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流程 EIHealth中的分析流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。 分析流程至少由一个应用组成,在多个应用构成的流程中,一个应用的输出作为另一个应用的输入,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。
流程不存在等等 user_name String 自动作业的创建者 tool_info ToolInfoDto object 作业依赖的组件信息 database_id String 自动作业依赖的数据表ID database_name String 自动作业依赖的数据表名称 表
String 项目桶名 swr_namespace String 项目组织名 creator String 项目所有者 role String 当前用户在该项目上的角色 roles Array of ProjectRoleRsp objects 项目角色列表 size Long 项目桶存储量
文件来源包括数据中心和示例数据。 手动输入:输入小分子SMILES表达式。最多支持输入1000行,每行最多输入512个字符,SMILES不支持输入空格或者中文。 选择基模型:选择基模型,此参数只有专业版支持。基模型列表见AI建模。 选择属性模型:选择AI模型。
最小长度:1 最大长度:64 data_disk_size 否 Integer 额外数据盘大小 最小值:100 最大值:32768 cpu_rule_enable 是 Boolean 是否启用cpu规则 cpu_percent 是 Integer cpu分配率百分比 最小值:1
database_id String study作业结果的数据库实例id relative_path String 生成study作业结果的文件的相对路径 output_file_type String 生成study作业结果的文件的类型 workflow_name String
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Long 数据对象(目录,文件)总数量 datas Array of TraceDataRsp objects 数据对象列表 bucket_size Long
参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户 token 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 smiles 是 String 分子SMILES表达式 databases 是 Array of strings 搜索使用到的数据库集合
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Long 节点标签数量 labels Array of NodeLabelRsp objects 数据对象列表 表4 NodeLabelRsp 参数 参数类型
图5 Terminal 例如,您可以执行wget命令在公开数据集中下载基因组测序数据。 图6 执行命令 父主题: 开发环境(Notebook)
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Long 节点标签数量 labels Array of NodeLabelRsp objects 数据对象列表 表4 NodeLabelRsp 参数 参数类型
400 eihealth.03001002 invalid task data 根据错误详细信息中提供的信息检查任务数据。 父主题: 附录
database_id String study作业结果的数据库实例id relative_path String 生成study作业结果的文件的相对路径 output_file_type String 生成study作业结果的文件的类型 workflow_name String
解决方案 更改分析存储介质,例如使用更高性能的IO加速方案(SFS Turbo、EVS),如使用SFS Turbo加速,在投递作业时可以选择“IO加速”。 降低通量运行,进而降低带宽、IO需求,使得带宽、IO满足生产需求。 优化软件算法,如使用内存做缓存等,降低软件的IO需求。
最小值:0 最大值:1000 databases Array of strings 可供搜索分子的公共数据库名称列表。
最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 data_event 是 Array of strings 审计数据类型列表 数组长度:0 - 2 枚举值: READ WRITE 响应参数 无 请求示例 更新项目追踪器配置,设置为统计写操作
步骤5:获取分析结果 在“作业”列表中,可单击作业名称查看作业信息和输入输出数据。 图8 查看作业信息 单击输出路径,可跳转至输出文件位置。html文件支持在线预览,zip文件可下载至本地查看。 图9 输出数据 图10 预览html文件 图11 获取zip文件 父主题: 运行作业
ACTIVE、INACTIVE 枚举值: ACTIVE INACTIVE tags 否 Array of strings 项目标签 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0 - 5 is_core 否 Boolean 是否为核心项目标记 storage_quota 否 Long 项目数据容量配额
EIHealth平台应用的基础设施如下: 统一身份认证(IAM) 容器镜像服务(SWR) 对象存储服务(OBS) 关于如何查看配额,如何申请扩大配额,请参见“《用户指南》 配额管理”章节。
最小长度:1 最大长度:20 file 是 String 分子聚类源数据。 最小长度:1 最大长度:2000 output_dir 是 String 分子聚类输出结果。