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project test命令进入到名为test的项目中。 将本地数据上传到test项目中的src文件夹中。 详细的数据操作命令，如下载、删除、拷贝、切换路径等请参见“命令行工具 > 数据管理命令”章节“命令行工具 > 数据管理命令”章节。 将本地D:\local\data\test.
样者是否有患癌风险。 该流程以CNVkit为核心，基于输入的fastq，以hg38人基因组数据生成的参考基因拷贝数分布为参考基线，能够自动的完成输入数据的比对排序，以及拷贝数分布计算，并输出可视化图表以供查看。 我的发布 在“资产市场>我的发布”中可以查看该用户所有发布资产的情况
下情况时下载数据： 文件不存在。 下载文件大小与本地文件大小不一致。 文件的最后修改时间不一致。 --parallel -p 否 每个分段复制任务的最大并发数。 --jobs -j 否 下载文件夹时，批量任务的最大并发数，默认为5。取值范围[1,10]。 --fr -R 否 下载对象时生成结果清单文件。
images命令后面添加 | grep pegi3s使查询更精准。 查询fastqc软件命令。非常熟悉fastqc软件则可跳过此步骤。 复制上一步查找到的fastqc的id。利用docker run imagesId fastqc --help命令进行查询。fastqc --h
行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率，本章节介绍如何通过循环读取输入数据，批量运行NGS。同时，您也可以参考本示例，将批量运行的方法复制到其他的分析任务中。 配置命令行工具 批量执行分析需要通过命令行工具完成。请参考配置命令行工具章节，下载命令行工具并完成配置。 获取NGS作业配置文件
程，创建好的流程将同步显示到EIHealth平台。 获取流程模板 使用health get workflow -s命令获取创建流程的模板，复制模板并保存到本地，您可以保存成.yaml或txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 在本地编写模板，模板填写好后，再使用命
工具创建应用，创建好的应用将同步显示到EIHealth平台。 获取应用模板 使用health get app -s命令获取创建应用的模板，复制模板并保存到本地，您可以保存成.yaml或.txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 在本地编写模板，模板中的参数与在EI
”字符本身。首先执行exclude的匹配规则，如果待移动的对象名不匹配exclude，则判断待移动的对象名是否匹配该参数，如果匹配则移动该对象，否则跳过该文件的复制。 建议使用引号传递该匹配模式（macOS/Linux操作系统使用单引号，Windows操作系统使用双引号）防止特殊符号被操作系统转义，导
public-read-write：公共读写 bucket-owner-full-control：桶拥有者完全控制 --meta -E 否 复制对象时可指定的目标对象的自定义元数据。 格式为：key1:value1#key2:value2#key3:value3。 以上值表示上传对
作业”页签中，单击“上传作业”，在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具，执行health get job -s命令获取创建作业的yaml模板，复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或.txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 修改作业yaml模板。 在本地编写模板
责任。 将镜像中的genomeagent_examples/case1示例文件拷贝到本开发环境所在项目的OBS桶中，见example.ipynb教程代码框。 # 获取本开发环境项目的OBS桶目录，复制 'examples' 文件夹并切换到目标目录 import os import
beta-分泌酶抑制剂。0为非抑制剂，1为抑制剂，数值范围在0~1之间。 结果解释：预测值的范围在0~1之间。 HIV inhibitor： HIV 复制抑制剂。0为非抑制剂，1为抑制剂，数值范围在0~1之间。 结果解释：预测值的范围在0~1之间。 毒性（Toxicity） hERG Blockers：
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