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在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的，例如LAMMPS， GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持，如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例，介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令，安装FFTW软件。 yum install
提供海量、安全、高可靠、低成本的数据存储能力。 华为 >1 以华为云管理控制台显示为准。 9 镜像服务（IMS） 提供镜像（ROCE）的全生命周期管理能力，具有便捷、安全、灵活、统一的优势。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。 仿真软件STAR-CCM+安装在SFS Turbo中，其他软件安装在弹性云服务器中。
STAR-CCM+部署HPC集群流程图 本文档介绍如何通过仿真软件STAR-CCM+部署HPC集群，流程如图1所示。 图1 基于STAR-CCM+部署HPC集群流程图 父主题： 基于STAR-CCM+部署HPC集群
云硬盘（EVS） HPC场景下使用的弹性云服务器，均绑定了云硬盘。 裸金属服务器（BMS） 为用户提供专属的物理服务器，提供卓越的计算性能，满足核心应用对高性能及稳定性的需求，结合了传统托管服务器的稳定性与云中资源高度弹性的优势。 对象存储服务（OBS） 是一种基于对象的海量存储服务，为用户提
数的关键应用会采用IPoIB方式通信。 无修改：指运行在IP协议上的应用不需要作任何修改，即可适配IB网络运行。 IPoIB的通信模式有哪些 IPoIB设备能够配置为datagram和connected两种模式，前者提供不可靠的、无连接的链路，后者提供可靠的、有连接的链路。 在datagram模式下，queue
已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装Spectrum MPI。 获取IBM Spectrum MPI软件包，需要进行注册。 获取的IBM Spectrum MPI软件包有两个，包括license和软件两部分： ibm_smpi_lic_s-10.1Eval-rh7_Aug11.x86_64.rpm
向对大规模计算有需求的企事业单位，为用户提供一站式可扩展的高性能计算，同时集成基础服务、业务软件等，实现一键式开通部署等功能，支持常用作业调度软件，例如slurm、sge及华为多瑙（Huawei commercial HPC Donau Scheduler）调度器的自动化部署，使
3eval_170901-rh7_Apr11.x86_64.rpm 下载需要的HPC-X工具套件。 IBM MPI在EDR SR-IOV场景下的运行需要HPC-X提供的MXM库的支持，HPC-X 的下载需要参考弹性云服务器操作系统的版本以及IB驱动版本，例如，下载的HPC-X版本为：hpcx-v2.0.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4
常见的标准操作系统镜像，所有用户可见，包括操作系统以及预装的公共应用。请根据您的实际情况自助配置应用环境或相关软件。 选择“公共镜像”，并展开下拉框，选择所需的公共镜像。 私有镜像 用户基于弹性云服务器创建的个人镜像，仅用户自己可见。包含操作系统、预装的公共应用以及用户的私有应用。
/etc/fstab 执行mount -a 备注： 192.168.0.15:/ 是从sfs turbo console中获取到的挂载的路径。 第1个1表示备份文件系统，第2个1表示从/分区的顺序开始fsck磁盘检测，0表示不检测，_rnetdev 表示主机无法挂载直接跳过，避免无法挂载主机无法启动。
STAR-CCM+运行需要提供一个集群中所有节点均可读取的算例输入文件，通常做法是将算例文件放到NAS存储中，华为云SFS Turbo提供按需扩展的高性能文件存储，并针对HPC有优化，建议直接使用华为云SFS Turbo存放算例文件。 HPC仿真软件STAR-CCM+需要每个节点都安装，比较麻
1.1版本为例）。 对于集群中的每台BMS，都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 使用社区OpenMPI时，需要同时使用Mellanox的HPC-X 套件，适用于CentOS 7.3的HPC-X版本是“hpcx-v2
存储效率、网络带宽及时延要求有各自侧重。 HPC的应用场景 HPC提供了超高浮点计算能力解决方案，可用于解决计算密集型、海量数据处理等业务的计算需求，如科学研究、气象预报、计算模拟、军事研究、CAD/CAE、生物制药、基因测序、图像处理等，缩短需要的大量计算时间，提高计算精度。 父主题：
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI（以版本3.1.0rc2为例）。 对于集群中的每台BMS，都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动。 执行以下命令，查询是否已成功安装IB驱动。
实现远程内存访问。目前RoCE有两个协议版本，v1和v2。其中RoCE v1是一种链路层协议，允许在同一个广播域下的任意两台主机直接访问。而RoCE v2是一种Internet层协议，即可以实现路由功能。虽然RoCE协议这些好处都是基于融合以太网的特性，但是RoCE协议也可以使用在传统以太网网络或者非融合以太网络中。
需的私有镜像。 共享镜像 您将接受其他用户共享的私有镜像，作为自己的镜像进行使用。 选择“共享镜像”，并展开“镜像”的下拉框，选择所需的共享镜像。 选择“许可证类型”。 在云平台上使用操作系统或软件的许可证类型。如果您选择的镜像为免费的，则系统不会展示该参数。如果您选择的镜像为计费镜像，此时系统会展示该参数。
tar.bz2 将下载的OpenMPI压缩包拷贝至BMS内（建议在“/home/rhel”目录下）。 执行以下命令，解压软件包。 # tar -xzvf openmpi-4.0.2.tar.bz2 # cd openmpi-4.0.2 执行以下命令，安装所需要的依赖包，安装之前请确保BMS能与外网连通。
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 本节操作指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI（以版本4.0.2a1为例）。 对于集群中的每台BMS，都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动 执行以下命令，查询是否已成功安装IB驱动。
输流时内核内存空间与用户空间之间环境切换的次数。 没有CPU参与：应用程序可以访问远程内存，而不占用远程机器中的任何CPU。远程存储器将被读取，无需任何干预的远程进程(或处理器)。远程CPU中的缓存将不会被访问的内存内容填满。 基于消息的事务：数据被作为离散消息处理，而不是作为流
使计算机的结构更加简单合理地提高运行速度，相对于X86 CPU架构具有更加均衡的性能功耗比。鲲鹏的优势是高密度低功耗，可以提供更高的性价比。 选择“管理节点配置”。 规格：公有云提供了多种类型的弹性云服务器供您选择，单击下拉框查看支持的云服务器规格。 系统盘：根据所需要的选择磁盘类型和大小。
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