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health get label # 执行成功返回结果如下 Id Label Creator Created Updated Description d242057
命令示例 health nextflow create workflow -n h2 -w "D:\testzip.zip" -d "h test" -l "a,b" -m "m.nf" -p "D:\param1.json" { "id": "5b5cd09c-bc14
project id is xxx. 父主题: 项目管理命令
password" ], "catalog": [ { "endpoints": [ { "region_id
查询容器id。 docker ps -a 制作快照。
如:-l "[\"h1\",\"h2\"]" --node -n 是 计算资源节点id --operation-type -t 是 对计算资源的操作:[add-labels \| delete-labels \| stop \| reboot \| start \| schedulable
创建数据库 创建数据库 数据库支持使用.csv、.txt、.vcf文件生成数据库。创建的数据库需要保证数据文件与模板对应。创建数据库时,可以不选择导入的数据文件,建立空的数据库,后期可以新增数据行或者导入数据。如果使用自动作业的数据表创建数据库,在导入数据,需要参照数据库模板格式进行导入
复制上一步查找到的fastqc的id。利用docker run imagesId fastqc --help命令进行查询。fastqc --help可以替换成任何fastqc的命令,与linux类似。 步骤2:上传镜像至EIHealth平台 配置命令行工具。
add platform-id successfully! add user-name successfully! add password successfully! add domain-name successfully!
应用配置文件说明 EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 在EIHealth平台,创建应用的过程通过图形化的界面操作完成。在命令行工具中,该过程以配置文件的形式给出。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建应用
-6d95566b-f0c6-4615-b876-678686ec96e3/tmp --> obs://eihealth-6d95566b-f0c6-4615-b876-678686ec96e3/t1/tmp, cost [356], status [200], request id
管理数据库 管理数据库 数据库创建完成后,您可以对数据库内的数据执行编辑、删除、新增行操作。预制数据库和引用数据库不支持编辑、删除、新增行操作。 编辑 数据库创建完成后,单击数据库名称进入数据库详情页,在页面左上角单击“编辑”按钮。 在需要修改的数据行的操作列单击“编辑”,修改数据
自动作业管理 获取自动作业模板列表 创建自动作业模板 删除自动作业模板 更新自动作业模板 查询自动作业模板 启动自动作业 停止自动作业 父主题: 应用管理
sample-id string 文件前缀,如NA12878。 输出参数 sorted-bam file 比对和排序之后得到的bam文件。 flagstat-file file 基于bam做统计。
数据库管理命令 创建数据库模板 获取数据库模板 删除数据库模板 导入数据库模板 创建数据库实例 获取数据库实例 删除数据库实例 引用数据库或者导入数据到指定数据库 修改数据库实例
数据库管理 数据库简介 创建数据库模板 导入数据库模板 创建数据库 引用数据库 管理数据库 父主题: 用户指南(基因平台)
创建虚拟药物筛选任务 创建药物虚拟筛选任务 虚拟药物筛选可以使用资产市场中预置的“Docking Summary”流程对小分子化合物配体和蛋白受体进行对接。 使用步骤如下所示。 登录医疗智能体平台,在“资产市场”中订阅“Docking Summary”流程至所需的项目中。 进入“专题
sample-id string 文件前缀,如NA12878。 输出参数 sorted-bam file 比对和排序之后得到的bam文件。 flagstat-file file 基于bam做统计。
数据库管理 数据库管理 模板管理 父主题: API(医疗智能体平台)
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