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由一个应用组成。 您可以使用该工具创建流程,并进行修改、删除、查询、导入操作。对于由多个应用构成的流程,可通过设置不同应用的输入、输出关系搭建为流程。 作业管理 您可以使用该工具启动分析作业,并进行查询、删除、重试、取消操作。 notebook 您可以使用该工具创建noteboo
pdb格式文件,最多上传100个靶点文件,如果上传多聚体靶点,仅解析第一条链,每个靶点的氨基酸序列长度不超过2048。 图2 靶点配置选择文件 输入PDB ID,最多输入100个PDB ID,用逗号或换行方式隔开;不区分大小写;如果输入多聚体靶点,仅解析第一条链;每个靶点的氨基酸序列长度不超过2048。
/e6dcd289-dadb-48d9-b53b-e0c6c256932e/q07ae83e-b12c-4137-b417-0fa3ac61094c/nextflow.log run ./e6dcd289-dadb-48d9-b53b-e0c6c256932e/q07ae83e
开启公共读权限 开启公共授权,则数据全网可见,所有用户均可访问。 配置公共读可参考配置标准桶策略,将桶策略设置为“公共读”。一般私密数据不建议用此方法。 目前仅支持访问用户个人OBS下的链接,不支持读取其他用户公共读的链接。 上传待检测的图片 请参见OBS文档上传对象。 获取图片URL
选择模型数据。可选择数据中心数据,或者示例数据。 仅支持CSV格式,数据条数支持100-50000条,文件不大于5MB。 组织共享 如果关闭,则该模型只能自己使用。 如果开启组织共享,则其他子用户也可以使用您的模型做分析。 默认为关闭。 单击“确定”。 每人最多可以创建100个模型,每次使用模型时,最多可以使用10个。
形成完整的计算工作流。 在EIHealth平台,创建流程通过拖拽应用的方式完成。在命令行工具中,该过程以配置文件的形式给出,对于由多个应用搭建出来的流程,命令行工具中通过指定不同应用间的输入输出关系,完成应用的连接。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建流程,创建好的流程将同步显示到EIHealth平台。
"create_time": "2023-03-01T01:53:07Z", "update_time": "2023-03-01T01:53:07Z",
AM用户在导入平台之前就已经加入了10个用户组,则导入的时候会失败。 用户数统计时会去重。例如,用户组A有50个用户, 用户组B里有50个用,两者之间有10个用户重复,那么同时选择用户组A和B,统计时显示已选择90个用户。 如果导入后用户状态显示异常,需联系技术支持处理。 单击“
态的计算节点,将无法在此节点运行作业。 通过“新建流程”时创建 在“工具”页面,单击“新建流程”,填写流程信息。请参考新建流程操作。 流程搭建完成后,单击“新建作业”。 图1 新建作业 在新建作业弹窗中单击“确定”。 图2 新建作业 在弹出的作业设置页面,填写作业信息。“作业名称
1, "jobs" : [ { "id" : "78dfce53-0303-4b46-a2d9-4a067812b289", "workflow_job_id" : "78dfce53-0303-4b46-a2d9-4a067812b289", "name"
AM用户在导入平台之前就已经加入了10个用户组,则导入的时候会失败。 用户数统计时会去重。例如,用户组A有50个用户, 用户组B里有50个用,两者之间有10个用户重复,那么同时选择用户组A和B,统计时显示已选择90个用户。 如果导入后用户状态显示异常,需联系技术支持处理。 单击“下一步”,设置角色。
"latest_job" : { "id" : "78dfce53-0303-4b46-a2d9-4a067812b289", "workflow_job_id" : "78dfce53-0303-4b46-a2d9-4a067812b289",
"synthesis_routes" : [ { "route" : [ "1", "2" ], "score" : 0.3467 }, { "route" : [ "1", "3" ], "score" :
"SUCCEEDED", "create_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "tool_info" : { "tool_id" : "baabcb
创建应用 登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 应用”页签,单击“新建应用”。 图1 新建应用 依据“应用参数说明表”依次创建搭建NGS流程所需的应用。 图2 填充应用内容 对于测序得到的大量数据,如果需要批量执行NGS分析,可以选取以下任意一种方式进行批量执行: 方式一
药物通用接口 生成分子SVG图 生成分子SDF三维结构 受体预处理 受体信息解析 受体口袋检测 配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务
命令示例 health stat huo:/huo/ --bf human-readable Start at 2022-09-01 06:53:01.0466497 +0000 UTC Key: obs://xxx/huo/ LastModified: 2022-08-30T11:13:48Z
asks" : false, "create_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "workflow_name" : "demo-workflow", "workflow_id"
amberGS, charmm27, oplsaa, gromos43a1, gromos43a2, gromos45a3, gromos53a5, gromos53a6, gromos54a7力场,默认是amber99sb。 水模型:水模型支持spc, spce, tip3p, tip4p
amberGS, charmm27, oplsaa, gromos43a1, gromos43a2, gromos45a3, gromos53a5, gromos53a6, gromos54a7。 缺省值:amber99sb ion_type String 离子种类,支持选择NaCl、MgC