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--parallel -p 否 每个分段复制任务的最大并发数。 --jobs -j 否 下载文件夹时,批量任务的最大并发数,默认为5。取值范围[1,10]。 --fr -R 否 下载对象时生成结果清单文件。
复制上一步查找到的fastqc的id。利用docker run imagesId fastqc --help命令进行查询。fastqc --help可以替换成任何fastqc的命令,与linux类似。 步骤2:上传镜像至EIHealth平台 配置命令行工具。
同时,您也可以参考本示例,将批量运行的方法复制到其他的分析任务中。 配置命令行工具 批量执行分析需要通过命令行工具完成。请参考配置命令行工具章节,下载命令行工具并完成配置。
获取流程模板 使用health get workflow -s命令获取创建流程的模板,复制模板并保存到本地,您可以保存成.yaml或txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。 在本地编写模板,模板填写好后,再使用命令行工具上传模板,创建流程。
获取应用模板 使用health get app -s命令获取创建应用的模板,复制模板并保存到本地,您可以保存成.yaml或.txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。 在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。
首先执行exclude的匹配规则,如果待移动的对象名不匹配exclude,则判断待移动的对象名是否匹配该参数,如果匹配则移动该对象,否则跳过该文件的复制。
支持的值: private:私有读写 public-read:公共读 public-read-write:公共读写 bucket-owner-full-control:桶拥有者完全控制 --meta -E 否 复制对象时可指定的目标对象的自定义元数据。
使用命令行工具,执行health get job -s命令获取创建作业的yaml模板,复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或.txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。 修改作业yaml模板。
将镜像中的genomeagent_examples/case1示例文件拷贝到本开发环境所在项目的OBS桶中,见example.ipynb教程代码框。
HIV inhibitor: HIV 复制抑制剂。0为非抑制剂,1为抑制剂,数值范围在0~1之间。 结果解释:预测值的范围在0~1之间。