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靶点口袋分子设计 基于盘古药物分子大模型,靶点口袋分子设计功能主要是能够根据给定的口袋和小分子利用AI的预测出更优小分子。 单击“靶点口袋分子设计”功能卡片,进入配置页面。 在配置页面上传靶点结构,及配置其他参数。 图1 查看配置页面 靶点结构:选择靶点结构文件,仅支持PDB格式。
枚举值,取值范围:max(最大值)、min(最小值)、average(平均值),不填时默认为max 缺省值:max metric_name 是 String 查询的监控指标名称 resource_id 否 String 查询的监控资源对象id,当查询存储资源和计算节点资源中的集群监控数据时
--e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。 --t -n 否 指定用户的securitytoken。
请依据实际购买平台的区域填写。当前支持华北-北京四(cn-north-4)、华东-上海一(cn-east-3)。 --platform-id 是 平台ID,获取方法请参见步骤1:获取认证信息。
running_job_count Integer 作业运行数 job_quota Integer 运行的最大作业数量 create_time String 购买时间 failure_reason String 失败原因 status String 状态 schedulable
--e -P 附加参数,可选 指定终端节点。 --i -i 附加参数,可选 指定用户的AK。 --k -k 附加参数,可选 指定用户的SK。 --t -n 附加参数,可选 指定用户的securitytoken。
包括运行状态、标签、描述、创建时间、完成时间、运行时间、计算节点标签、加速类型、优先级等。单击“概述”列按钮,在展开的信息栏中查看作业的输入&输出、节点参数、应用;在作业的子任务中可以查看日志、事件;在事件页签,可以查看实例的事件详情、下载YAML文件、查看监控。
如果性能加速节点不可用或作业配额不足,重试作业时,超过配额的作业会重试失败。 图1 分析作业 图2 作业搜索 父主题: 作业管理
spec TaskInstanceSpecRsp object 实例cpu和内存使用率信息 表6 TaskInstanceStatusRsp 参数 参数类型 描述 phase String 实例执行状态 pod_ip String 实例IP host_ip String 实例所在节点
resource_id String 资源ID spec DatabaseSpecDto object 数据库规格信息 disk DatabaseDiskDto object 数据库磁盘信息 charge_mode String 计费模式 period_num Integer 购买周期
开通医疗智能体平台API 进入EIHealth控制台,购买医疗智能体平台成功后,医疗智能体平台API自动开通成功。 开通AI辅助药物设计和临床研究API 进入EIHealth控制台,在页面左上角切换区域“华东-上海一”。
最大长度:128 io_acc_expected_usage 否 Integer 作业使用的SFS-Turbo实例预期占用存储量,单位G,用于投递作业时评估当前加速实例余量是否充足 最小值:0 最大值:327680 node_labels 否 Array of strings 节点标签
状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 idle_time Integer 空置时间 threshold Integer 缩容阈值 delay_after_add Integer 扩容后多久再次判断缩容 delay_after_delete Integer 节点删除后多久再次判断缩容
node_labels: # 计算节点标签 标签个数取值范围[0-1],单个节点标签最大长度56个字符,以字母或数字开头,可以包含下划线(_)、中划线(-)、点(.)
- 'echo eihealth;' node_labels: # 计算节点标签 标签个数取值范围[0-1],单个节点标签最大长度56个字符,以字母或数字开头,可以包含下划线(_)、中划线(-)、点(.)
其中单个文件夹名称不能以中划线(-)开头,不能以英文句号(.)或斜杠(/)或空格开头或结尾 最小长度:0 最大长度:128 output_dir_type 否 String 输出路径的类型 node_labels 否 Array of strings 节点标签 取值范围[0,1],
StorageResourceRsp objects 存储资源列表 表4 StorageResourceRsp 参数 参数类型 描述 spec SpecDto object 规格信息 size Long 使用量 charge_mode String 计费模式 create_time String 购买时间
为什么下载的部分靶点文件,显示不完整 由于molstar插件自身问题,部分靶点文件中存在REMARK行,会导致受体展示不完整。可通过手动删除文件中REMARK行来解决该问题。 如下所示: 分子优化靶点设置界面,受体展示正常。 但是下载该靶点文件后,使用通用工具Mol 3D Viewer
--e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。 --t -n 否 指定用户的securitytoken。 --v -v 否 按指定的对象名前缀批量删除多版本对象和多版本删除标记。
空置时间 最小值:1 最大值:10080 threshold 否 Integer 缩容阈值 最小值:1 最大值:100 delay_after_add 否 Integer 扩容后多久再次判断缩容 最小值:5 最大值:10080 delay_after_delete 否 Integer 节点删除后多久再次判断缩容