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列举路径中的文件夹对象时，需使用/xxx/格式，如示例中的/src/。 如果路径中带有特殊字符比如（）之类的，运行的时候需要将整个路径用""括起来，或者用\将字符转义，例如：health cp "/src2/abs（1）.txt" /src1/ 或者 health cp /src2/abs\(1\)
上传数据前需要使用switch命令进入待操作的项目。 列举路径中的文件夹对象时，需使用/xxx/格式，如示例中的/src/。 列举本地路径中的文件夹对象时，需要使用路径/文件名或路径\文件名格式，如示例中的D:\local。 如果路径中带有特殊字符比如（）之类的，运行的时候需要将整个
您可以将数据恢复至本项目或有权限的其他项目。 数据归档成功后，选择“归档”页签。 图10 选择归档页签 选择需要恢复的数据，单击操作列“恢复”。在恢复归档数据页面，选择需要恢复数据的位置和数据。 图11 选择恢复数据的位置 单击“确定”。 父主题： 数据管理
分析作业管理简介 分析作业依托于流程运行，需要您先创建流程，再基于流程创建分析作业。 在“项目管理”页面“作业”页签中，以列表形式展示了项目中运行的分析作业和运行状态。您可以查看分析作业名称、标签、所使用的流程名称、版本、运行状态、创建者、创建时间、完成时间和总耗时。并可对作业执
使用“导入应用”功能，用户需是其他项目中的成员，且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 单击“导入应用”，进入导入应用页面。 图1 导入应用 选择需要引用的项目以及项目中的应用，选择应用的版本。“导入应用名称”是选填项，可以使用原有名称，或自定义。 图2 导入应用 单击“确定”，导入应用
项目管理常用操作 对项目执行冻结、解冻、转移、分享和删除操作时，需要项目成员具备相应的权限，不同类型成员所拥有的权限请参见成员角色和权限。 冻结：冻结项目。一个项目可能由于某些原因暂时中止，此时可以将项目暂时冻结，待下次重新启动时再激活。处于“冻结”状态的项目，用户无法进入该项目
计算资源说明 每个作业的运行依托的是后面的计算资源，所以需要管理员账号（主账号）提前购买计算资源。 若平台无计算资源，则投递的作业会出现等待情况，直至购买了计算资源或者任务超时才会停止。 单击平台右上角的账号名称，会出现账号的相关操作，包括系统资源，系统配置等。注意这里只有管理员
况、购买记录以及购买套餐包，也可以绑定CSS资源详细的购买步骤可以参考购买资源，此功能只支持专业版。 绑定CSS资源 使用自定义数据库之前需要先购买和绑定CSS资源，购买步骤参考购买资源，绑定具体操作如下： 在盘古辅助制药平台单击右上角“账号名>资源中心”进入CSS资源界面。 单
echo/ ) pause 图2 批处理文件说明 如果执行NGS批量任务时需要变更不同的原始数据、参考基因序列、测序平台、文件前缀等，请参考上述批处理文件示例，将需要变更的数据补充完整。 .bat批处理文件需要和命令行工具放在同一路径下，同时，命令行工具需为登录状态。 NGS配置文件示例
单击“新建作业”，在弹出的新建作业页面，填写作业信息。“作业名称”、“标签”、和“描述”，选择需要执行的流程，设置“输出路径”、“优先级”、“计算节点标签”、“超时时间”、“加速类型”。 基本信息：包含作业名称、标签、描述。 流程名称：选择需要执行的流程。 输出路径：存放输出结果的路径，格式以/开头。例如项目
数据管理常用操作 复制数据 下载数据 删除数据 查看3D 执行数据管理类操作需要项目成员具备相应的权限，详细的权限介绍请参见项目成员和权限。 数据文件的名称，不可以含有特殊字符。如果文件名包含特殊字符，将不支持下载，可通过去除文件名中的特殊字符方式解决。 查看数据作业 数据复制、
使用“导入流程”功能，用户需是其他项目中的成员，且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 单击“导入流程”，进入导入流程页面。 图1 导入流程 选择需要引用的项目以及项目中的流程，选择流程的版本。“导入流程名称”是选填项，可以使用原有名称，或自定义。 图2 导入流程 单击“确定”，导入流程。
安全设置 当您需要对账号的安全信息进行设置时，可以在“安全设置”中进行操作。平台的任一用户均可对自己的邮箱、手机号码和密码进行修改。 在平台右上角用户名中选择“个人设置”，在“安全设置”中修改账号的安全信息。 图1 安全设置 如果创建平台用户时，未填写邮箱或手机号，则在进行安全设置时，会提示设置邮箱或手机号。
项目名称长度限制3-45，以小写字母数字开头结尾，全文包含数字、小写字母、下划线、中划线。 核心项目 如果设置该项目为核心项目，不支持立即删除，会进入待删除项目列表。删除项目需要等待7天保留期，到期后系统自动删除。 说明： 一旦设置为核心项目，不可变为非核心项目，非核心项目支持变为核心项目。 标签 设置项目标签。 描述
应用”页签，单击“新建应用”。 图1 新建应用 依据“应用参数说明表”依次创建搭建NGS流程所需的应用。 图2 填充应用内容 对于测序得到的大量数据，如果需要批量执行NGS分析，可以选取以下任意一种方式进行批量执行： 方式一：对于输入参数，打开“并发”开关，在启动作业时，每个参数可以设置多个参数
自定义数据库 盘古辅助制药平台支持用户自定义数据库，可以上传自己的数据构建自己的数据库，进行后续的分子搜索。构建自定义数据库需要先购买CSS资源和绑定CSS资源，详情见资源中心 自定义数据库 返回主页，单击“自定义数据库”进入界面，单击页面左上角的“创建数据库”，并填写相关信息。每个用户可新建100个自定义数据库。
instance-id 无 否 数据库实例 id，不填写时表示获取数据库实例列表，填写时表示获取数据库实例详情。 --data -d 否 是否查询数据库数据，需要和database-id参数一起使用。 --limit -l 否 限制量，默认为10，取值范围[0,1000]，只有在--data参数使用时才生效。
使用NGS的详细步骤如下所示： 步骤1：订阅流程 步骤2：上传待分析数据 步骤3：创建分析作业 步骤4：查看执行结果 步骤1：订阅流程 使用NGS流程前，需要您在资产市场中订阅该流程。 在“资产市场”中查找“Variant Calling Based On NGS”流程。 单击界面右侧“订阅”图标，订阅该流程。
Docker镜像是一个模板，是容器应用打包的标准格式，在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境，里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。EIHealth平台使用容器镜像服务（Software Repository for Container，简称SWR）进行简单易用、安全可靠的镜像管理。
使用RNA-Seq流程的详细步骤如下所示： 步骤1：订阅流程 步骤2：上传待分析数据 步骤3：创建分析作业 步骤4：查看执行结果 步骤1：订阅流程 使用RNA-Seq流程前，需要您在资产市场中订阅该流程。 在“资产市场”中查找“RNA-Seq Analysis Based on STAR”流程。 单击界面右侧“订阅”图标，订阅该流程。
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