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满足不同开发者需求。 产品功能 eihealth-toolkit提供了以下功能: 系统设置 您可以使用该工具获取系统标签、系统资源、系统配额信息、消息列表,查询和修改消息及完成作业保留配置,也可以获取和修改供应商logo、名称设置。 项目管理 您可以使用该工具获取、切换、创建、
Key)加密调用请求。 Token认证 Token的有效期为24小时,需要使用同一个Token鉴权时,可以缓存起来,避免频繁调用。 Token在计算机系统中代表令牌(临时)的意思,拥有Token就代表拥有某种权限。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限。
-c命令清除历史记录,重新登录命令行工具后,记录可恢复。执行rm -f $HOME/.bash_history命令,可删除记录文件,清空历史。 macOS系统:执行ps -p $$命令检查shell类型。 类型为bash:操作与Linux系统相同。 类型为zsh:执行history
业。 用于创建Notebook Notebook是一个交互式应用程序,用于代码的编写、调试、运行。创建Notebook时,您可以选择系统镜像。当系统镜像无法满足您的开发需求时,您可以基于EIHealth提供的基础镜像包制作自定义镜像,并上传至平台。您可以在EIHealth平台“开
了修改,最终修改结果以参数命令为准。 对于可选参数,如果命令中包含了特殊字符,需使用""括起来。 如果特殊字符中包含了双引号,需依据不同操作系统对特殊字符的规范来设置参数命令,例如: # 原镜像启动命令 bash -c "source activate my-rdkit-env &&
untu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。 步骤1:新建fastqc镜像 在linux环境上配置docker环境。 curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 配置完成后,运行do
关键概念 镜像 运行生物信息学软件,往往由于不同的操作系统(Windows、Linux、Mac等)原因,无法实现统一的运维管理。同时,这些软件具有不同的版本和软件包,安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像,可以使程序在不同的环境中运行,并通过EIHealth平
打分阈值,分值必须大于该阈值才会返回 num_results 否 Integer 期望最大返回条目数(排序后取Top) custom_props 否 Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合 表4 CustomProp 参数 是否必选 参数类型 描述 id 是
配置靶点文件和相关参数信息。 靶点文件:支持PDB格式文件,文件大小不能超过10M。若文件中含有多个受体,默认只处理第一个。 靶点预处理: 去配体:提交任务时系统会自动删除配体。 是否平衡电荷:是否加入离子,使体系电荷守恒,默认是平衡电荷。 蛋白力场:蛋白质力场支持amber03, amber94,
生效时间 选择购买套餐包后的生效时间。目前支持支付完成后立即生效和指定生效时间两种方式。 如果支付时间晚于指定生效时间,资源包将在支付后立即生效。 图2 购买套餐包 设置完成后,单击“立即购买”,然后单击“确认”。 在云服务订单页面,单击“确认付款”。 购买成功后,可以在“套餐包”页面查看套餐包信息。
smiles 是 String 分子SMILES表达式 custom_props 否 Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合 表4 CustomProp 参数 是否必选 参数类型 描述 id 是 String 自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1
num_expected Integer 期望最大返回条目数(排序后取Top) binding_site BindingSite object 结合位点 custom_props Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合 表5 OptimizationResult
concurrent: vars_iter # 是否并发,取值 vars_iter 时为开启并发状态,不设置则不开启 description: '' # 参数描述。取值范围:[0-255]
期望最大返回条目数(排序后取Top) initial_dataset Array of strings 初始化分子集合 binding_site BindingSite object 结合位点 custom_props Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合
数据文件的名称,不可以含有特殊字符。如果文件名包含特殊字符,将不支持下载,可通过去除文件名中的特殊字符方式解决。 查看数据作业 数据复制、数据删除等操作均为系统的异步任务,您可以在“数据作业”中查看任务的执行状态。同时,平台针对该类任务支持您在“数据中心 > 数据作业”中查看任务的执行信息。在数据
运行时,会将非最终结果的数据存储在SFS中用以提高任务运行效率,作业执行完成后会清理释放SFS空间。对于涉及频繁读写场景的任务建议开启IO加速,开启前需要先购买性能加速。 本地盘加速:使用计算节点的本地盘进行加速。使用本地盘加速时,需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的
successfully! 从外部并行文件系统中引用数据 health import data OBSFS:obsfs-buckt-name:/path1/ # 返回结果如下 reference data successfully! 执行上述三个命令成功后,项目根目录层级显示如下: ├─lmx-test-project
concurrent: vars_iter # 是否并发,取值 vars_iter 时为开启并发状态,不设置则不开启 description: '' # 参数描述。取值范围:[0-255]
数字、中划线(-),开始只能是小写字母,结束只能是小写字母或数字。 描述 Notebook的简要描述。 镜像类型 支持系统镜像和自定义镜像。 工作环境 选择系统镜像时,工作环境选择“PY3”。 自定义镜像:当提供的镜像无法满足您的需求时,可以使用自己制作的Notebook镜像。镜
-c命令清除历史记录,重新登录命令行工具后,记录可恢复。执行rm -f $HOME/.bash_history命令,可删除记录文件,清空历史。 macOS系统:执行ps -p $$命令检查shell类型。 类型为bash:操作与Linux系统相同。 类型为zsh:执行history