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响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Long 预置标签数量 labels Array of PresetLabelRsp objects 预置标签 表4 PresetLabelRsp 参数 参数类型 描述 name String 标签名称
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 labels 是 Array of UpdateNodeLabelReq objects 标签列表 数组长度:0 - 100 表4 UpdateNodeLabelReq 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 标签名称
响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Long 节点标签数量 labels Array of NodeLabelRsp objects 数据对象列表 表4 NodeLabelRsp 参数 参数类型 描述 name String 标签名称
状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Long 标签列表个数 labels Array of LabelRsp objects 标签详情 表4 LabelRsp 参数 参数类型 描述 id String 标签id name String 标签名称
需要您熟悉所制作的生物信息学软件的使用并具备一定的开发经验。 例如,设置FastQC应用的参数和镜像启动命令时,首先通过阅读FastQC介绍和FastQC命令说明了解软件的使用。并依照FastQC的调用命令设置参数和镜像启动命令。 图1 FastQC命令 父主题: 流程、作业
residues 否 Array of strings 残基列表,当识别模式为残基时提供。
FastQC是一款高通量序列数据的质量检测工具,此样例基于开源的FastQC软件,将软件制作成镜像,上传至平台,并基于此镜像创建应用。应用创建完成后可以直接使用FastQC应用,或将其编排至流程,和其他应用一起使用。
应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 在EIHealth平台,创建应用的过程通过图形化的界面操作完成。在命令行工具中,该过程以配置文件的形式给出。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建应用,创建好的应用将同步显示到EIHealth平台。
应用是生物信息学软件的镜像封装。您可以将软件制作成镜像,并将镜像上传至EIHealth平台,通过应用引入镜像。制作好的应用可以单独使用,也可以将多个应用编排入流程串联使用。在“项目管理”页面“工具”页签中,以列表形式展示了项目中的应用。
Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作,只需聚焦于科研工作,从而加快科研进展。 关于Jupyter Notebook的详细操作指导,请参见Jupyter Notebook使用文档。
'description' # 流程描述 取值范围[0,65535],后续支持markdown文本 labels: # 流程标签,取值范围[0,5],标签名称长度为
基础通用类软件镜像,如Tomcat、Mysql、Ngnix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。
下载地址中带有sha256后缀的链接,指的是对应软件包的校验文件。例如:Windows x64版本的下载链接是health-windows-x86_64 ,它的校验文件下载链接则是health-windows-x86_64.zip.sha256。
下载地址中带有sha256后缀的链接,指的是对应软件包的校验文件。例如:Windows x64版本的下载链接是health-windows-x86_64 ,它的校验文件下载链接则是health-windows-x86_64.zip.sha256。
description: 'description' # 应用描述 取值范围[0,65535],后续支持markdown文本 labels: # 应用标签 取值范围[0,5],标签名称长度为
应用是对每个软件的镜像封装,将应用封装好后可以反复利用并也可以让其他人很容易的使用,不用担心复杂的开发环境问题。 流程是由1各或者N个应用串联构建而成,平台页面以简单拖拽、连接的方式将不同的应用连接起来构建成一个分析流程,避免了写繁杂的bash脚本。
上图示例中需要添加的标签名称为labelsss1。 使用本地已填写好的作业模板job.yaml运行分析作业。 health create job -y D:\job.yaml -d "详细描述" # 返回结果如下 submit job succeed!
Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作,只需聚焦于科研工作,从而加快科研进展。 镜像 Docker镜像是一个模板,是容器应用打包的标准格式,在部署容器化应用时可以指定镜像。
优化软件算法,如使用内存做缓存等,降低软件的IO需求。 针对特定的项目,对带宽或IO性能进行扩容。 提交工单或联系服务技术支持。 父主题: 流程、作业