示例数据,创建药物虚拟筛选任务并查看结果。
药物数据输入格式说明 药物虚拟筛选平台的输入数据,需要输入蛋白质和配体小分子数据。参考以下数据要求,将数据上传至项目中。 输入蛋白质,pdb格式,将要进行对接的所有靶标蛋白放在一个文件夹内。 输入配体小分子,配体小分子为如下格式的txt文件。 第一列为smiles字符串,第二列为smiles名称,中间用tab键分割。
药物数据库管理 创建数据库 获取数据库列表 删除数据库 更新药物数据库 数据库追加文件 父主题: API(盘古辅助制药平台)
___________________] ?% tps:0.00 0/0 236ms Warn: No task to run 父主题: 数据管理命令
操作资产发布状态 功能介绍 操作资产发布状态 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1/{project_id}/assets/{asset_
开启容量限制开关后,设置最大存储量。 图7 容量限制 设置成功后,单击“确定”。 项目存储量15分钟刷新一次,如果设置了项目最大存储量,项目数据达到最大存储量后,数据上传、复制、导入、执行的作业、notebook的使用会失败。 父主题: 项目管理
刊中。 论文链接:https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c00821 查看“神农项目”药物筛选结果 登录EIHealth平台,可在“专题”页签中查看“神农项目”药物筛选结果。可参考视频介绍了解详细的使用指导。 在图2中,页面最右侧显示结合能的最大值和最小值,以及对应的列名称、行名称。